
cds序列
-
2023年3月17日发(作者:围墙压顶)陈其军:缩略词
AA03
aba
ABA
ABF
abi
ABRE
AREB
ATHKl
芦^lTK
卢AITLl
AlITL2
bD
bZlP
CaM
CaMK¨
CaMV
CBF
COPK
CDS
COR
CFrT
DRE
DREB
ERAl
erd
EREBP
ERK
HOS
Ins(1,3,4)P3
Ins(1,3,4,5)P4
Ins(1.3,4。5,6)P5
Ins(1,3,4,6)P4
Ins(1,4.5)P3
Ins(3,4.5,6)P4
InsP6
缩略词
Arabidopsis
aldehyde
oxidase3
ABA—deficient
abscisic
acid
ABRE—binding
factor
ABA-responsive
ABA—responsive
element
ABRE·bindingprotein
Arabidopsistwo-component
histidinekinase
Arabidopsis
inositol
1,3.4-tnsphosphate
5,6-kinase
Arabidopsis
JnosJtol
1.3.4-trisphOsphate
5,6一kinase-like
protein
1
Arabidopsis
inositol1,3,4-lrisphosphate5/6一kinase—like
protein
2
base
pairs
basicleucine
zippertype
calmodulin
Ca2+/calmodulin—dependentprotein
kinase
I|
cauliflowermosaicvirus
C·repeat-binding
factor
calcium
dependent
andcalmodulin
independentprotein
kinase
codingsequence
cold-regulated
C-repeat
dehydration—responsive
element
DRE-bindingprotein
enhanced
response
to
ABA
earlyresponsive
to
dehydration
ethylene—responsive
element
bindingprotein
e)cIracellular
regulated
kinase
High
expression
of
osmotically
sensitive
Inositol
1.3.4-tdsphosphate
InositoI
1.3,4,5-tetraphosphate
Inositol
1.3,4,5.6·pentaphOsphate
Inositol
1,3,4,6-tetraphosphate
Inositoll,4.5.trisphOsphate
InositoI
3,4.5.6-tetraphosphate
InositoI
1,2,3.4,5.6一hexaphOsphate
中国农业大学博士学位论文
IP3.InsP3
KlN
LOS
LTl
LUC
MAPk
MAPKK
MAPKKK
NECD
oR
PI—PLC
Ptdlns(4,5)P2
RD
sfr
SOS
ZEP
Ins(1.4。5)P3
cold.inducible
Low
expression
of
osmotically
sensitive
low-temperature
induced
luciferase
mitogen
activated
protein
kinases
mitogen
activated
protein
kinasekinases
mitogen
activated
protein
kinase
kinasekinases
9-cis-Epoxycarotenoid
Dioxygenase
osmotic
stress—responsivegenes
phosphoinositide-specific
phospholipase
C
phosphatidylinositol4.5-bisphosphate,PIP2
responsive
to
dehydration
sensitivity
to
freezing
salt
overly
sensitive
zeaxanthin
epoxidase
陈其军:摘要
编码1,3,4.三磷酸肌醇5/6.激酶类似物的拟南芥
基因在非生物胁迫反应中的功能分析
摘要
f植物一生中注定要停留在它发芽生根的地方,频繁地暴露于不利的环境条件中。
极端的温度,干旱和高盐极大地影响着植物的生长,发育和繁殖。为了存活,植物在
进化中逐渐形成了一个复杂的信号网络感知不断变化的环境,保护自身免受环境胁迫
的影响。了解植物感知和传导胁迫信号的机制对于理解植物对胁迫的适应和反应,从
而利用生物技术的方法对胁迫耐受性状进行遗传改良,是至关重要的。伪了逐步阐明
胁迫信号转导的机制,需要发现更多与胁迫相关的新基因和功能未知的基因并对它们
在胁迫信号转导中的作用进行研究。我们研究分析了编码I,3,4.三磷酸肌醇5/6一激酶类
似物的拟南芥基因在逆境胁迫反应中的作用。
/本研究以对照和盐处理的拟南芥幼苗为材料,利用mRNA差异显示技术筛选N-
个受盐诱导的功能未知的基因。Blast分析表明,该基因编码1,3,4.三磷酸肌醇5/6一激酶
类似物,命名为AtlTLl。根据Blast分析结合我们的实验结果,发现爿盯咒,基因的前
体mRNA有两种剪接方式,产生的两种mRNA或相应的eDNA被分别命名为AtlTLla
和彳埘咒肋。我们通过mRNA差异显示筛选到的eDNA序列为.4tlTLlaeDNA。
Blast分析还发现,拟南芥基因组中包括AtlTLl在内共有3个基因编码5/6.激酶类
似物。其中的一个基因已有文献报告其编码的蛋白具有516.激酶活性。该基因被命名
为.4tlTK。另一基因同.4tITLl一样编码5/6.激酶类似物,该基因被命名为AtlTL2。利
用RT-PCR的方法扩增并克隆了拟南芥基因组中3个编码5/6.激酶类似物基因的CDS。
其中,AtlTLIa和AtlTK基因的CDS序列与GenBank上登录的序列一致,但AtlTL2的
CDS序列与GenBank上登录的CDS序列有较大的差异。/7
对拟南芥基因组中所有3个编码5/6一激酶类似物的基因在胁迫条件下的表达进行
了Northernblot分析。结果表明,AtlTLl基因除受盐诱导外,还受低温诱导,但不受
干旱和ABA诱导;高盐、低温、干旱及ABA处理均诱导AtlTK基因的表达,干旱和
ABA对该基因的诱导强于高盐和低温;AtlTL2基因似乎不受胁迫诱导。分析推测的
AtlTLI和AtlTK基因的5’启动子区发现两者均存在不依赖于ABA的DRE/CRT顺式作
用元件,在推测的AtlTK基因的5’启动子区还存在对ABA反应的G.box和ABRE相
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关的元件。这些结果表明,编码l,3,4.三磷酸肌醇5/6.激酶类似物的拟南芥基因家族的
不同成员可能参与了依赖于ABA和(或)不依赖于ABA的胁迫信号传递途径。
/为了研究编码l,3,4一三磷酸肌醇5/6一激酶类似物的基因在胁迫反应中的生理功能,
我们分别构建了AtlTLla和AtlTK的转基因表达载体,并获得了AtlTLla超表达的转基
冈烟草和转基因拟南芥。对AtlTLla转基因烟草在胁迫条件下的表现型进行初步分析
的结果表明,转基因烟草幼苗对NaCI胁迫更加敏感。对转基因拟南芥在盐胁迫条件下
的表现型也进行了初步的功能分析,结果表明,转基因拟南芥幼苗对NaCI胁迫的耐受
性增强。
为了从分子水平探讨AtlTLl或AtlTK基因在陵塑值量佳递鲢中的地位,需要分析
爿盯死,或AtlTK基因超表达的转基因拟南芥中对其它胁迫相关基因的影响。为此目的,
我们克隆了RD29A,RD29B,RDl7,ERDIO,CORl5,COR6.6和KINl等7个胁迫诱
导基因片段。克隆的这些基因片段可作为Northern
blot分析用的探针,研究转基因拟
南芥中AtlTLla或AtlTK超表达后对这些胁迫诱导基因表达的影响。为了分析AtITLla
蛋白的生化功能以及从蛋白水平上研究这些基因在胁迫反应中的表达,我们构建了原
核表达载体并在大肠杆菌中诱导表达了AtlTLla的融合蛋白。利用融合蛋白上的组氨
酸标签分离纯化了融合蛋白并制备了相应的抗体。利用我们制各的抗体对野生型和3
个转基因烟草品系进行了Westernblot分析,结果表明,
3个转基因品系有而野生型
没有抗体抗原反应信号。说明转基因烟草中AtlTLla蛋白得到正常表达。7个胁迫相关
基因的克隆及AtITLIa蛋白抗体的获得,为深入研究一t玎z肠或AtlTK的基因功能奠
定了基础。)吖
关键词拟南芥AtlTLlAtFFL2AtlTK逆境胁迫删髓帕瑚H爿慨曲蜘喇p一‘
2
陈其军:摘要
Functional
Analysis
of
Arabidopsis
Genes
Encoding
Inositol
1,3,4一Trisphosphate
5/6一Kinase—likeProtein
in
Response
toAbioticStresses
Abstract
Destinedtoresideinthehabitatsof
germination.plantsarefrequentlyexposed
tounfavorableenvironmentalconditions.Extreme
temperature,drought.salinity
greatly
affect
plantgrowth,development,andproductivity.To
survive,plants
have
developedacomplexsignaling
networkthat
senses
and
protects
them
froman
ever-changingenvironment.Knowledge
ofthemechanisms
by
which
plantsperceive
andtransducethestress
signal
is
the
key
to
understandingadaptation
and
response
of
plants
tostressesandto
geneticimprovement
ofstresstolerance
through
biotechnology.In
orderto
clarify
the
mechanism
ofsalt-stress
signaling
in
plants,
morenovelandunknown
genes
associatedwithsalt-stress
response
should
be
foundandtheirrolesinsalt-stress
signating
shouldbeinvestigated.Wefirst
report
thatthe
genesencoding
inositol1,3,4-lrisphosphate5/6·kinase-like
proteinare
involvedinthe
response
of
plants
tostresses.
By
mRNAdifferential
display
from
controlversusNaCI·shocked
Arsbidopsis
seedlings.we
screenedanArabidopsis3’partial
cDNA.which
representsagene
encoding
inositol
1,3。4-trisphosphate
516-kinase·like
protein.According
totheresults
oftheBlast
analysis
andourexperiments。the
pre-mRNAs
oftheAtltLl
gene
have
two
splicingways.The
twokindsofmRNAorresultant
cDNA
owing
to
the
alternative
splicing
werenamedasAtlTLlaandAff丁L伯.respectively.Thepartial
cDNAscreened
by
mRNA
differential
display
inourexperimentsrepresent
the
At/TL伯cDNA.
Blast
analysis
alsofoundthat
except
AtlTLl.there
existtwoother
genes
encoding
inositol
1,3。4-tdsphosphate
5/6-kinase-like
proteins.One
ofthe
genes,
named
asAtlTK,has
been
reported
toencodeinositol1.3,4-trIsphosphate
516-kinaseandits
product
hasbeen
reported
to
have
theactivitiesofinositol
1,3.4-trisphosphate
5/6-kinase.
Another
gene,namedasAtlTL2,encode
the
3
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inositol
1。3.4-lrisphOsphate
5/6-kinase—like
proteins.
We
cloned
theCDSofthe
three
Arabidopsis
genes
encoding
inositol1.3,4-lrisphosphate516一kinase.1ike
proteinsthrough
RT-PCR.The
sequences
oftheCDSof
AtlTLlaand
AtlTK
cloned
inourexperimentsareconsistent
withthose
logged
in
theGenBanK
However,the
sequenceoftheAtlTL2clonedin
ourexperiments
is
somewhat
differentfrom
that
logged
intheGenBank.Thetatteris
the
predicted
CDS
according
tothe
genomic
DNAsequences.
We
performed
Northemblot
analysis
ofall
ofthe
three
genes.Northernblot
analysis
showedthat
expression
of—f『7_L,is
strongly
induced
by
NaCI
andlow
temperature,but
notinduced
bydrought
andabscisicacid(ABA);The
expression
of
Al|TKisinduced
by
allthe
stressconditionstestedandinduced
more
stronglyby
drought
and
ABAthan
by
NaCIand
cold;The
expression
ofthe芦^ITL2
appeared
not
tobeinduced
by
thestressconditions
tested.Analysis
of
the
predicted5’promoter
region
ofthe
AH7t7foundthat
thereareDRE/CRT
fdehydration-responsive
element/C-repeat)cis-actingelements。butnoelements
relatedtoG—boxandABRE
(ABA-responsive
element)inits
5’region.Analysis
ofthe
predicted5’promoter
region
oftheAf『7Xfoundthatthereare
oneDRE/CRT
elementandtwoG.boxand
ABRE-relatedelements.Theseresults
suggest
that
inositol
1。3。4-tdsphosphate
516-kinaseorits
analogsmay
be
involvedintheosmoticstress
response
in
Arabidopsis
instress
signaling
pathwaysdependentonand/or
independentof
abscisicacid.
Inorderto
analyze
thefunctionofthe
genes
encoding
inositol
1.3,4-trisphos—
phate
5/6一kinase—like
proteins.we
constructed
the
transgenic
expressing
vectors
using
theCDSoftheAtITLland
theAtITK
genes。respectively。and
firstlygenerated
the
transgenic
tobaccoand
Arabidopsisover-expressing
theAⅣ7_L7
genes
The
transgenic
tobacco
seedlings
are
more
sensitivetosaltstressthanwildtypes.while
the
transgenic
Arabidopsisaremoretoleranttosalt
tress.
TounderstandtheroleofAUTLl
orAtlTKin
stress
signaltransduction,it's
necessary
to
analyze
the
effectsoftheAUTLlOr^“7X
over-expressed
in
transgenic
Arabidopsison
otherstress
inducible
genes.For
this
purpose,we
cloned
seven
4
陈其军:摘要
whichcanbe
usedinNorthernblot
analysis.In
orderto
analyze
thebiochemical
function
ofAtlTLlandthe
expressionprofiles
ofAtlTLlat
protein
levelunder
stress
conditions.we
constructedthe
protokaryoticexpressionvectorsofA{lTHandAllTK
genes
and
recombinantlyexpressed
theAllTLlaasfusion
proteins.The
fusion
proteinsarepunfied
andusedto
prepareantibod矿The
threelinesof
transgenic
tobaccoshave
immunoreaction
signals,but
thewild
type
tobaccohasnosignal
in
Westernblot
analysisusing
the
antibody.Thesevenfragments
ofstress—inducible
genes
cloned
andthe
antibodyprepared
will
beusedinfurtherfunctional
analysis
of
theAf『7-L,.
Key
words:Arabidopsis,AtlTLl,AtlTL2,AtlTK,abiotic
stresses,DRE/CRT,
G.box/ABRE
5
陈其军:文献综述
第一章文献综述
逆境信息传递研究进展
植物一生中注定要停留在它发芽生根的地方,频繁地暴露于不利的环境条件中。
极端的温度,干旱和高盐极大地影响着植物的生长,发育和繁殖。为了存活,植物在
进化中逐渐形成了一个复杂的信号网络感知不断变化的环境,保护植物免受环境胁迫
的影响1’2j一。了解植物感知和传导胁迫信号的机制对于理解植物对胁迫的适应和反应,
从而利用生物技术的方法对胁迫耐受性状进行遗传改良,是至关重要的。
1ABA依赖的和ABA不依赖的渗透或低温胁迫信号传递途径
1.1ABA依赖的的胁迫信号传递途径
植物在对缺水和高盐条件引发的渗透胁迫反应中,许多基因的表达发生改变5,6t7,8。
其中的一些渗透胁迫反应基因(osmotic
stress.responsivegenes,OR)也能被低温胁迫
所诱导9’lo’l‘。植物激素ABA在植物对非生物胁迫反应中发挥着重要的作用。作为五大
类植物激素之一,ABA除了参与调节植物的生长发育,如胚形成,种子休眠,茎和根
的生长以及叶片的蒸腾作用,也是植物对非生物胁迫反应的一个重要调节剂2,5,12,13e
ABA参与非生物胁迫表现在两个方面:一方面,在低温,干旱和盐胁迫条件下,植物
积累更多的ABA,其中,干旱胁迫条件下,ABA的积累最显著。另一方面,许多胁迫
反应基因的表达能够被外源ABA所诱导,在ABA合成或反应缺陷突变体植物中,环
境胁迫对这些基因表达的诱导性降低2,5,60
最近几年,ABA参与胁迫信号转导的研究进展很快,这些研究主要集中在以下几
个方面:通过利用M3A的合成缺陷突变体或通过基因同源性比较克隆与ABA合成与
代谢有关的基因,进而分析这些基因在胁迫信号转导中的作用;通过利用细胞学以及
分子遗传学的方法研究ABA介导的胁迫信号转导链的其它组分。
高等植物ABA来源于C40-类胡萝h素,C40.类胡萝h素(玉米黄质)在玉米黄质
环氧酶(zeaxanthin
epoxidase,ZEP)的作用下产生全反式紫黄质(all-trans-violaxanthin),
ZEP基因已经从烟草aba2和拟南芥abal突变体中克隆“。全反式紫黄质是叶黄素
(xanthophyll)的一个异构体,叶黄素的另外三个异构体分别是9一顺式.紫黄质(9_cis.
violaxanthin),全反式新黄质(all-trans—neoxanthin)和9一顺式.新黄质(9.cis-neoxanthin),
在ABA合成途径中,叶黄素的其它三个异构体通过异构化作用转化为9.顺式.新黄质,
编码黄氧素合成酶的基因已经从马铃薯”和番茄”中克隆出来。9.顺式.新黄质在9.顺式
7
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-环氧类胡萝I-素双氧酶(9·cis·EpoxycamtenoidDioxygcnase,NECD)的作用下断裂为
黄氧索和C_25类胡萝b索衍生物(C.25
cpocarotcnoids),目前认为这一步骤是ABA合
成的关键的调控步骤或限速步骤”。编码NECD的基因最先从玉米ABA缺陷型突变体
vpl4中得到克隆”。随后从大豆”瑚,番茄”,豇豆”,鳄梨23和拟南芥24中克隆到NECD
基因。ABA生物合成的最后两个步骤是:黄氧素(xanthoxin)转化为ABA醛,ABA
醛在ABA醛氧化酶的作用下形成ABA。ABA2基因编码的产物在黄氧素转化为ABA
醛的反应步骤中起作用,目前该基因尚未得到克隆。最近从拟南芥中克隆到了ABA醛
氧化酶基因AA03”’26。
植物激素突变体可分为合成型突变体和应答型突变体。前者又可分为缺陷型突变
体和过量产生某种植物激素的突变体:或者根据突变体对植物激素的敏感性又可分为
不敏感型突变体和组成应答型突变体。有些资料将合成型突变体和组成应答型突变体
通称为组成型突变体。ABA对种子萌发具有抑制效应,据此筛选出ABA合成缺陷或
对ABA的反应性改变的突变体27,28.29.30。例如,拟南芥ABA合成缺陷突变体面口J,如n2
和曲订,烟草ABA合成缺陷型突变体abal和aba2,玉米ABA合成缺陷型突变体vpl4,
拟南芥ABA不敏感型突变体abf』~5等。
传统的遗传学筛选突变体的方法是通过突变体的表型来筛选,如abal,口6口2,口妇3
突变体的筛选是根据种子萌发特性进行筛选,sosl31,sos232,sos3”,sos4“突变体是根
据弯根实验来筛选。朱健康实验室在研究逆境胁迫信号转导过程中建立的另一套遗传
筛选系统是通过报告基因筛选突变体。。其原理是:将萤火虫发光蛋白基因LUC与
RD29A启动子融合转入拟南芥得到RD29A-LUC转基因植株,以纯合的转基因拟南芥
品系代替野生型拟南芥,经EMS诱变处理的M2代种子用于筛选突变体。由于RD29A
启动子特异性地受干旱、高盐和低温胁迫以及ABA诱导,正常生长条件下LUC基因
不表达,在干旱、高盐和低温胁迫条件下以及用外源ABA处理时,LUC基因表达,
町以检测到萤火虫发光蛋白的发光信号。当逆境胁迫以及ABA信号传递链中的基因发
生突变时,突变体的LUC基因的表达模式在胁迫或正常条件下将发生改变,根据LUC
甾白的发光情况町以分离相应的突变体。利用这套筛选系统筛选得到的突变体包括:
Ios5/aba3”,los6/abal”,FieryI”,hosl38舯,hos540,hos2‘I等。
利用上述筛选系统筛选的los5突变体,其RD29A-LUC基因在低温、高盐和干旱
条件下的表达量降低,而对外源ABA的反应性没有发生改变。Northernblot分析表明,
几个受胁迫诱导的基因(RD29A,CORl5,COR47,RD22和PSCS)在los5突变体中
8
陈其军:文献综述
对低温的反应性降低,对渗透胁迫的反应大大降低甚至完全丧失。los5突变体植株对
冷冻、高盐和干早胁迫的耐受性降低。los5突变体表现出ABA合成缺陷的性状,如蒸
腾作用增强,水分丧失加剧,突变体在干旱条件下积累的ABA低于野生型。遗传分析
表明,los5突变体与aba3突变体在遗传上是等位的。LOSS/ABA3编码钼辅因子
(Molybdenumcofactor,MoCo)硫化酶(sulfuryase,sulfurase),该酶催化形成硫化
(sulfurylated)的MoCo,后者为ABA.醛氧化酶(aidebydeoxidase,AO)所必需,
ABA.AO催化ABA合成的最后一步反应,即氧化ABA一醛最终形成ABA。LOSS/ABA3
在植物的不同部位均有表达,其表达受干旱、高盐和ABA诱导,但不受低温诱导。
LOS5/ABA3基因的启动子区域含有ABRE和DRE/CRT相关的元件。LOS5/ABA3受
ABA升调节,可能表明ABA的合成受ABA的正反馈调节。这些研究表明,LOS5/ABA3
在ABA生物合成的最后步骤起着重要的调控作用。此外,也证明了ABA在胁迫反应
基因的表达以及胁迫耐受性中起着重要的调控作用35oLOS5/ABA3不受低温诱导,这
与内源ABA生物合成较小程度地受低温影响是一致的4,35,42*los5/aba3突变体中
RD29A-LUC报告基因在低温胁迫条件下的诱导表达水平大大低于野生型植物,在低温
胁迫处理的同时用ABA处理不能将突变体中RD29A—LUC报告基因的表达水平恢复到
野生型,说明los5/aba3突变体在低温胁迫条件下基因的诱导表达水平大大低于野生型
植物不是由于ABA的生物合成缺陷造成的。另一个突变体los6在渗透胁迫条件下,
其RD29A-LUC报告基因在渗透胁迫条件下的表达量降低。Northernblot分析表明,与
野生型相比,los6突变体中几个受胁迫诱导的基因(兄D2鲥,cD尺J鲥,KINl,COR47,
RDl9和ADH)在渗透胁迫条件下表达量降低,且los6突变体内源ABA含量降低。遗
传分析表明,los6与ABA合成缺陷突变体曲甜在遗传上是等位的。如前所述,
LOS6/ABAl编码玉米黄质环氧酶,在ABA合成的早期步骤中起作用。LOS6/ABAl基
因的表达受渗透胁迫诱导。同LOSS/ABA3以及ABA合成途径的其它基因(如AA03
和NCED3)一样,LOS6/ABAl基因的表达也受ABA升调节,再次表明ABA的合成
受ABA的正反馈调节。在ABA缺陷突变体中,这些参与ABA合成的基因对渗透胁
迫的反应性大大降低,这可能是由于渗透胁迫不能诱导ABA的合成,导致ABA对其
它参与ABA合成的基因的反馈调节作用被阻断的缘故。LOS61ABAl超表达的转基因植
株其RD29A-LUC报告基因在渗透胁迫条件下表达增强。这些结果表明渗透胁迫诱导
基因的表达水平依赖于玉米黄质环氧酶的剂量。同时也再次表明ABA对胁迫反应基因
的表达起着重要的调控作用”。
9
中国农业大学博士学位论文
大豆在受到水分胁迫时,其PvNCEDl基因的mRNA水平以及蛋白水平强烈地升
高,这一过程发生在ABA含量升高之前”瑚。番茄”,豇豆”,鳄梨23的NCED基因
也存在类似的情况。番茄LeNCEDl基因超表达的转基因烟草,其叶片中的ABA的含
量提高”。将大豆的PvNCEDl基因导入烟草,无论以组成性超表达还是在地塞米松
(DEX)诱导的启动子驱动下诱导性超表达,都可以导致ABA及其代谢物红花菜豆酸
(phas£ic
acid,PA)含量的增高。PvNCEDI基因超表达的转基因植物,种子发芽延迟,
叶片的水分丧失速度大大减缓,植物对干旱胁迫的耐受性增强。对拟南芥AtNCED3基
因超表达的转基因拟南芥植物的研究也得到类似的结果:内源ABA的含量提高,干旱
和ABA诱导的基因转录水平增强,植物叶片的蒸腾速率减缓,对干旱胁迫的耐受性增
强“。相反,反义AtNCED3基因的转基因拟南芥植物以及AtNCED3基因被T-DNA
插入失活的敲除突变体,内源ABA的含量降低,植物叶片的蒸腾速率增强。这些结果
表明,通过ABA合成中的关键的调控基因超表达操纵植物体内ABA的水平进而改善
胁迫耐受性是可行的。
调控ABA和(或)胁迫反应基因表达的ABA反应元件(ABA-msponsiveelements,
ABREs)在很多研究中得到鉴定“-锄147。最为广泛存在的一类ABRE顺式作用元件的
共有序列是(C厂r)ACGTGGC,其中许多序列包括G-box序列(CACGTG),后者存在
于其它许多受环境因子调控的基因中”。另一类ABREs元件,称为耦合元件(coupling
element),he)【3或motifUI,其共有的核心序列为CGCGTG。与ABREs元件结合的
许多反式作用因子得到分离,这些反式作用因子及其同源物和其它许多G-box结合因
子都属于基本亮氨酸拉链类型(basicleucinezippertype,bZIP)的蛋白”。
拟南芥脱水反应基因RD29B的表达主要受ABA介导。RD29B启动子分析表明,
两个ABA.反应元件(ABA-responsive
elements,ABREs)是RD29B基因受脱水诱导表
达的顺式作用元件。利用酵母单杂交的方法筛选到三个编码bZIP类的ABRE结合蛋白,
分别命名为AREBl,AREB2和AREB3。营养组织中的AREBl和AREB2基因的转录
水平受干旱,NaCI和ABA处理升调节。在利用拟南芥叶原生质体进行的瞬时反式激
活实验中,AREBI和AREB2蛋白激活了由ABRE驱动的报告基因的转录。AREBl
和AREB2在激活报告基因转录过程中需要ABA,因为它们的转录活性在ABA缺陷型
突变体口6以和abil中降低,而在ABA超敏感突变体eral中增强。ABA在激活AREBs
转录因子过程中受蛋白激酶抑制剂抑制,以拟南芥培养细胞为材料进行的研究发现
AREB蛋白的N端保守区域受一个42.KD的蛋白激酶磷酸化,后者特异性地受ABA
10
陈其军:文献综述
激活。这些结果说明AREBI和AREB2在ABA诱导RD29B表达过程中起转录激活因
子的作用,而且AREBl和AREB2转录因子的转录后激活是ABA依赖的”。
上述工作是日本Shinzaki实验室的工作,韩国的Kim实验室也利用酵母单杂交系
统分离了4个结合ABRE的bzIP转录因子,命名为ABFI~ABF4,这些bZIP转录因
子受ABA和胁迫诱导,在酵母中能激活受ABRE驱动的报告基因。不同于其它结合
ABRE元件的bZIP转录因子,ABFs能够同时与G.box类的ABREs和包含CGCGTG
序列的ABREs相互作用。其中的ABF2和ABF4基因就是上述的ARBFI和ARBF2基
冈”。Kim实验室随后进一步对这些转录因子在植物体内的功能进行了研究。结果表明,
ABF3和ABF4转基因品系对ABA非常敏感,转基因植株的种子萌发延迟,在含ABA
的介质中转基因种子萌发及根生长受到抑制。转基因植物也表现出其它方面的与ABA
信号转导有关的现象。例如,在含100mMNaCI的生长介质中,转基因与野生型及ABA
敏感性突变体相比,其种子的萌发及生长受抑制。最近的研究表明,ABA参与葡萄糖
和蔗糖的信号转导”,53一,例如糖不敏感型突变体sis4与ABA缺陷型突变体n6aL2在遗
传上是等位的。ABF转基因植物在含3%葡萄糖的介质中生长发育出现严重障碍,而野
生型能够正常生长。最近的研究表明ABA信号转导途径和乙烯的信号转导途径相互作
用。例如,ABA介导的对种子萌发的抑制作用受乙烯负调控,ABA对根生长的抑制作
用需要乙烯信号转导途径中的组分。有研究表明,生长素参与ABA依赖的胁迫反应。
当对植物进行渐进性的干旱处理时,新的侧生根短而结节(tuberized)。这种早生根的
过程不仅在abal和abal.J突变体中而且在抗生长素突变体axrl.3中受到破坏。尽管
用乙烯前体1.氨基环丙烷.1-羧酸和吲哚-3.乙酸处理野生型和ABF转基因植物,没有看
到生长上的不同。但ABF4转基因植物的叶片出现偏上性弯曲的趋势。而偏上性生长
一般认为是乙烯的作用.并且,ABF4转基因植物的根生长特性发生改变,即根生长的
接触障碍物反应(obstacle-touching
response)受到抑制。已知上述反应涉及到生长信
号转导途径中的组分。这些结果表明,ABF4的超表达影响了乙烯和生长素反应的一些
方面。转基因植物中ABA及胁迫反应基因的表达发生改变,表明ABF3和ABF4在植
物体内作为转录调控因子发挥作用.在水分胁迫条件下,一个重要的ABA调控过程是
气孔关闭。ABA缺陷型突变体和敏感型突变体容易遭受干旱胁迫的原因就是因为这些
突变体对气孔的调节作用受到破坏舒挪。ABF3和ABF4基因在干旱条件下气孔开放程
度和蒸腾速率低于野生型,对干旱胁迫的耐受性增强。这些结果从植物体内实验证明
了的转录因子ABF3和ABF4参与了胁迫反应的ABA信号转导”。
中国农业大学博士学位论文
一{
l
驾一掣l÷一j
\l—i.j
II
图1·1ABI在ABA信号传递中两种可能的作用模式.
(A)ABI蛋白的催化活性不受A8A调控.ABACa"号的感受刺激信号转导级联途径.导致生理反应
的激活.ABll磷酸酶通过去磷酸/I]M,BA信号传递链中的某个蛋白组分减弱信号转导级联反应.
在回复突变体ab/1-1RI(从abll-lRl到ab/1—1R7)中,ABtl
PP2C活性丧失(圈中以X号表示)
导致ABA反应性增强.ABA诱导的ABII
mRNA,水平增高启动了负反馈调节机制(图中以点线表
示).
(B)ABA抑制了ABI蛋白的催化活性.ABA或ABA衍生的信号抑制ABll的PP2C活性。从而
解除ABI磷酸酶活性对ABA反应通路的抑制作用,触发了生理反应.在回复突变体中,ABll
的PP2C活性丧失(图中以X号衰示)导致ABA反应性增强.ABA诱导的舶盯mRNA水平
增高启动了负反馈调节机制(图中以点线表示).
ABH和ABl2基因编码的蛋白是同源的,属于丝氨酸,苏氨酸蛋白磷酸酯酶的2c家
族(PP2Cs)”,71,723州·”。迄今只得到ABll和ABl2基因的两种突变体:abil.J和abi2一』。
这两个突变体都是显性的,突变位点发生在PP2C结构域的相应位置,都是相同的氨
12
陈其军t文献综述
基酸被取代71,75
o这两个突变体的表型大体是重叠的:种子萌发和幼苗生长对ABA的
反应性改变,种子的休眠时间缩短,气孔调节不正常,对干旱胁迫的反应性存在缺陷
58,63,7136,77o然而,不能仅仅根据显性突变体的功能来理解ABII和ABl2磷酸酶的功能。
首先,不能确定这些蛋白是否参与ABA的信号传递。因为存在这种可能的情况:野生
型的ABII和ABl2不能正常地参与ABA信号转导,只有获得功能的ABll和ABl2蛋
白突变体才能阻碍ABA反应。其次,即使野生型的ABll和ABl2是ABA信号转导链
中的组分,那么这些蛋白是ABA反应的正调控因子还是负调控因子?由于突变体的显
性性质使我们不容易得出这一问题的结论。利用药理学的方法研究PP2C蛋白是否参
与ABA信号转导并不可行,因为尚未发现这一类磷酸酶蛋白的抑制剂。为了阐明丘唧
和ABl2基因在ABA信号转导中的作用,需要得到隐性的失去功能的突变体,并通过
其功能分析最终搞清除这些基因的功能,筛选经EMS诱变处理的abil.』突变体的种子,
分离出7个失去了ABll基因功能的隐性突变体,这7个失去功能的突变体是abil.J突
变体的基网内回复突变体(intragenie
revertants)。这些基因内回复突变体对ABA的
反应比野生型植物更敏感,并且对ABA超敏感的表型是隐性的。所有这些回复突变体
基因编码的蛋白在体外酶活分析中检测不到磷酸酶活性。这些遗传学上的证据表明,
失去ABIIPP2C活性导致植物对ABA的反应增强,因此,野生型ABll磷酸酶是ABA
反应的负调控因子(图1.1)78,790
1.2ABA不依赖的胁迫信号传递途径
如上所述,Ol国§因在胁迫条件下的诱导表达受ABA的调控,但研究也发现一些OR
基因的表达不受ABA的调控9。首先,一些OR基因的表达不受外源ABA的诱导”,其次
那些受外源ABA诱导的O噬因对渗透胁迫的反应也可能不依赖于内源ABA。例如,尽
管RD29A基因能够被外源ABA所诱导,但在ABA合成缺陷突变体abal中渗透胁迫仍能
诱导其表达q“'。2。日本Shinozaki研究组利用差示筛选的方法从干旱处理的模式植物拟
南芥中克隆了一批受干旱诱导的基因,定名为RD(responsivetOdehydtration)基因。
其中,RD29A基因的表达不仅受干旱、高盐胁迫的诱导,也受低温胁迫的诱导。对其
启动子进行了分析,发现一个受干旱、高盐和低温胁迫应答有关的DRE顺式作用元件
(序列为TACCGACAT)。此外,RD29A基因的表达也受外源ABA诱导,但是,删去该
启动子区域中的ABA应答元件ABRE,保留DRE元件,同样也能使兄D2鲥基因在干旱、
高盐或低温胁迫条件下被快速诱导表达,说明RD29A基因在上述胁迫条件下的快速表
达不依赖于细胞内ABA的作用。RD29A启动子中含有2个DREI顿式作用元件,核心序列
中国农业大学博士学位论文
为CCGAC”。Thomashow研究组最初在研究拟南芥冷适应过程中鉴定y4个COR基因,
即COR6.6,CORl5a,COR47和COR78。其中的COR47和COR78分别是后来日本Shinozaki
研究组利用差示筛选的方法筛选得到的RDl7和RD29A。分析CORl5a基因的启动子,
发现了与DRE元件极为相似的序列--TGGCCGAC,称为CRT(C-repeat)元件“。在一
些同样受干旱、高盐或低温诱导的拟南芥基因如RDl7,KINl,coRa6基因的启动子中,
也发现有DRE元件或DRE核心序列的元件”一。此外,DRE元件的核心序歹IJCCGAC在
低温诱导的甘蓝型油菜的BNIl5基因启动子区域中也存在,称为LTRE元件”(10w
temperatureresponsive
element)。Thomasho、v研究组利用酵母单杂交的方法首先首先分
离了与DRE/CRT元件结合的转录因子的基因,命名为CBFl(CRT-bindingfactorI)88。
后来,该研究小组又分离了c丑川的另外两个同源物CBF2和CBF3”。Shinozaki研究组
几乎与Thomashow实验组同时分离了与DRE/CRT元件结合的转录因子的5个基因,命名
为DREBs(DR.E-bindingprotein)90.这5个基因同样是利用酵母单杂交的方法分别从低
温处理和干早处理的拟南芥eDNA文库中克隆到的。从低温处理的拟南芥eDNA文库中
克隆了3个基因,分别命名为DREBIA,DREBIB,DREBIC;从干旱处理的拟南芥cDNA
文库中克隆了2个基因,分别命名为DREB2A,DREB2B。其中,DREBlA与CBF3,DREBIB
与CBFI,DREBIC与CBF2是同一基因。3个基因按DP隰BIB/CBFI,DREBIA/CBF3和£)兄髓』c/蚴的顺序在4号染色体上串连排列,氨基酸的同源性在85%以上。DREBl
和DREB2基因之间除了都具有保守的AP2/EREBP结构域,没有明显的序列同源性。已
知AP2和EREBP结构域9啪存在于APETALA2和EBEBP蛋白中,前者在花形态建成中起
作用,后者在乙烯反应中起作用。DKEBl和2蛋白特异性地与DRE/CRT元件结合,在
酵母及拟南芥原生质体中都能激活I扫DRE/CRT元件驱动的报告基因的表达。DREBl基
因受低温诱导,DREB2基因受干旱或高盐诱导”。这些研究表明,拟南芥中存在两个独
立的DREB转录因子家族,分别参与了低温和渗透胁迫反应的信号传递途径。DREBIA
超表达的转基因拟南芥在非胁迫条件下诱导RD29A等靶基因的强表达,植物的抗冻性
和耐旱性增强90,”一。Thomashow研究组也得到类似的结果:CBFl/DREBIB或
CBF2/DREBlC或CBF3/DREBIA基因超表达在非胁迫条件下诱导了COR基因如
COR66,CORl5a,COR47/RDl7tiOCOR78/RD29A基因的表达,转基因植物的抗冻性提
高96·97,”。
以RD29A/COR78/LTl78基因的诱导表达为例,ABA依赖的和ABA不依赖的胁迫信
号传递途径可以概括为图l-2”。
14
陈其军:文献综述
Signalperception
Transduction
Transcription
Transfactors
RD29A
promoter
Ciselements
Low
temperatureDehydration罗。弋
7弋~A
/弋
\坚!!/
图1-2ABA依赖的和ABA不依赖的胁迫信号传递途径”
两个顺式作用元件DRE/CRT和ABRE分别参与ABA依赖的和ABA不依赖的RD29A基因的诱
导。两种不同的DRE/CRT结合蛋白DREBI/CBF和DREB2分别参与冷胁迫和渗透胁迫信号传递途
径.ABRE元件的结合蛋白为bZIP转录因子,如ABF/ARBF.开放式箭头表示ABA依赖的信号转
导途径;封闭式箭头表示ABA不依赣的信号转导途径。其中.实线部分代表渗透胁迫反应途径,虚
线代表低温胁迫反应途径.
近年来。分子遗传学的研究大大丰富了胁迫信号传递途径的知识。如上所述,ABA
合成缺陷型突变体和反应缺陷型突变体为研究ABA参与胁迫信号传递途径提供了很
好的材料。ABA不依赖的胁迫信号传递途径中也发现了一些突变体,这些突变体的发
现和研究加深了人们对ABA不依赖的胁迫信号传递途径的了解(图1—3)。这些突变体
包括hosl,hos2,hos5,sfr6,
eskl等。
eskl即eskimol突变体是组成性抗冻的突变体。在未进行冷适应(coldacelimatiza-
tion)的情况下,eskl突变体的抗冻性强于野生型植物。eskl耐受低温胁迫的分子机制
还不清楚。研究发现,eskl突变体积累更多的脯氨酸…。已知脯氨酸可以在渗透保护,
活性氧的清除以及蛋白和核酸的保护方面起作用。脯氨酸脱氢酶反义cDNA超表达的
转基因拟南芥抗冻及耐盐性均大大增强”1。esM突变体中CORl5a,RDl7/COR47,
RD29A/COR78基因的表达不受影响,说明ESKI基因在不同于这些基因的信号传递系
]rvrvrv三一;v—lv叩;v—一
中国农业大学博士学位论文
统中起作用。
Signal
pemeptmn
Signal
transduction
Transduetion
factor
Ciselement
Gcne
expression
图I-3胁迫信号转导的几个途径”
围中,以逆境胁迫诱导基因ERDI.RD22,RD29B,RD29A和CORISa为例来说明拟南芥中
至少存在6条胁迫信号传递途径.其中2个(b和c)是ABA依赖的,4个(^,d,c.f)是ABA
不依赖的.口ba,abil/2,eral,hos5,sfr6,hoM.hos2,eskl是参与逆境胁迫信号传递的一些突
变体。实线代表渗透胁迫反应途径,虚线代表低温胁迫反应途径.封闭式箭头和开放式箭头分别
表示主要的和次要的胁迫信号转导途径.
在hos5突变体中,RD29A基因在渗透胁迫条件下的表达增强,但在低温胁迫条件
下的表达未受影响。因为渗透胁迫诱导ABA的合成,对ABA的过敏感理论上能导致
对渗透胁迫反应的过敏感。hos5突变体对渗透胁迫和ABA的敏感性均增强,那么hos5
突变体对渗透胁迫的敏感性是否是由于对ABA的敏感性增强造成呢?通过分析box5
曲口J和hos5abil双突变体排除了这种可能.如果hos5突变体对渗透胁迫的敏感性是
由于对ABA的敏感性增强造成的,那么ABA合成发生缺陷的hos5
abal双突变体对
渗透胁迫的反应的敏感性应该大大降低。而实际上hos5
abal双突变体对ABA和高盐
的反应均类似于hos5突变体。hos5
abil双突变体对高盐的反应也类似于hos5突变体。
hos5突变体对ABA和渗透胁迫同时处理表现出的反应是加和性。这些研究表明,hos5
16
陈其军;文献综述
突变体对渗透胁迫的敏感性不是由于对ABA的敏感性增强造成,换句话说,是ABA
不依赖的。因此,HOS5在ABA不依赖的渗透胁迫信号传递中以及在ABA信号传递
途径的下游充当负调控因子”。
驴(sensitivitytofreezing)突变体是对冷冻敏感的拟南芥突变体。驴突变体在冷
适应后表现出对冷冻的过敏感性。这些突变体相应的基因SFR为冷冻抗性所必需-oz。
其中的spa突变体中冷诱导基因KINl,CORISa,上玎7们。尺怒‘碰)2鲥在冷胁迫条件
下的诱导表达几乎完全被抑制,在渗透胁迫以及ABA处理的条件下,这些基因在spa
突变体中的诱导表达也受到一定程度的抑制。已知这些基因的启动子区都含有
CRT/DRE元件。启动子缺乏CRT/DRE元件的冷诱导基因CBFl,CBF2,CBF3和
ATP5CSI在低温胁迫条件下的诱导表达未受影响。这些研究表明,SFR6增强了CBF
转录因子的作用”。
图I-4HOSI的作用模式”
HOSl在低温胁迫条件下负
调控许多胁迫反应基因的表达。
HOSI也可以在渗透胁迫条件下
正调控某些基因的表达.
hosl.,突变体也表现出对低温的敏感性。但不同于上述的sfr6突变体,在突变体
hosl.J中渗透胁迫及冷胁迫反应基因,如RD29A,COR47,CORISA,KINl和ADH,
在冷胁迫条件下表现出超诱导(superinduction)表达,但在渗透胁迫及ABA处理条件
下,没有出现这种现象。hosl.J突变体中的LUC报告基因能在高达19"(2的条件下被诱
导,而野生型植物在高于lO℃条件下LUC报告基因便不能表达。hosl.,突变体耐寒
性比野生型差。然而,在2天的冷适应后,突变体和野生型表现出相同程度的耐冻性。
hosl.,突变体还表现出早开花的特性,推测hosl.』突变体可能在正常的生长温度下经
历了春化作用。这些结果表明,HOSI在低温胁迫信号转导途径中是一个重要的负调控
因子,在负调控低温胁迫条件下的基因表达,提高冷冻耐受性及控制开花时间等方面
发挥重要作用(图1.4)。此外,HOSl在渗透胁迫和ABA处理条件下正调控RABl8,
17
中国农业大学博士学位论文
RD29B.CORl5A和KINl的表达”。
图l-5
HOSI在低温胁迫信号
传递途径中的作用及对春化作
用的调控“‘
H0s1负调控CBF/DREBl
转录因子以及正调控开花抑制
基因FLC的表达.
HOSl基因已被克隆,它编码的蛋白在靠近N末端有一个RING
finger结构域。利
朋HOSl-GFP融合蛋白技术研究发现在正常生长条件下HOSl蛋白定位于细胞质,在
低温胁迫条件下HOSl蛋白积累于细胞核中。在野生型植物中异位表达HOSl基因导
致HOSI基因表达的共抑制,转基因植物的表现型与hosl突变体的表现型相似”。一
些Ring·finger蛋白可以作为遍在蛋白E3连接酶(ubiquitinE3ligases),在特异降解靶
蛋白方面发挥作用。HOSl可能通过将CBF转录因子标记为降解的靶目标而起作用(图
I.5)。
在hos2突变体(包括hos2·』,hos2—2和hos2.3)中,RD29A和其它胁遮反应基因
在低温胁迫条件下的表达强于野生型,在渗透胁迫及ABA处理条件下的表达类似于野
生型。当用非冷冻的低温处理时hos2.J突变体耐冻性弱于野生型。与hosl突变体相比,
hos2一,突变体的春化反应未受影响。这些结果表明HOS2是冷适应过程中低温信号传
递途径中的负调控因子”。
1.3交叉转导作用
近年来,从植物感受胁迫刺激到最后作出生理反应,细胞信号转导过程的研究取
得了很大的进展。随着研究的深入,人们发现的目前研究的线性的细胞信号转导过程
只不过是复杂信号传递网络的一部分,这个信号网络的许多分支之间相互交错,例如
许多基因受一种以上的刺激所诱导。任何一个线性的信号传递途径都包括特异性
(Specificity)和交叉转导(cross-talk)两个方面。信号传递途径的特异性是指信号传
递链中的组分能够将这些组分所在的信号传递途径与其它信号传递途径区分开来的现
象。特异的信号传递链的组分能将一个特定的刺激与特定的终端反应联系起来。交叉
8
陈其军:文献综述
转导作用是指来自不同刺激的两个信号传递途径交叉会聚的现象…。两个信号传递途
径可以通过交叉转导作用获得相同的终端反应,也可以通过交叉转导作用相互作用和
影响最终的结果,包括加和作用和负调控作用等。
图1-6ABA依赖的和ABA
不依赖的胁迫信号传递途径之
间的交叉转导作用2
各类突变体相应的基因产
物被放在信号传递途径中的推
测的位置处.ABA依赖的和
ABA不依赖的信号传递途径相
互作用并最后会聚到一处,激
活RD29A基因和其它OR基因
的转录.虚线表示那些本身不
足以激活OR基因转录的信号
传递途径。
RD29A,K.INI和COR47基因既含有ABRE又含有DRE/CRT元件,在缺乏ABA
的情况下这些基因能通过ABA不依赖的途径受渗透胁迫诱导。在ABA合成缺陷型突
变体Ios6/abal及ABA不敏感型突变体abi中确实如此4‘105。但los5/aba3突变体却存
在不同的情况。在los5突变体中渗透胁迫对RD29A-LUC的诱导表达几乎完全受到抑
制。Northernblot分析表明,IosSlaba3突变体的CORl5,KINl,RD22,PSCS和RABl8
基因在高盐和干旱胁迫条件下的表达受到抑制,RD29A,COR47和ADH基因在这些
胁迫条件下的诱导表达受到严重影响。在盐胁迫处理的同时用ABA处理发现,
los5/aba3突变体植株中的RD29A-LUC表达恢复到野生型的水平。这说明上述渗透胁
追诱导基因的反应性发生缺陷的确是由于ABA的合成缺陷造成的。尽管不能完全排除
这种可能性:LOS5/ABA3不是通过ABA的生物合成而是通过其它方式影响ABA不依
赖的渗透胁迫信号传递途径,但至少los5突变体的研究结果对ABA不依赖的胁迫信
号传递途径是否完全不依赖于ABA提出了疑问。尽管losS/abed突变体对盐胁迫诱导
的DREB2A基因的表达没有影响,但DREB2A的活性可能受ABA依赖的因子调控,
进而激活下游基因的表达”。以前的研究表明,DREB2A基因的异位表达不能激活下
19
中国农业大学博士学位论文
游基因的表达,推测其需要转录后修饰方能激活下游胁迫诱导基因的表达”。有可能
DREB2A的磷酸化和去磷酸化作用或其辅因子的活性依赖于受ABA调控的分子,例如
ABH/2,CDPK或其它很多ABA反应调控因子”。以前的一些研究也表明ABA依赖
的和ABA不依赖的胁迫信号传递途径彼此不是完全独立的,在两条信号传递途径之间
存在广泛的联系和相互作用。如前所述,朱健康实验室建立了通过RD29A.LUC报告基
因筛选突变体的系统8。利用这套筛选系统,筛选了很多渗透胁迫基因的表达发生改变
的各类突变体,包括c∞(constitutive
expression
of
osmotically
responsivegenes)。los
(10w
expression
ofosmotically
responsivegenes)和hos(high
expression
ofosmotically
responsivegenes)。其中,根据在各种不同的胁迫及ABA处理条件下突变体的表型可
将z∞和hos突变体分为14类。这些突变体囊括了低温胁迫,盐胁迫及ABA处理条件
的各种可能的组合。在三种处理条件下胁迫反应基因的诱导表达都受到抑制(10s。。I)
或增强(hosul)的突变体本身就已说明在ABA依赖的和ABA不依赖的胁迫信号传递
途径之间以及冷胁迫或渗透胁迫信号传递途径和ABA信号传递途径之间存在着复杂
而微妙的相互作用(图1-6)。如前所述,Hess同时是ABA依赖的和ABA不依赖的
渗透胁迫信号传递途径的负调控因子。夕),J突变体同时影响ABA,渗透胁迫和冷胁迫
反应的信号传递通路,因此FRYl基因可能在ABA依赖的和ABA不依赖的信号传递
途径之间充当联系纽带的作用”。总之,ABA信号传递途径和渗透胁迫信号传递途径
相互依赖协同调控胁迫反应基因的表达8,40。
2离子胁迫信号转导:SOS途径及c矿、钙调素和钙调磷酸酯酶途径
盐胁迫包括离子胁迫(ionic)和渗透胁迫两个方面.离子胁迫明显不同于其它的
非生物胁迫,例如干旱和低温。植物体内存在专门对离子胁迫(例如过多的Na+积累
和由此而产生的K+匮乏)作出反应的信号传递途径“。土壤盐份破坏植物的离子稳态
(ionhomeostasis),造成细胞质中过多的毒性Na+和过少的基本离子(如C)”7。各种
各样的离子转运器在限制Na+离子进入细胞,促使Na+离子流出细胞,调节Na+离子在
液泡中的分室化作用以及选择性的导入K+离子等方面发挥作用啪..当遭受盐胁迫时,
植物需要激活一些离子转运器或需要增强它们的活性,另一方面需要抑制其它离子(如
Na+内流转运器)的活性。此外,在对盐胁迫反应过程中许多转运器的转录水平升高或
降低1070近年来,通过遗传筛选SOS(salt
overly
sensitive)突变体,克隆SOS基因以
及对SOS蛋白的功能进行生化分析和鉴定。一个调控离子稳态和盐耐受性的信号传递
陈其军:文献综述
途径得到发现(图l一7)”。拟南芥SOS突变体是根据突变体幼苗的生长对NaCl胁迫
过敏感这一现象进行遗传筛选得到的110,111。sosl,sos2和sos3突变体特异性对Na+和
Li十离子过敏感。在没有Na+和Li+离子的培养基中突变体的生长和发育类似于野生型
植物,所不同的是突变体的生长稍慢。SOSl基因编码质膜Na+,H+反向转运器”J12。
因此可知,SOSl的生化和生理功能是从细胞质中移除Na+到胞外空间或根间隙中。
SOSl在K+吸收过程中的作用可能是间接的,可能通过H+和H+.K+协同转运器
(co-transporter)的耦合来实现。SOSl转录本即使在没有盐胁迫的条件下也存在,其
转录水平受NaCI胁迫升调节。与许多其它胁迫调控基因不同的是SOSl转录水平不受
ABA或低温胁迫处理升调节。盐胁追导致SOSl转录本水平升高,其中的一部分原因
是受SOS2和SOS3基因控制的结果”。在sos2和sos3突变体植物中,NaCI诱导的SOSl
转录本的水平大大降低。SOS2基因编码一个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,有一个N末端
催化区和一个C末端的调控区”。在SOS2蛋白内部催化区和调控区之间有一个相互
作用“3。这种分子内的相互作用似乎使SOS2处于一种失活状态。删除调控区导致SOS2
蛋白激酶组成性激活。通过将推测的环式激活结构域中的Thrl68氨基酸替换成Asp也
能导致SOS2蛋白激酶组成性激活。推测从Thrl68~Asp的突变模拟了一个未知的上
游激酶的磷酸化作用过程。SOS3基因编码一种肉豆蔻酰化(myristoylated)的ca2+结
合蛋白33,1140推测SOS3可以感受由盐胁迫引发的胞质Ca2+变化。已知盐胁迫可以触
发胞质自由态Ca2+浓度的瞬时升高.目前,尚不清楚盐胁迫触发的Cd+信号与其它刺
激激活的ca2+信号有何不同以及SOS3如何特异性地感受盐胁迫引发的ca2+信号。
SOS3能够和SOS2相互作用并激活SOS2“5。SOS3激活SOS2需要ca“的参与,这与
盐胁迫反应中ca2+是第二信使的结论是一致的。SOS2和SOS3的相互作用受FISLmotif
的介导。FISLmotif是一个具有21个氨基酸的序列,定位于SOS2调控区…。FISLmotif
也存在于拟南芥的其它23个推测的蛋白激酶中,这些蛋白激酶的氨基酸的序列与SOS2
类似。这些SOS2蛋白激酶类似物(SOS2-like
protein
kinases,PKSs)似乎与某些SOS3
钙结合蛋白类似物相互作用(SOS3.1ike
calcium-bindingproteins,ScaBPs)113
a因此,
某些PKS蛋白可能与特定的SeaBP蛋白配对形成特殊的激酶复合物,进而在各种ca2+
信号传递途径中发挥作用。本质上,这些激酶复合物类似于非植物生命体的钙调素依
赖的蛋白激酶。这个家族的钙调激酶使本已复杂的蛋白激酶的钙调控变得更加复杂,
因为在植物体内,单就钙依赖的蛋白激酶(calcium—dependentprotein
kinases,CDPKs)
而言就是一个很大的家族。除了调控盐胁迫条件下的SOSI转录本的水平,SOS3
2l
中国农业大学博士学位论文
一SOS2激酶复合物似乎还能在分离纯化的膜囊泡中激活Na+/W反向转运器的活性112。
图117盐胁迫激活了几个蛋白激酶途径“。
培养基中过多的Na+引发了细胞质的ca2+信号.ca2+信号为钙结合蛋白SOS3所感受,SOS
和蛋白激酶SOS2相互作用并激活SOS2.SOS3-SOS2调控包括SOSl(Na+/H+反向转运器)在内
的离子转运器的转录本丰度和(或)转运活性,使胞质中维持低浓度的Na+.盐胁迫也导致高渗
胁迫,高渗胁迫信号激活了蛋白激酶ASKI及多个MAPK途径.圈中显示其中的一条MAPK途径。
这条MAPK途径也可被许多其它信号激活.倒如,水杨酸,真曹引发子及伤害.SIPK,SIMK和
ATMPK6分别是烟草、苜稽和拟南芥中的同源MAPKs.SIPKK和SIMKK分别是和SIPK和S[M
相互作用的MAPKKs.问号表示渗透胁迫激活的激酶途径的靶目标尚不知道.
通过以鲫s突变体为背景品系筛选抑制或增强SOS突变体表型的遗传因子,通过筛
选与SOS相互作用的蛋自以及通过SOS突变体的基因表达谱分析,SOS信号传递途径
中的其它组分和靶目标将会得到鉴定.最近,通过差异减法筛选(differentialsubtraction
screening)和Northernblot分析。发现了几个在sos3突变体中高表达或低表达的基因“6。
除了VEGETATIVESTORAGEPROTEIN2(vse2),所有这些基因在sosl和¥os3突变体
中表现出类似的盐诱导表达模式,暗示这些基因表达模式的改变可能是这些突变体对
盐的耐受性下降的结果。在sos2和sos3突变体中盐对VSP2基因的诱导表达受到破坏,
但在sosI突变体中盐对VSP2基因的诱导不受影响。表明VSP2的表达是SOS3一SOS2
激酶途径的靶目标。目前仍不清楚VSP2是否以及如何在盐胁迫耐受性中发挥作用。
在酵母中存在一个特异的高盐胁迫信号传递途径,即钙,钙调素,钙调磷酸酶途
径“7’I”。酵母钙调磷酸酯酶的催化亚基超表达能够增强植物对NaCl胁追的耐受性“9,
暗示植物中可能存在类似的机制参与NaCI胁迫信号传递。在拟南芥中存在与酵母Ca2+
结合蛋白钙调磷酸酶B同源的蛋白家族,这些蛋白被命名为AtCBL(Athaliana
calcineurinB。like
Ca”.bindingproteins).其中的一个成员AtCBLl强烈受干旱,低温
陈其军:文献综述
和伤害诱导”o。上述的SOS3是AtCBL家族的另一成员,在拟南芥盐胁迫信号传递中
起作用。此外,在拟南芥中存在一个小的ca2+结合蛋白AtCPl,和钙调素具有一定的
氨基酸序列相似性,AtCPl也受NaC|胁迫诱导”1。其作用可能类似于SOS3钙结合蛋
白与SOS2激酶的作用”2。其它的ca2+结合蛋白也涉及NaCI胁迫下游组分的激活。拟
南芥的AtGSKI与哺乳动物GSK3同源,能够补救酵母钙调磷酸酶和mckl突变体的盐
敏感表型。AtGSKl的表达受NaCI或ABA诱导”3。AtGSKI的转基因超表达拟南芥对
盐胁迫的耐受性增强,在盐胁迫条件下比野生型积累更多的Na+和Ca2+。而且,AtGSKl
超表达诱导了盐胁迫反应基因的表达”‘。维持离子稳态的SOS3/SOS2/SOSl信号传递
途径似乎为植物所特有。尽管SOS3与钙调磷酸酶的调控亚基的序列与有相似之处107
但是拟南芥基因组中看起来没有编码钙调磷酸酶催化亚基类似物的基因。可能其它类
型的蛋白磷酸酶参与了植物SOS信号传递途径。
3参与逆境胁迫信号传递的MAPK级联途径
大量研究表明蛋白质的磷酸化与去磷酸化过程在细胞的信号识别与转导中起重要
作用,它是生物体中普遍存在的一种调节机制,几乎涉及所有的生理和病理过程。多种
胞外刺激在胞内的传递中涉及蛋白质的磷酸化过程,包括光照、温度(冷、热)、风、雨、
触摸、盐胁迫、伤害、真菌激发子、水分胁迫和吸水等环境刺激125,126以及生长素、脱
落酸、乙烯、水杨酸(SA)、赤霉素和细胞分裂素等植物激素。蛋白质的磷酸化作用是
蛋白激酶将ATP(其次为GTP)Y位的磷酸基团转移到底物氨基酸残基上的过程,蛋
白激酶共同点是催化区(一般含250~300个氨基酸)都含11个保守的亚区。根据其底物
蛋白被磷酸化的氨基酸残基种类,可将它们分为5类:(1)丝氨酸/苏氨酸(Serrrhr)蛋白激
酶,(2)酪氨酸(Tyr)蛋白激酶,(3)组氨酸蛋白激酶,(4)色氨酸蛋白激酶,(5)天冬氨酰基
/谷氨酰基蛋白激酶。目前植物中发现的蛋白激酶以前3类为主。近年来,参与渗透胁
迫信号转导的许多植物蛋白激酶在分子水平上得到分离和鉴定127,“8。其中的一些激酶
与酵母中涉及渗透胁迫信号转导的蛋白激酶同源”9,”o·…’132‘。
MAPKs家族成员存在于所有真核生物中,在多种信号传递过程中起作用。它们是
一类丝氨酸,苏氨酸(Serfrhr)蛋白激酶,Mr38000~55000,具有11个保守的蛋白激酶亚
区。该家族成员包括分裂原激活蛋白激酶、分裂原激活蛋白激酶激酶(mitogenactivated
protein
kinasekinases,MAPKKs)和分裂原激活蛋白激酶激酶激酶(mitogenactivated
protein
kinase
kinasekinases,MAVKKKs)3种类型。在真核细胞内,这3种类型的激酶
中国农业大学博士学位论文
构成一个MAPK级联系统(mitogenactivated
protein
kinasecascade),通过MAPKKK—
MAPKK—MAPK逐级磷酸化,将外来信号级联放大并传递下去。MAPKKK位于级联
系统的上游,能够通过胁迫感受器或信号分子的受体或其本身直接感受胞外刺激而发
生磷酸化。MAPKKK磷酸化后变为活化状态,可以使MAPKK磷酸化。MAPKK又称
MEK(MAPK/extracellularregulated
kinasekinase),始终存在于细胞质中,MAPKK磷酸
化后能够通过双重磷酸化作用将MAPK激活,磷酸化的位点是Thr和Tyr残基。MAPK
又称ERK(extracellularregulatedkinase),被MAPKK磷酸化后有3种可能的去向:(1)
停留在细胞质中,激活一系列其它蛋白激酶;(2)在细胞质中使细胞骨架成分磷酸化;
(3)进入细胞核,通过磷酸化转录因子,调控基因的表达。目前发现动物细胞存在至少
4条、酵母细胞至少5条不同的MAPK级联途径,它们在多种信号传递中起作用。
植物MAPK级联激酶的研究开始于90年代初,现己发现了大量MAPK家族成员,
而且在植物中识别出的MAPK的数量比在动物和酵母中还多。不少编码MAPK和一
些编码MAPKK与MAPKKK的基因也已从植物中分离到,它们主要来源于拟南芥、
苜蓿、豌豆和烟草等多种植物。目前在拟南芥中发现的MAPKKKs包括CTRI,
ATMEKKl,ANPs(ANPl~3),MAPKK包括ATMEKl,MAPK包括ATMPK2~7
等。植物MAPKs与动物和酵母细胞的MAPKs有相似的生化特点,但多数是从胞质组
分中分离到的,其Mr在44000~48000。植物MAPKKK和MAPK是Ser/Thr类蛋白激
酶,MAPKK是Ser/Thr/Tyr双重特异性蛋白激酶。MAPK的激活发生在该激酶的Tyr
和nr两残基位点被磷酸化的情况下。同动物和酵母一样,MBP(脊髓碱性蛋白)也是植
物MAPK的最适底物,使MBP磷酸化的激酶是MAPK的特征之一。MAPK级联系统
也参与植物多种胞外信号在胞内的传递.已发现乙烯和生长素的信号转导均涉及
MAPK级联途径。例如,乙烯信号转导过程中的关键因子CTRI具有MAPK活性,生
长素诱导的烟草细胞分裂与MAPKK的激活相关.此外,ABA能诱导大麦糊粉层原生
质体中MAPK的活性,水杨酸(sA)可激活烟草中的MAPK。
在酵母和哺乳动物中,蛋白磷酸化是渗透胁迫信号转导的中心环节。在酵母中,
渗透调节要么始于包含SH3结构域的膜蛋白要么始于两组分的组氨酸激酶,这两种渗
透胁迫的感受器进而激活MAPK级联途径,促进渗透物质的合成和积累”3。在植物中,
许多蛋白激酶,包括两组分的组氨酸激酶,MAPKKK,MAPKK和MAPK等,受渗透
胁迫以及其它胁迫诱导。但目前仍不清楚植物是否象酵母那样利用膜感受器和MAPK
级联系统调控渗透物质的合成。在苜蓿细胞中,一个46kDa的MAPK受高渗胁迫激
24
陈其军;文献综述
活,命名为SIMK(SALT-STRESS-INDUCIBLE
MAP
KINASE)”4。通过利用酵母双
杂交技术,与SIMK相互作用并激活S1MK的MAPKK基因得到克隆”5。烟草细胞中
存在~个与SIMK类似的MAPK,命名为S1PK(salicylic.acid.induced
protein
kinase)。
S1PK除受高渗胁迫激活外,也能被水杨酸或真菌激发子激活”6.”7。与SIPK相互作用
的MAPKK也己得到克隆”5。
在拟南芥中至少有三个MAPKs受盐胁迫,低温胁迫,伤害及其它环境胁迫激活”9。
以前的研究表明,拟南芥ATMEKKl和ATMPK3(编码MAPKKK激酶)在转录水平受
环境胁迫信号的诱导调控。在干旱、高盐和低温胁迫条件下,5分钟内ATMEKKl和
ATMPK3就被诱导表达,1小时内显著增加,随后表达持续增加,24小时后达高峰。
利用酵母双杂交系统,Mizoguchi等…证明ATMEKKl参与拟南芥植物中传递干旱、高
盐、低温和触伤胁追信号的MAPK级联途径,该途径可表示为:胁迫信号一一
ATMEKKl(MAPKKK同源物)--MEKI(MAPKK同源物)~ATMPK4(MAPK同源物)。
这条途径与酵母的类似。
在拟南芥中还存在一条H202依赖的MAPK级联途径,该途径可表示为:胁迫信
号一一H202一一ANPl(MAPKKK同源物)一MAPKK(未知)一ATMPK3和ATMPK6
(MAPK同源物)。ANP(ArabidopsisNPKl一like
protein
kinase)是与烟草NPKI同源
的MAPKKK蛋白激酶。使用抗原决定簇标记(epitopetagging)和原生质瞬间表达分
析研究表明,1-1202可以激活ANPl,ANTl可以导致ATMPK3和ATMPK6的磷酸化。
通过组成性激活ANPl可以摹拟H202产生的生理效应,诱导胁迫相关基因的表达。组
成性激活的NPKI转基因烟草对多种环境胁迫的耐受性得到改善…。
4其它参与逆境胁迫信号传递的蛋白激酶
除了上述的MAPK激酶级联途径外,与逆境信号传递关系密切的还有钙依赖而
钙调素不依赖的蛋白激酶(calciumdependentandealrnodulinin
dependentproteinkinase,
CDPK)、受体蛋白激酶(receptorprotein
kinase,RPK)、核糖体蛋白激酶(ribosomal
protein
kinase)、转录调控蛋白激酶(transcriptionregulationprotein
kinase)。
4.1受体蛋白激酶(ReceptorProteinKinase,RPK)
蛋白激酶是真核细胞信号转导的重要组分,它们的共同点是催化区(一般含2s0~
300个氨基酸)都含11个保守的亚区,根据其底物蛋白被磷酸化的氨基酸残基种类,
将蛋白激酶分成丝氨酸劣氨酸类和酩氨酸类两大类。位于细胞膜上的RPK受体蛋白激
酶感应干旱、高盐、低温、脱落酸以及生长发育等信号,并将信号向胞内传递,引发
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一系列信号转导过程。RPK蛋白的共同特点是由胞外配体结合区(extraceIIular
ligand·binding
domain)、跨膜区(transmembrane
domain)和胞质激酶区(cytosolickinase
domain)3个结构域组成,通过配体结合区感受外界信号,经跨膜区传递给保质激酶区,
再由胞质激酶区通过磷酸化作用将信号传递给下一级信号传递体。近年来相继在多种
高等植物中分离出~系列受体蛋白激酶基因,它们在各种信号感受及传递中起作用。
干旱、高盐及低温诱导的受体蛋白激酶基因RPKl是从模式植物拟南芥中克隆到
的“2,序列分析表明,RPKI基因编码的氨基酸序列包含蛋白激酶中的11个保守皿区,
属丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶类型,具备胞外配体结合区,跨膜区和胞质激酶区等全部受
体蛋白激酶的特征区。此外,RPKl激酶的胞外部分含有富亮氨酸重复序列(LRR
leucine—rich
repeatsequence)。该序列参与蛋白质一蛋白质问的相互作用,与感受发育
和环境胁迫信号有关[III。表达特性分析表明。RPKI在植物的根、茎、叶和花中都能
够表达。干旱或高盐(250mmol/L
NaCI)胁迫处理条件下I小时内,RPKI的表达
显著增强,6小时后达到峰值并至少在此后的18小时内保持稳定的高表达,此外,低
温处理(4℃)也能快速诱导该基因的表达。由于RPKI基因可被干早、高盐及低温3
种胁迫所诱导,可以认为RPkl激酶在干旱、高盐及低温要引起的水分胁迫的感受和信
号传递中起作用。芽殖酵母中渗透势变化的感应器是位于膜上的蛋白Slnl和ShoI,其
中Slnl由“感受器”和“反应调节器”两部分组成,接受信号后激活有MAP激酶级
联反应参与的信号传递途径.虽然Slnl是一个完整的“双组分系统”(two-component
system)激酶,但信号转导离不开另外两个蛋白激酶Y硼l和Sskl的参与,与SinI不
同,RPKI激酶独立完成信号接受、转换以及对信号传递系统的激活。关于RPKI是引
起有MAP激酶级联反应参与的信号传递途径,还是像Shol一样直接作用于信号传递
途径的下游传递体,尚待迸一步实验确定。ABA处理I小时虽然引起RPKI表达明显
增加,但对ABA不敏感的拟南芥突变型的研究表明,在各种胁迫条件处理条件下突变
型植株RPKI基因的表达与野生型相同,说明该基因的水分胁迫诱导表达不依赖于
ABA作用,RPKl基因的表达特性与拟南芥RD29A基因的表达特性有些相似。
4.2核糖体蛋白激酶(ribosomal-protein
kinse)基因
ATPK6和ATPKl9是从拟南芥中分离的另一类蛋白激酶基因“3,两者的核昔酸序
列有82.0%的同源性。基因表达特性研究表明,它们均被干旱、高盐及低温诱导、仅
在诱导的表达时间上略有差异,其区别主要表现在ATPKl9被诱导和到达表达高峰的
时间较短。低温处理时间上略有差异。其区别主要表现在ATPKl9被诱导和到达表达
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高峰的时间较短。低温处理1小时,ATPKl9的表达量就有明显增加,2小时达到峰值
(8.8倍),而ATPK6的表达量是在低温处理2小时后才有明显增加,lO小时后达到高
峰(6.8倍),然后逐渐下降,用高盐(250mmol/LNaCI)处理时,1小时内,ATPKl9
的表达量开始增加,lO小时后达到峰值(6.3倍)ATPK6在2小时内表达量开始增加,
10小时后达到峰值(4.8倍),两者表达量的升高均持续24小时。此外,施加2,4.D亦
叫引起ATPKl9表达量少量增加,但该基因不被ABA诱导,而ATPK6却可同时被2,4.D
和ABA所诱导。
ATPK6和ATPKl9所编码的氨基酸序列与动物核糖体蛋白s6激酶P70“和PP90“
的同源性很高。目前尚未发现P70妣的直接上游激活物质,但P70“k在动物中能通过
磷酸化40S核糖体蛋白s6而激活蛋白质的合成,因此ATPK6和ATPK19可能通过增
加某些特定蛋白的合成使植物对外界胁迫作出反应。研究表明,MAP激酶所催化的磷
酸化能够激活PP90“,且ATPKl9的表达方式与编码MAP激酶的ATMPK3和ATMEKKl
存在相似之处,如:(1)在干旱、高盐或低温诱导下,3种基因的表达在5分钟内即开始
增加:(2)它们都不被外源ABA诱导,可以认为ATPKl9可能在由渗透胁追引起的不依
赖ABA的信号传递中起作用,从目前的研究进展分析,ATPK6和ATPKl9在信号传导
途径中位于MAPK的下游,在干旱、高盐或低温诱导下激活核糖体蛋白s6,增加细胞
内与这些胁迫耐性相关的蛋白质的合成,或作为细胞在逆境胁迫下的应激反应,促进
所有蛋白质的合成。
4.3转录调控蛋白激酶(transcription.regulation
protein
kinAse基因
转录调控蛋白激酶基因是最近从拟南芥果实中分离鉴定出的一种新的蛋白激酶
基因”4,序列分析表明,它编码的氨基酸序列与酵母(Saccharomycescerevisiae)DBF2
基因编码的氨基酸序列具有很高的同源性,且该基因能补偿酵母dbp突变体的功能缺
陷,因此定名为At-DBF2。拟南芥At-DBF2激酶亦属丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类,同样
包含有11个蛋白激酶的保守亚区。高盐、低温及脱水均能很快诱导At-DBF2基因的表
达,但该基因不受过氧化物诱导。转化实验也显示同样的结果,At-DBF2超表达的酵
母DY株系的抗高盐、低温及脱水能力均比对照有所提高,但抗氧化能力却无明显变
化,分别将At-DBF2及其反义RNA转入烟草BY2细胞系,使它们在烟草细胞中过量
表达,经高盐、干旱、低温或高温处理2周后发现,稳定表达At-DBF2基因的烟草细
胞系抗胁迫能力明显强于转入反义RNA的细胞系。
At-DBF2激酶在拟南芥信号传递中的功能目前尚不了解。At-DBF2的同源酵母
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DBF2蛋白激酶是酵母CCR4转录复合物的重要组分。该转录复合物参与酵母生长、细
胞周期、染色体正常结构维持、氨基酸合成等多种生命活动相关基因的表达,同时还
影响一系列转录因子如:TFIIB,RPBI,SRB2,SRB4等的活性,另一方面,DBF2和
CCR4转录复合物中唯一的蛋白激酶,假可能是其活性的限制因子。目前还没有发现
At-DBF2激酶的直接激活物质或它的作用底物,而且CCR4转录复合体在真核生物中
较为保守,因此At-DBF的作用可能与DBF2激酶相类似。位于信号传递的下游,作为
拟南芥中转录复合物的重要组分在转录水平上调节多种基因的表达,使细胞产生相应
的生理生化调节,基因组杂交显示DBF2基因在烟草,番茄等植物中存在且相对保守。
DBF2基因可能与MAP激酶基因一样,普遍存在于各种真核生物中。
4.4钙依赖而钙调素不依赖的蛋白激酶(cDPK)
胞质游离钙离子是植物细胞信号转导中最基本的第二信使,它几乎介导植物生长
发育的所有反应。细胞内钙的分布是严格区隔化的,其中胞质游离钙离子浓度最低,
而且保持钙的恒稳态是细胞正常生长发育的前提。只有当细胞感受到刺激信号时,胞
质游离钙离子浓度才会发生短暂而复杂的变化,产生第二信使,将刺激信号以独特的
方式传递下去。钙信号的进一步传递,是经钙离子的受体蛋白、CaM、钙依赖蛋白激
酶和钙调控的磷酸酶等完成的。动物中钙依赖蛋白激酶为Ca2+/CaM依赖的蛋白激酶
CaMK和ca2V磷脂依赖的蛋白激酶PKC。植物中Ca2+ICmM依赖的蛋白激酶已有报道,
传统意义上的PKC在植物中的存在也有报道,但植物中还存在着一种独特的钙依赖蛋
白激酶—钙依赖而钙调素不依赖的蛋白激酶(CDPK)或类似钙调素结构域的蛋白激酶
(ealmodulinlikeproteinkinase).它是目前植物中研究较多、了解较为清楚的一类蛋白
激酶,广泛分布于植物、藻类和一些原生动物中,但高等动物中没有。在植物中,从
根到茎、叶,包括果实、种子,都可检测到CDPK的存在。CDPK在细胞内的亚细胞
定位也几乎涉及了所有的细胞器,包括质膜、共生膜、微粒体膜、细胞骨架、胞质、
细胞核和叶绿体、线粒体等。CDPK在结构上具有明显的特征.分析CDPK的氨基酸
序列,它具有3个功能区,从N端起依次为催化区、连接区和调控区。催化区由200
多个氨基酸残基组成,具有典型的Ser/Thr蛋白激酶催化保守序列;连接区由20~30
个氨基酸组成,在各类功能区中最为保守,富含碱性氨基酸,紧靠催化区而以拟底物
的方式与催化区结合起自抑制作用,所以该区又称自抑制区;调控区是CDPK有别于
其它激酶类型的特有区域,有一段结构和功能类似于CaM的氨基酸序列组成,区内共
有4个与ca2+结合的EF手型结构,这是CDPK对ca2+高度亲和而不依赖于CaM的原
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因。调控区的氨基酸序列保守性最差,不同的CDPK在钙结合区的结构上有差异。ca2+
与CDPK的调控区结合后,CDPK被活化。活化机制有两种,一种是结合后诱导了调
控区与连接区的结合,从而解除了连接区与催化部位的结合,也就解除了自抑制作用,
这是一种与Ca2+/CaM依赖的蛋白激酶相似的作用方式;另一种作用机制是使CDPK的
CaM类似区发生了构象变化,这一变化直接将连接区“挤出”或“拖出”了自抑制位
点,而解除了自抑制作用。植物可能同时利用上述两种机制介导着不同的ca2+信号。
另外,从拟南芥中克隆出的8种CDPK,在催化区前端都带有一段长短不一的序列,
称为可变区,8种CDPK在此段很少有同源关系,目前还未弄清这段序列对CDPK作
用的生理意义。据推测,编码CDPK的基因是由原有的2个基因融合而成的,一个是
编码Ca2VCaM蛋白激酶催化区和自抑制区的基因,一个是编码CaM的基因。CDPK
可以像CaM一样受CaM的拮抗剂如w7、氯丙嗪、三氟拉嗪、Calmidzolin等抑制。但
CaM拮抗剂抑制CDPK的浓度要比抑制CaM依赖酶的浓度大,如W7抑制纯化的CDPK
的半抑制浓度(IC50)为1
10}Lmol/L,抑制不纯的CDPK的Ic50为400
pmol/L,而抑
制CaM依赖酶的Ic∞在50
pmol/L左右。CDPK与Ca2+结合后,可将其琉水基团暴露
出来,而以钙依赖的方式与疏水介质如苯琼脂糖(phenyl
sepharose)结合。此外,一
些脂类和碱性多肽也会影响CDPK的活性,碱性多肽抑制CDPK的活性,而一些脂类
如磷脂酰肌醇、溶血磷脂酰胆碱则激活CDPK。CDPK的自抑制区(也即连接区)极
富碱性,碱性多肽的抑制作用可能类似于自抑制区的作用;而带负电荷的脂类可能中
和了CDPK的带正电荷的碱性抑制,从而激活了CDPK活性,而且脂类的激活作用小
于钙的激活效应。经纯化的CDPK为单体酶,Mr在40000~90000。M矿是激酶的重
要辅助因子,在体外检测CDPK活性时,要求反应介质中有5~10mmol/LM矿+存在。
纯化的CDPK
mmol/L级M92+存在的情况下,受Ilmol/L级ca2+的激活,2肛mol/L就可
使酶活达最高值的一半,受ca2+激活的程度在50~100倍。有时所测得的CDPK活性
对ca2+的敏感性不高,可能是酶的纯度不高或纯化时发生部分水解而丧失了调控区造
成的。Ca2+激活CDPK是与其直接结合起作用的,CDPK活性达到最高时原则上只受
ca2+的激活而不需要CaM或磷脂和DAG的作用。组蛋白III-S是绝大部分CDPK的最
适外源底物,由于它被CDPK磷酸化的作用受生理浓度范围内的KCI的抑制,所以推
测它可能不是CDPK的体内底物。此外,不同来源的CDPK对组蛋白III.S的亲和力不
同,如大豆和水稻中CDPK对其亲和力强,而杜氏盐藻的亲和力则要差些。
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Co.1d
Salt/DroughtC+a:Oa。s删CDPK7基>一an砌㈣矗“/…。
yX
OsCOPK7
(Active)喜
●
●
Cold-Tolerm∞e
Salt/Drought.
(ABA4ndependent?)Toleranci
图I-8
OsCDPK7调控低温及商盐或干旱胁迫信号转导的模式”2
虽然CDPK普遍存在,生物特性研究也比较多,然而人们对它在植物信号转导中
的生理功能却了解甚少。近年来的研究表明,CDPK与植物的胁迫反应有密切关系。
水稻中一个编码CDPK的基因OsCDPK7的表达受低温和盐胁迫诱导。OsCDPK7超表
达的转基因水稻对低温、高盐和干旱胁迫的抗性增强。OsCDPK7超表达的转基因水稻
在盐和干旱胁迫条件下也增强了一些胁迫诱导基因的表达,但在低温胁迫下则不能增
强这些胁迫诱导基因的表达。这提示,导致高盐和干旱耐性的下游信号传递途径不同
于导致低温耐性的下游信号传递途径,而OsCDPK是两条信号传递途径的交叉点(图
1.8)1320利用报告基因和效应基因共表达的方法,发现玉米原生质体CDPKl和CDPKla
能激活可被干旱和高盐胁迫诱导的启动子,去除CDPKl激酶区的突变体对胁迫和ABA
刺激没有反应“5。Pestenaacz等“6发现玉米和高粱根中的CDPK经PEG处理】小时后,
活性明显升高。Urao等“7从拟南芥中分离了编码CDPK的2个eDNA克隆(cATCDPKl
和cATCDPK2;Northernblot分析表明在干旱和高盐胁迫下,这两个基因的mRNA被
迅速诱导。CDPK体内底物的识别是了解其生物功能的重要线索,迄今推测的CDPK
底物主要有:一是结瘤素(nodule)26,它是一种跨膜运输蛋白,是通道蛋白的同系物,
町能在代谢物跨越豆科根瘤共生膜运输时起作用;二是质膜质子泵(旷ATPase),由
它产生对细胞生长所必需的pH梯度和电势梯度,CDPK对其产生的磷酸化可能发生在
C末端区域,也可能不在c末端,并不排除多种调节机制存在的可能性;三是细胞骨
甲甲
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架,这是植物细胞中发现的CDPK的最有意义的功能。免疫细胞化学研究证明,CDPK
在花粉管和节间细胞中与肌动蛋白微纤丝定位在一起,这两种细胞中钙依赖的肌动肌
球蛋白与器官或囊泡的定位移动有关;玉米花粉萌发和花粉管的伸长需要花粉特异的
CDPK参与;CDPK还参与了植物细胞肌动张力的调节。这些研究表明CDPK与胞质
环流、器官运动关系密切。另外,还发现叶片硝酸还原酶、磷脂酰肌醇.4.激酶、氯离
子通道、钾离子内向通道(KATl)、水孔蛋白以及逆境诱导的启动子HVAl等也可能
是CDPK作用的底物。而钾离子和氯离子通道、水孔蛋白以及质子泵,在逆境胁迫尤
其是盐胁迫反应中起重要作用。
5参与逆境胁迫信号传递的磷酸肌醇信号级联途径
在植物对胁迫的适应性反应过程中也涉及磷酸肌醇信号途径。当用ABA处理时,
向,J突变体比野生型积累更多的1,4,5.三磷酸肌醇(inositol
1,4,5-trisphosphate,I^)。
FRYl编码多磷酸肌醇1一磷酸酯酶,在口3的代谢中起作用。这些结果第一次从遗传学
上证明磷酸肌醇介导植物ABA和胁迫信号转导,磷酸肌醇的代谢更新对于关闭或减弱
ABA和胁追信号是至关重要的37。在植物对渗透胁迫反应过程中也存在着ABA不依
赖的的磷酸肌醇信号途径。以拟南芥细胞培养物为材料研究发现,高渗胁迫诱导IP3
快速而瞬间地升高,该过程不依赖于ABA。IP3的瞬间提高是由于磷酸肌醇特异的磷
脂酶c(phosphoinositide-spvciflephospholipase
CtPI·PLC)的激活。该酶催化磷脂酰
肌醇-4,5.二磷酸水解产生IP3和DAG(二酯酰甘油)两个第二信使,在动物中分别介
导细胞内Ca2+释放和激活蛋白激酶C(proteinkinaseC,PKC)。PI-PLC抑制剂抑制由
高渗胁迫造成的IP3的升高。一些受脱水诱导表达的基因。例如rd29A(1ti78/cor78)和
rdl7(cor47)在高渗胁迫条件下的诱导表达受PI-PLC抑制剂的抑制,但一些受ABA诱
导表达的基因,、例如rd20在胁迫条件下的诱导表达不受PI.PLC抑制剂的抑制“8。编
码PI.PLC的拟南芥基因本身也受干旱和盐胁迫诱导“9。盐和高渗胁迫也诱导拟南芥细
胞中的磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸。DAG焦磷酸盐,卵磷脂的快速升高”o。磷脂酰肌醇4.
磷酸5.激酶可以磷酸化磷脂酰肌醇4.磷酸产生磷脂酰肌醇-4,5一二磷酸,磷脂酰肌醇
-4,5.二磷酸不仅是IP3和DAG两个第二信使的前体,其自身在信号转导和细胞骨架组
装中还可作为许多胞内蛋白的调节剂。拟南芥存在两个编码磷脂酰肌醇_4.磷酸5.激酶
的基因,其中一个基因AtPIPSKl受干旱,盐和ABA快速诱导”‘。在盐胁迫的拟南芥
中磷脂酰肌醇-4。5.二磷酸和IP3的快速积累与钙动员有关”2。所有这些研究表明,植物
中磷酸肌醇信号传导途径与植物的胁迫反应密切相关。
中国农业大学博士学位论文
尽管有关胁迫信号转导途径的研究近年来取得了很大的进展,但要搞清楚胁迫信
弓转导的复杂网络仍需要进行大量的工作104.153
o与胁迫相关的许多新基因和功能未知
的基冈有待发现,他们在胁迫信号传递链中的作用也有待研究。功能基因组时代的来
临为阐明胁迫信号转导的复杂网络带来了新的希望和机遇。
I寻找新基因
大规模的表达分析
突变体筛选卜特翠一因(cDNA微阵列厦基因芯片)
(T-DNA及转座于随机插入突变,
酵母定卡突变’
I
lI
Ir…瓣Ir叶
,
◆
基因竟隆和测序
IV
◆
(图位克隆和插入标签克隆)
I
fI。酵母要茹纂纛台,·功能分析+
◆(酵母互补.拙南莽基西敲除,超
原位表达衰选.正义,反义抑制)
遗传学研究
(等位性伽和作用:上位性/抑制
(转录/翻译:GFP融合基因;共作用)
表达t启动子选择)
●一◆
l
lI
l
lVV◆
l复合墼转基因t体
f(模式柱物.作糖】
图I-9功能基因组研究的策略”3
6植物逆境胁迫耐受性功能基因组的研究
造成缺水胁迫的环境因子,如干旱、高盐和极端的温度是限制植物生产力的主要
因子。为了应付日渐膨胀的人口,需要培育出更多耐受胁迫的作物以克服这些限制,
提高生产效率比起传统的育种技术和用标记物辅助进行筛选的方法,通过基因工程的
方法直接导入少数基因似乎是提高植物耐受性的更具吸引力的捷径”3.94。但是由于逆境
胁迫响应在遗传上和生理上的复杂性使得人们对逆境胁迫的耐受机制如逆境信息传
递、代谢途径、分室化作用等认识还远远不够,限制了基因工程技术的应用。这就需
要在全基因组水平上对各类胁迫耐受机制进行整合性研究。植物逆境胁迫耐受性的功
能基因组学研究策略可概括为:利用胁迫特异性的ESTJ;及cDNA微阵列(或基因芯片)
技术筛选与胁迫相关的候选基因,然后,利用正向和反向遗传学(如基因敲除)等技
术对候选基因进行功能研究,利用正向遗传学和酵母双杂交等技术对基因间相互关系
陈其军:文献综述
及基因产物间的相互作用进行研究。通过这些研究就可以全面地了解胁迫(渗透、干
旱、极端温度)耐受机制的复杂性和相互作用,以及相应的信号转导途径,从而为更
加合理地、高效地利用基因工程方法培育抗逆植物奠定基础(图1-9)。
6.1利用表达序列标签寻找胁迫相关基因
表达序列标签(expressed
sequence
tags,EST)就是用一个基因(eDNA)的5,或
3’部分序列代表该基因(cDNA),换句话说,就是用一个基因的5’或3’部分序列作为
该基因的标签。EST技术为寻找新基因和未知基因提供了一个高效的工具。利用EST
技术克隆基因的步骤大体上是:①构建eDNA文库;②随机挑选eDNA克隆:⑧每个克
隆从5’或3’进行一次测序;④与同种和异种生物已知的核酸和蛋白数据库进行比较分
析;⑤在基因库(GenBank)中登记新基因及未知基因。
甜土植物的胁迫相关基因。为了对非生物胁迫响应的复杂机制进行全面的、整合
性的研究,首要的任务是通过对随机选择的eDNA克隆进行大规模的部分测序寻找各
类胁迫响应相关的EST。目前,拟南芥和水稻的大规模的EST数据库已经建立,各种
作物(包括棉花,玉米,大豆,土豆和高梁等)的大规模测序工作也已在进行之中(http://
www.nsf.gov/lfio/pubs/awards/genome
99.htm)。公共EST数据库在快速增长,序列标签
数目可在GenBank的dbEST部分找到(http://www.nebi.him.nih.gov/dbEST/dbEST
性的eDNA文库进行了大规模的EST测序。有关eDNA文库公布在http://www.biochem.
arizona.edu/bohnert/funetgenomics/丹ont2.html网站上,最新的EST数据库可在胁迫功
能基因组协会(StressFunctionalGenomicsConsortium)的网站(http://stress
genomies.
org)在线浏览和搜索。作为玉米基因组研究的一部分,来自盐胁迫玉米根和茎eDNA
的EST库也正在建立之中(http://www.zmdb.iastato.eAu/zandb/ESTp删ect.html)。
胁迫耐受性模式植物的胁迫相关性基因。胁迫耐受性模式植物包括盐生植物(如
冰草)、耐干燥植物(如更苏植物)等。尽管在甜土植物中功能性适应盐胁迫的机制可
能在很大程度上是保守的,但盐生生物在进化中已额外形成了结构上或调控上的不同
机制以抵制严重的渗透胁迫或离子胁迫。为了搞清楚这些潜在的机制,以盐生植物冰
草和盐生绿藻为材料进行的大规模EST测序工作已经展开。分别取相等数目的来自盐
胁迫和非盐胁迫叶片组织的EST(各约1200个)进行抽样比较发现,受胁迫植物比未
受胁迫植物多表达约15%未知功能的基因。这个结果说明,当前的非冗余性的GenBank
数据库中登录的EST序列不足以代表所有与胁迫相关的EST,换句话说就是,有待于
中国农业大学博士学位论文
进一步寻找与胁迫相关的EST序列。在上述相对较小的冰革EST库中只有13%的非
冗余的ESTs同时在受胁迫植物和未受胁迫植物中表达,表明伴随着胁迫处理,基因表
达模式发生了剧烈的变化”4。
一些苔藓植物(如土生墙藓”5)和维管植物(如更苏植物,包括鳞叶卷柏”6,玄
参科的Craterostigma
plantagineum”7和禾本科鼠尾粟属植物Sporobolus
stapfianus”8
等),它们的营养组织逐渐形成了对干燥胁迫的耐受性,推测它们可能拥有利于耐受干
燥的特异的基因或调控过程。土生培藓的配子体在缓慢的干燥过程中,营养细胞中形
成了较大(>150
kD)的核蛋白颗粒(RNP),这有利于在水份恢复后快速地恢复蛋白
合成,从而有利于干燥组织的复活4。不同于苔藓植物,当鳞叶卷柏,Craterostigma
plantagineum和Sporobolusstapfianus被ABA和(或)干旱诱导时通过积累渗透保护物
质(如蔗糖,棉子糖或海藻糖)在干燥前建立细胞的保护系统。用干燥的土生墙藓的
多聚核蛋白颗粒(RNP)构建eDNA文库,从中取出152个EST样品进行测序发现,
约70%的EST代表新的基因序列1590一种模式苔藓植物展叶剑叶藓的EST库也已开始
建立。
6.2利用基因芯片技术高通量地分析胁迫特异基因的表达
在拟南芥中,约半数根据氨基酸序列信息推测为编码蛋白的基因,其精确功能仍
不祥。在缺乏其它信息的情况下,差异表达模式通常能提供基因表达的线索。对个别
EST标签出现的频率进行分析可以发现相应基因的差异表达称为“数字化的Northern”
方法。快速定量分析一个特殊群体的大量转录本出现频率的方法—基因表达的系列分
析(Serial
AnalysisofGeneExpression,SAGE)技术已经得到应用…。
尽管用上述方法可以获得部分基因的差异表达模式,但要得到全面的基因表达谱
信息,上述方法远远不够。基因芯片技术的出现为获知全面的基因表达谱信息带来了
光明的前景。基因芯片(geneehip)又称DNA芯片或DNA微阵列(DNAmieroarray)。基
因芯片的制备有两种方式,一种方式为化学合成的方法(光蚀刻技术与固相化学相结
合),合成DNA寡聚片段(20~25
bo)并固化于硅芯片表面,形成致密、有序的DNA
分子点阵,这种方式制备的基因芯片称为寡聚DNA微阵列。又由于该技术将DNA分
子合成于硅芯片的表面,因而又被特称为DNA芯片;另一方式则采用自动化快速打印,
将纯化的DNA样品打印至常规纤维素膜或玻片的表面,形成致密DNA微集阵列,这
种方式制备的基因芯片称为DNA微阵列。目前,后一种DNA芯片应用较成熟。
拟南芥基因组已全部完成序列测定,在大约25,000个拟南芥基因中30%以上的基
陈其军:文献综述
因与已知功能或可以推测功能的基因没有同源性,成千上万的基因只能被鉴定为某一
大类(如蛋白激酶、转录因子)的成员,而无法获知其特异的功能。cDNA微阵列技
术为了解与胁迫响应相关的基因的功能和调控机制,提供了一种高通量的方法”-。它
可以在一个实验中提供成千上万个基因的表达模式的信息,这些信息除能够对未鉴定
基因的功能提供线索外,还可以对已经描述的基因提供新的认识。在冰草、水稻和拟
南芥中利用eDNA微阵列大规模地分析盐胁迫相关基因表达谱已在进行中。
利用各种发育时期(从种子发芽到成熟)的,经不同处理(例如经干旱、冷胁迫
处理及未经胁迫处理)的拟南芥构建eDNA文库,从中得到1300个全长的eDNA并制
作成微阵列。用经胁迫(干旱、冷)处理和未经胁迫处理的拟南芥的RNA,以及用野
生型及DREBlA/CBF3转基因拟南芥的RNA与这种微阵列杂交,结果微阵列中的1300
种eDNA中有44种受干旱诱导,19种受冷诱导,其中的30种和lO种是未报道过的
新的胁迫诱导基因。12种胁迫诱导的基因被鉴定为受DREBIA调控的靶基因,其中的
6种是未报道过的新基因,其中的11种基因的基因组序列已在GeneBank中登记,它
们的启动子区域含有DREB/CBF类转录因子特异性结合并作用的顺式作用元件即DRE
元件或DKB相关的CCGAC核心序列…。
用经盐胁迫处理的一种耐盐水稻的根构建eDNA文库,从中得到1728个eDNA制
作成微阵列。微阵列研究表明在盐胁迫15分钟后该耐盐水稻品系的转录本表现出升调
节,约有lO%的转录本在盐胁迫l小时内显著受到升调节或降调节。随着植株对盐胁
迫的适应,对照和盐胁迫水稻转录本的差异在持续数小时后变小,一周后盐胁迫植株
中受到升调节的转录本恢复到对照水平。与耐盐水稻品系相比,盐敏感水稻在受到盐
胁迫时转录本受到的升调节明显滞后,随后转录本受到降调节,植株死”3。
目前,至少有两个公众资助的项目提供世界范围的微阵列服务:美国的AFGC项
目和英国的GARNet’s项目.前者已于2000年投入服务,后者计划于2001年上半年投
入服务。AFGC项目由拟南芥功能基因组协会(ArabidopsisFunctional
Genomics
Consortium,AFGC)承担,该项Ifl正在完成不同组织(包括根、叶、角果、花和茎),
不同的发育阶段(从种子萌发到种子成熟),不同的基因型的基因表达谱分析。该项目
的对外服务接受来自世界各地的研究者的RNA样品完成微阵列分析(包括标记、杂交
和数据收集)。AFGC得到的全部实验数据存放于斯坦福微阵列数据库(Stanford
MicroarrayDatabase,SMD:http://genome-www4.Standford.EDU/MicroArray/SMD/)中,
研究者可以利用该数据库搜索基因表达情况…。AFGC承担的任务是利用T-DNA或转
中国农业大学博士学位论文
座子插入突变技术(基因敲除)进行功能研究。
基因芯片技术在植物逆境胁迫耐受性研究中的应用可大致归纳为以下几个方面:
①不同的组织在不同的发育阶段对不同环境胁迫因子响应的敏感性不同。通过详细研
究基因表达谱,我们可以理解植物如何在不同的发育阶段和分类复杂的组织中整合胁
迫响应。②利用微阵列技术可以在一种或更多种甜土的(如拟南芥和水稻),盐生的(如
冰草)和耐干燥的(如一些更苏植物)模式植物间进行比较,可以鉴定到表达谱的相
同和不同之处,以及与胁迫(如高盐、干旱及极端温度)耐受性有关的特异基因。③
通过检测突变体和野生型在胁迫条件下转录本的不同,微阵列技术为鉴定胁追耐受性
的决定性基因提供了一种快速而全面的技术。④通过对蓝细菌、真菌和植物基因组进
行比较,可以找到能够解释细胞耐受机制的一群基因。
然而,单凭表达模式,对于获知植物受胁迫诱导的未知基因的功能还远远不够,
未知基因的功能尚需利用正向和反向遗传学的方法进行研究。
6.3利用正向和反向遗传学进行功能研究
随着植物基因组计划的实施和完成,新的、更多的基因组数据库和EST数据库得
以建立和完成,因此产生的问题是成千上万新基因的功能有待分子生物学家鉴定。为
此,利用正向和反向遗传学的手段对所有与胁迫有关的候选基因进行功能研究。正向
遗传学的策略是从功能(表型)一突变体一基因,最后得到具有相关功能(如对盐敏
感或耐盐)的基因;反向遗传学的策略是从基因一(突变体)一功能,最后得到未知
基因的功能。经典分子遗传学利用正向遗传学的方法(即通过筛选突变体进而克隆相
关基因)研究参与胁迫响应过程中的信号转导级联反应及代谢变化的基因。例如,随
着拟南芥盐敏感性突变体(Salt
OverlySensitive,sos)的筛选,发现了几个在胁迫耐受
中起关键作用的新基因”。相反地,通过筛选拟南芥耐冻突变体…和耐盐突变体”5分
别发现了参与脯氨酸合成和降解的调控基因及参与解除活性氧毒害作用的调控基因。
尽管利用生物信息学的方法和技术能够推测未知基因的功能,但最终的答案还是
要来自对突变体进行的生物学鉴定“。相应地,对于胁迫耐受性的基因组研究而言,
为了补充从基因筛选(EST技术)和表达谱分析(基因芯片技术)中获得的信息,需
要系统化地突变所有胁迫相关的基因。拟南芥和水稻大规模的T-DNA或转座子突变体
库的建立和筛选可为胁迫相关基因的功能研究提供基本资源。可以使用正向遗传学和
反向遗传学的方法从大规模的T-DNA或转座子突变体库分离耐受胁迫或对胁迫敏感
的敲除突变体。反向遗传学筛选突变体的原理是:当随机插入的T-DNA或转座子突变
陈其军:文献综述
体品系达到足够数量时,理论上,任何目的基因(致死基因除外)都有可能在其中的
某个品系发生插入突变(即被敲除掉),用PCR的方法即可检测出目的基因发生突变
的品系。为了用PCR的方法检测发生突变的品系,需要将各种突变体品系按照一定的
规则或阵列混合成由小到大的亚库、库及超级席,分别根据目的基因和T.DNA或转座
子序列设计引物,先后以各种库(按由大到小的顺序)的混合DNA为模板进行扩增,
根据扩增结果可将目的基因发生突变的品系定位于某一个超级库、库及亚库内,最后
从亚库中找出相应的敲除突变体。现在,各国的研究人员可以利用国际上的突变体库
筛选敲除目的基因的突变体,而不必亲自建立突变体库。前面提到过AFGC除承担利
用微阵列技术研究基因表达谱外,还承担利用基因敲除突变技术进行功能研究。
Wisconsin大学生物技术中心敲除植物的服务机构(KnockoutPlantFacility)即隶属于
AFGC。除了现有的突变体库,他们计划在将来用包含转座子的T-DNA产生突变体品
系,这样的突变体品系(T.DNA插入突变)由于转座子(位于T—DNA内)的转座可
以使邻近的基因发生转座子插入突变从而可以创建双突变体。该机构计划利用热不对
称交错PCR(thermal
asymmetric
interlacedPCR)技术鉴定所有突变体品系的T.DNA
或转座子两侧的序列并建立数据库,将来研究人员只需根据目的基因的序列检索数据
库,根据检索结果索要敲除目的基因的突变体”7(http://www.Biotech.wisc.Edu
/Arabidopsis)。
就研究逆境胁迫耐受性相关基因功能而言,有另一套突变体库可以利用。以转基
因拟南芥为材料。产生激活性的T-DNA(bialaphos抗性标记物和4X35S增强子)标记
的突变体库用于分离影响胁迫信号转导的突变位点。转基因拟南芥的外源基因为嵌合
基因,是将对渗透势、冷、胁迫和ABA起反应的启动子(如RD29A)与萤火虫的荧
光素酶基因(三ue)的编码区融合‘。荧光素酶的活性可以用来快速鉴定启动子活性,
而启动子活性在突变体中可能增强、减弱或不再被胁迫激活,可据此用正向遗传学的
方法筛选相应的突变体并克隆相应的基因。到目前为止,以RD29A-LUC转基因植物为
材料建立了约90,000个T-DNA标记品系,胁迫信号转导或对胁迫的敏感性发生改变
的突变体己经分离出来。标记群体的DNA库的构建工作正在进行中,将来可以通过
Ohio州立大学的拟南芥库存中心获得用于反向遗传学的研究中。
反向遗传学还包括基因的互补实验、超表达实验及利用反义技术进行的抑制实验
等。可通过定点敲除和随机插入在单细胞的模式生物(如集胞藻属植物PCC6803,酵
母和构巢曲霉)中产生胁迫敏感性的突变体,用这些突变体与拟南芥、水稻、烟草和
37
中国农业大学博士学位论文
冰草的表达文库进行互补实验,可分离相关基因在植物中的定向进化同源基因”8
(orthologs)。可通过在野生型中转入目的基因或通过在盐敏感突变体中转入目的基因
的反义序列来评估盐胁追耐受性的决定因子。最后,可以构建目的基因与GFP融合表
达载体,观察个体基因的时空表达模式和基因产物的亚细胞定位。
7改善植物逆境胁迫耐受性的基因工程
表1改善植物逆境胁迫耐受性基因工程的策略”3
目标
例子
可能的作用模式
渗透保护物质
氨基酸(脯氨酸等);二甲基锍复合物
渗透保护:蛋:t/膜保护;活
(甜菜碱,DMsP);多羟基化台物(甘性OH蒲除。
露醇,山梨醇等);糖类(蔗糖,海藻
糖,果聚糖)
活性氧清除剂
酶类(过氧化氢酶,Fc/Mn超氧化物岐化
活性氧清除.
酶.抗坏血酸过氧化物酶,谷胱甘肽循
环酶,谷耽甘肽S.转移酶,谷胱甘肽
过氧化物酶,Y-谷氨酰半胱氨酸合成
酶.交替氧化酶1;非酶类(抗坏血酸。
黄酮,类胡萝h素。花青素)
胁迫蛋白
胚胎晚期丰富蛋白LEA
机理不祥,可能参与调节蛋白
膜稳定性,束缚水分.充当
分子伴侣及隔离离子.
热击、冷击和盐击蛋白位于几个亚细胞组分的各类热击、冷击逆转或阻止蛋白的去折叠过
和盐击蛋白
程;翻译调节
离子/质子转运器高亲和性K+转运嚣;低亲和性K+通道;
K+/Na+吸收和转运;质子梯度
质膜,液泡前体,液泡和细胞器以及离
的建立;毒性离子的去除和隔子转运嚣(II仲B∞.Na+/H+反向
离.
转运嚣1
膜流动性
腊肪酸去饱和酶
增强膜流动性;提高抗冻性.
水分状况水通道蛋白(溶质促进荆:尿素,甘油,差异调节质膜和液泡膜上的
C02.其它可能的物质例如离子),c吼AQP数量;调节膜定位:调节
浓度气孔运动.
信号组分
组氨酸激酶(AtRRI/2)的同源物;MAP启动Ca2+感受器或磷酸化介
激酶0'sMAPK,HOG);C8抖.依赖的导的信号转导,对环境胁迫作
蛋白激酶lSNFI激酶:蛋白磷酸酶出必要的反应.
(ABII/2);CNA/B信号系统;Ca2+
感受嚣(SOS3);肌醇激酶
转录调控转录因子l
EREBP/AP2(DREB。CBF)I
升调节或转录激活胁迫相关
bZIP(AREB/ABF);锌月耵下(Alfin”;基因.
Myb(ArMyb2,CpMvblO)
生长调节物质改变ABA,细胞骨架和,或油菜素内固改变激素的稳态平衡.对环境
醇的生物合成途径或结合水平胁迫作出必要的反应.
造成缺水胁迫的环境因子,如干旱、高盐和极端的温度是限制植物生产力的主要
因子。为了应付日渐膨胀的人口,需要培育出更多耐受胁追的作物以克服这些限制,
提高生产效率。由于胁迫耐受性状的复杂性,在胁迫条件下产量的遗传方差较低,缺
乏有效的选择技术使传统的育种方法受到局限。而且,由于在不同的发育阶段与胁迫
38
陈其军:文献综述
耐受性连锁的数量性状位点(quantitativetraitloci,QTLs)可能不同,有利的QTLs位
点一黾得到鉴定,就需要进行大规模的育种来恢复与耐受性状连锁的有利的性状。随
着主要农作物的遗传图谱和物理图谱的分辨率逐步提高,用标记物辅助筛选间接与产
量相关的特异的二级性状(如花药和花丝间的间距,渗透调节,膜稳定性或生理耐受
性指标)将会越来越有用。
比起传统的育种技术和用标记物辅助进行筛选的方法,通过基因工程的方法直接
导入少数基因似乎是提高植物耐受性的更具吸引力的捷径。目前的遗传工程策略依赖
于将一个或几个生化途径中的基因或信号转导途径的终点基因连上组成性表达的启动
予进行转化。这些基因产物直接或间接的保护植物免受环境胁迫。例如,渗透保护物
质的生物合成酶、活性氧的清除剂”、胁迫诱导的蛋白4,170(如冷调节蛋白COR、后
期胚发生丰富蛋白LEA)、离子运输载体(如Na+/H+反向运输载体”‘)等。用基因工
程的方法导入胁迫特异性的转录因子已用于提高植物对盐、干旱和低温的耐受性
96,90,172,94。同样地,胁迫信号转导途径中的组分(如组成性表达的酵母钙调磷酸酶)已
用于生化途径的基因工程“9,这些组分通过提高离子内环境稳定态而作用于盐耐受胁
迫反应的多个靶子。但是由于缺乏对代谢途径、分室化作用及功能的全面了解,上述
方法仍然存在很大的局限性。随着功能基因组研究的进展,这些基因转化的局限性会
得到克服,人类会更加合理地利用遗传工程的方法操纵和优化胁迫耐受性状以改善作
物的生产力。
8总结与展望
正在进行中的基因组测序和基因组规模的EST测序以及cDNA微阵列分析有望快
速地分离和鉴定与渗透势、干旱、温度胁迫相关的所有的候选基因。然后,大型的数
据库经过整合及在不同的细胞模型和各类植物模型(甜土的、盐生的和旱生的)中进
行比较可以发现进化上保守的细胞耐受机制。通过对大型数据库中的资料进行分析、
比较、归纳,结合微阵列分析,利用T-DNA或转座子标记的突变体库、互补实验和超
表达实验所进行的功能分析及遗传学分析,就可以找到特异的信号组分与下游的效应
基因之间的级联关系。利用酵母双杂交技术构建蛋白质连锁图谱可以了解蛋白与蛋白
间的特异性的相互作用。利用蛋白质组的方法可以搞清楚蛋白质的结构信息,估测与
胁追耐受性有关的蛋白质修饰作用和蛋白质与配基的相互作用。最后,随着参与胁迫
适应性或耐受性反应的所有基因的功能得到鉴定,人们就可以综合地理解植物对胁迫
响应的生理和生化基础。利用这些来自模式生物的信息,用遗传工程的方法合理地操
中国农业大学博士学位论文
纵和优化胁迫耐受性状以改善作物的生产力将成为可能。
9本课题的研究意义及技术路线
尽管有关胁迫信号转导途径的研究近年来取得了很大的进展,但要搞清楚胁迫信
号转导的复杂网络仍需要进行大量的工作。与胁迫相关的许多新基因和功能未知的基
因有待发现,他们在胁迫信号传递链中的作用也有待研究。诸如基因芯片等功能基因
组学研究手段为研究胁迫信号传递链提供了大规模、高通量的方法,但功能基因组学
的研究手段也有一个不断发展和完善的过程。功能基因组学的研究与传统的分子生物
学和遗传学研究相互补充,相互促进,相互深化。在本研究中我们利用传统的分子生
物学手段--mRNA差异显示的方法,以期发现与盐胁迫相关的新基因或功能未知的基
因。我们首次报告两个编码1,3,4.三磷酸肌醇5/6.激酶类似物的拟南芥基因以ABA依
赖的和(或)ABA不依赖的方式参与了渗透和低温胁迫反应。
研究思路和技术路线如下:利用mRNA差异显示技术筛选与盐胁迫相关的新基
因或功能未知的基因:分析mRHA差异显示技术筛选到的目的基因在其它胁迫条件下
的表达情况;在大肠杆菌或酵母中表达目的基因的融合蛋白,纯化融合蛋白,进行活
性分析,同时制备抗体;创建目的基因超表达的转基因烟草和转基因拟南芥,在生理
水平上对转基因植物的胁迫耐受性进行分析以及在分子水平上分析目的基因超表达后
对其它胁迫诱导基因表达的影响;在基因组水平上对拟南芥基因组中所有的与目的基
因同源的基因进行表达分析,必要时进行更深入的分析和研究。最后,根据我们的研
究结果,结合前人的研究结果提出目的基因在胁迫信号转导链中的作用模式图。
陈其军:材料与方法
第二章材料与方法
l实验材料
1.1宿主菌
大肠杆菌N15
a.Jl*1109,JMl09一I)E3以及根癌农杆菌GV3101及LBA4404来自农业
生物技术国家重点实验室以及植物生理生化国家重点实验室。
1.2质粒载体
克隆载体:pGEM—T载体购自Promega公司;sK质粒来自清华大学植物分子生物学
实验室。表达载体:原核表达载体pET一30a(+)及真核表达载体pBll21来自植物生
理生化国家重点实验室。
1.3各种酶及试剂
实验中所使用的各种限制性内切酶、RNase
A、Taq
DNAPolymerase、蛋白酶K等
购自Promega、Takara、华美、鼎国、原平皓等生物工程公司;氨苄青霉素(Amp)、
羧苄青霉素(cb)、卡那霉素(Kan)、链霉素(sm)、硫酸庆大霉素(Gen)、利福
平(Rif)等抗生素以及IPTG、X-gal、植物激素6-BA、NAA等购自Sigma公司;
放射性同位素n一”P-dCTP购自亚辉生物工程公司;尼龙膜、硝酸纤维素膜购自
Amersham公司。
1.4植物材料
实验中使用的烟草品系为K326,使用的拟南芥为Columbia生态型。
2常用培养基和溶液的配制
2.1培养基配制
LB培养基(1升):蛋白胨log,酵母提取物59,NaCllog,pn7.0(固体培养基
每升加159琼脂粉),高压灭菌。
YEB培养基(1升):酵母提取物lg,牛肉膏59,蛋白胨59,蔗糖59,MgS04.7t1:0
0.59,pH7.0(固体培养基每升加159琼脂粉),高压灭菌。
Ms培养基(1升):MS大量元素、微量元素、有机物,30g蔗糖,8
g琼脂,pH5。8。
烟草分化培养基:Ms培养基+3mg/L
6-BA+O.2mg/L
NAA,pit5.8。
烟草诱导生根培养基:Ms培养基
2.2溶液的配制
朗储备液(10mg/m1):lg
EB溶于lOOml水中,4"C避光保存。
4
中国农业大学博士学位论文
RNaseA(10mg/m1):称取0.19RNaseA溶于10ml10诚Tris·HCl(pH7.5),15mMNaCl
中,100"C煮沸15min,冰浴冷却,-20"C保存备用。
氨苄青霉素(Amp)贮液(100mg/m1):100mgAmp溶于lml
0.4MNaOH中,~20"C保存。
TE:含10mMTriS·HCl(pH8.0),1ramEDTA(pH8.0),高压灭菌。
5×TBE:Tris549,硼酸27.59,0.5M
EDTA(pH8.0)20ml,加水定容至1升。
10×TAE:Tris48.49,冰醋酸11.42mi,0.5M
EDTA(pH8.0)20m1.加水定容至1
升。
6×DNA
LoadingBuffer:0.25%溴酚蓝,40%甘油水溶液,4"C保存。
3实验所需试剂配制
3.1质粒DNA的提取:
溶液I:50mMTris·HCl(pH7.5),lOmM
EDTA(pH8.0),高压灭菌。
溶液II:0.2MNaOH,I%SDS,现用现配,贮备液0.4M
NaOH和2%SDS分开配制。
溶液III:1.32M醋酸钾(pB4.8),高压灭菌。
3.2基因组DNA提取缓冲液:
50mMTriS·HCl(pH7.6),100n】14
NaCl,50mM
EDTA,0.5%SDS,10mMB一巯基乙
醇(可加也可不加)。
3.3Southern及Northern杂交:
20xSSC:称取175.3
g
NaCl,88.2g柠檬酸三钠,调pH至7.0,定容至1升后高
压灭菌。
Church缓冲液:含1%BSA,lmMEDTA,0.25MNa2HPO+-NaH2P04(pH7.2)
10xMOPS电泳Buffer:称取20.6
gMOPS,3.4gNoAc·31120,用Na0H调pH至7.0
后,加入10ml0.5
MEDTA,定容至500ml,高压灭菌。
IOxRNA
Loading
Buffer:50%甘油,1mMEDTA,0.25%溴酚蓝。
4实验方法
4.1mRNA差异显示
①材料处理种子在70%乙醇和1%次氯酸钠中分别浸泡2分钟和lO分钟,用灭
菌的重蒸水漂洗5次×2分钟,播种于MS培养基中。22"C、24小时光照培养,
光强为30.40utool·m-2.s~。2~3周后将幼苗从平板上移入含200mmol/LNaCI的
水溶液以及蒸馏水中,处理3小时。收获整株植物,液氮速冻,-70"C冰箱中保
存,直至用于mRNA差异显示。
陈其军:材料与方法
②总RNA提取分别取200
mg经NaCI处理和未经NaCI处理的拟南芥材料提
取总RNA。总RNA的提取按Gibicol的TRlzol
Reagent的产品说明书进行。
③mRNA的反转录2个RNA样品(NaCI处理与对照)用3种锚定引物(T11A、
T11C和TlIG)共建立6个反转录体系。每个反应体系如下:
上依
5xRTBufier
5.0
pl
50
U/ld
RNasin
0.5
pl
1mmol/ldNTPs5.0Ⅲ
200U/IM—MLVRT
1.0
pl
Total
25.0“1
混匀,离心,将管内液体收集至管底,在GeneAmp9700
PCR仪中,进行如下反
应:37℃60min,95℃5min。反应完成后取出2
p,I用于PCR扩增。
@PCR扩增6个反转录eDNA样品分别用6个随机引物(APl;AGCCAGCGAA;
AP2:GTTGCGATcc;AP3:CTGCATCGTG;AP4:TCACCAGCcA;AP5:GATGCGATGG;AP6:
CCCAGGCAAG)进行扩增,共有36个PCR反应体系。每个反应体系的组成如下:
10xpCRbu仃er
dNTPs00mmol/1)
APprimer(10tunol/1)
TliM(10lunol/I)
ProductsofRT
5
U/IxlTaq
ddH20
2.5Itl
0.5
p,l
1.0Ixl
1.0
p,I
1.0Ixl
0.5ul
19.5Ixl
Tbta
25.0
nI
扩增反应在GeneAmp9700PCR仪进行,循环程序如下:94"C,30s;40"C,2min
中国农业大学博士学位论文
72℃,30s,40
cycle:72℃,5min·
⑤6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳测序凝胶的制备根据Sambrook等(1988),胶凝
后,先60W功率预电泳约40min。使凝胶均匀产热,上样前用缓冲液冲洗每个
上样孔。上样时将3.5山PCR反应产物与2
p,l加样染料(98%甲酰胺,100
Itmolll
EDTA(pH8.0),0.1%----甲苯青和溴酚兰)混匀,并于80℃孵育2
rain,冰上冷
却后加样。以60W功率恒定电泳约3.5
hr,待二甲苯染料迁移至凝胶下缘时停止
电泳。
⑥染色采用银染法。将胶板置于固定液中(10%7.酸)20
min,双蒸水冲洗3
×2min,染色液(AgN03lg,L:
37%甲醛1.5
ml/L)染色30
min,双蒸水冲洗
20s,置于预冷的显色液(Na2C0330g/L,37%甲醛1.5ml
IL:Na2S203·5H20
2
mg/L)2~5min,至影像出现,10%7.酸固定5rain,双蒸水漂洗2次。
⑦差异显示eDNA片段的回收与再扩增将染色后的胶板置于灯箱上观察,直接
从胶上切取差异片段,浸于50¨l重蒸水中,封闭离心管盖煮沸20min,离心收
集冷凝液。上清可直接作为模板用于PCR再扩增。再扩增时反应体积为50u1,
模板量2¨l,其它条件与第一次PCR相同。
⑧差异显示片段的反向Northern杂交每个差异条带再扩增样品分别在1.4%琼脂
糖凝胶中重复上两个样(20山),电泳完毕后,转到尼龙膜。探针标记同第一链cDNA
合成,只是将dCTP替换成一2P的dCTP。体系如下:Ep管中加入总RNA样品(2.0
pg,山)2p.1,OligodT引物(Tls)(1.Opg,m)1.0lal,RNasin(40U/p1)1.0rtl,
ddH20
26p,I,混匀后先于70'12水浴10min,使RNA变性,然后冰浴5min,10000
rpm离心10
s,将管内液体收集至管底,再在冰上加入以下物质:5xRTbuffer10
山,DTT(100mmol/1)5
p,l,dNTPs(A,T,G各10mmol/1)l}d,a-”P-dCTP3
uI,混匀,42"C放置2min,最后加入SuperscriptlI反转录酶lrtl,42"C水浴50min,
进行反转录,反应完毕后,探针经热变性后用于杂交。预杂交和杂交方法见
Southernblot或Northernblot。
4.2HA差异显示片段的克隆
①从琼脂糖凝胶中回收纯化DNA使用北京博大公司的玻璃奶法DNA回收纯化试剂
盒或者北京鼎国公司的离心柱法DNA回收纯化试剂盒均可取得满意的结果。有关方
法在相关产品的说明书及试剂目录中均有说明。
②目的DNA片段与T_载体的连接反应克隆载体使用Promega公司的pGEM-T载体,
44
陈其军:材料与方法
将回收纯化的DNA与T一载体进行连接反应。方法见相关试剂盒的说明书。随后,将
连接产物转化到大肠杆菌感受态细胞中。
③大肠杆菌感受态细胞的制备挑取大肠杆菌单菌落,接种于LB液体培养基中,
37"C培养过夜;取500“l菌液加到50mlLB液体培养基中,37。C振荡培养2~3hr,
至oD一为0.3~0.5;冰浴20~30min,4,000rpm,4"C离心3min收集菌体,用
预冷的i0~20ml80mMCaCl2悬浮:冰浴20~30
min,4,000rpm,4"C离心3min
收集菌体,仍用预冷的2ml80
mMCaCIz悬浮,置于冰浴中备用(12~24
hr内
转化效率最高),或者加入15%~20%甘油,200ml每份分装,-70。C保存备用。
④连接产物转化大肠杆菌感受态细胞取200ml大肠杆菌感受态细胞,加入lO~
20ng质粒或10“l连接反应产物,混匀,冰浴30min;42"C热激90sec,冰浴2min:
加入800mlLB液体培养基,37℃恢复培养lhr后,菌液与X-Gal和IPTG混匀涂
于含Amp抗生素的平板,37"C培养lO~16hr后观察结果。
⑤阳性克隆的筛选与鉴定挑取白色菌斑,摇菌,提取质粒,阳性质粒经PCR及
酶切鉴定后,送交公司测序。
⑥质粒的提取碱裂解法少量提取质粒DNA:(a)将单茵落接种于3ml含相应抗生素
的LB培养基中,37℃摇菌过夜。(b)12,000rpm离·L,30sec,集菌。(c)2U200m
溶液I(含RNase^100
pglml),振荡悬浮菌体。(d)自f1200
ILl新配制的溶液II,颠
倒混匀。(e)溶液澄清后立即加入预冷的200111溶液III,混匀后冰上放置5~10
min。(f)4"C、12,000rpm离·b15min,取上消,加O.7倍异丙醇混匀。(g)12,000
rpm离,blOmin,70%乙醇洗涤沉淀,抽干后溶于适量水或TE,一20℃保存备用。
4.33个基因编码区的RT-PCR扩增及克隆
①材料处理材料为NaCI处理的拟南芥2周龄幼苗。处理方法同4.3①。
②总RNA提取同4.3②。
③mRMA的反转录反转录体系除以T18锚定引物代替TIIM锚定引物外,其
它同③。反应条件为:42℃,60rain,95℃,5rain。
谨)PCR扩增扩增3个基因的CDS用到的3对PCR引物分别为:^Ⅳ丁L7a基因
的正向引物设计为(加框的部分为人为引入的BamHI或SacI酶切位点):
5’-cakgatcdatgaagctaacggacaacgaagaga一3’
At/厂£,茸
5’一acc}gagctQtttaaaooaoatgtttgtgatagtctattgc一3’
5’一cakgatcc|atgtcagattcaatccaggaaag一3’
AtITK
5’-aookagorotcagaoatgattcttcttagtg一3’
中国农业大学博士学位论文
5’一atggtgccatacaaaggtgaagagcagg-3’
AfITL2
5’一ttatatttgacctgcgccaga七tttggaag一3’
以反转录的cDNA为模板建立如下的PCR反应体系:
1OxPCRbuffer
2.5
111
dNTPs(10mmol/1)0.5
111
Forwardprimer(10limol/1)1.0
J11
Reverseprimer(10
pmol/I)1.0
Jal
ProductsofRT
1.0
lII
5U/p.1
Taq0.5山
ddH2019.5
111
Total
25.0
J11
扩增反应在GeneAmp9700PCR仪进行,循环程序如下:94℃,30S;55"(2,30S:
72"(2,1
min;30
cycles;72"(2,5min。
@RT-PCR扩增产物的克隆及鉴定RT-PCR扩增产物从琼脂糖凝胶中的回收、纯化,
回收产物的连接转化以及阳性克隆的鉴定等见4.2。
4.47个胁迫诱导基因片段的PCR扩增与克隆
①材料拟南芥幼苗的培养方法见4.3①
②拟南芥基因组DNA的提取(a)取2g植物组织,加入石英砂、液氮,充分研
磨后,将粉末倒入50
mI离心管中:(b)待离心管中液氮挥发完全后,加入适量8
mlDNA提取Buffer,充分混匀后(可适当加热),室温下充分抽提10-15min:(c)
加入0.5倍体积苯酚,抽提5—10rain;再加入0.5倍体积氯仿,继续抽提10-15min:
(d)4,000rpm,室温离心20min;(e)吸取上清,加入等体积异丙醇,轻柔晃
动离心管,使异丙醇与上清液充分混匀,可见白色絮状DNA:(f)将DNA沉淀挑
入一新的1.5ml离心管中,加入1ml70%的乙醇,洗涤沉淀;(g)沉淀干燥后加
入0.5mlTE(含终浓度50
v.glml的RNaseA)溶解,370C消化RNA0.5一lhr:
(h)等体积苯酚,氯仿、氯仿各抽提一次;(1)上清加入1/10倍体积3MNaAc
(pH5.2)和2-2.5倍体积预冷的无水乙醇,混匀后。于-200C放置30min,
12,500rpm,40c离心15min,弃上清;(j)70%7,醇洗涤DNA沉淀,干燥后溶
于适量TE或水中;(k)取少许DNA,琼脂糖凝胶上检查其质量并进行DNA量的
46
陈其军:材料与方法
标定,其余DNA样品保存在一200C备用。
(鸯PCR扩增7个基因片段的引物设计如下(加框的部分为酶切位点)
5’一A从^|cTcgAdcAcAgAcAcATMcATATMTATgT从cgA从TMAcgTc.3’
K{N1
5’一A从^|cTcgAdcATTATTTgAATATAAgTTTggCTCgTCTAATAATTTTgC一3’
5’一~蚺^l从gCTI_|gAATCAggAgTTgTTTTCCCggTgg-3’
RD29A5。A枞gCTTIcCAAAgCCgAACAATTTATTAACCAAATgTCC-3。
5’一AM^|cTcgA出gAgCgATgAAgAAggTgAggAAAAg-3’
RD{7
5’一A从^|cTcgA出gATCAAATgCAATCAAGgAAAgCOAC-3’
5’一AAA^|gAATTdgTCgAgTgATgAAgAAggTgAAgACg-3’
ERDlo
5’一A从^|g从TTc|cTAACTCTAAACACAAACTTggAgAACAgC-3’
5’一AgA从g^I^^gcTTlcAgATTTcgTgACgg_3。
O。Rf55·一^^^^Ii趸石i司g^^TgTgAOggTgACTgTggATACC-3。
5’一从^^jg从TTcIG^cAc^1TATg^cATTTATgT从^g^ATg从从gTcTlc_3’
∞R6ib5’一心TTdIcTTAAACTAgATTTTgTTgATTAAACTTAAAgTTCCAAACg-3’
5’一A从^lcTgcA出cTAcATcAgccAT从cT从cAMgcTATAgc-3’
RD29B
5’一从^^|cTgcA由TTCACAAACAgAggCATGATACAAAAACgC-3’
PCR扩增体系及循环程序类似于4.3④,只不过模板替换为基因组DNA.
④PcR扩增产物的克隆及鉴定由于扩增7个基因片段的引物均引入了酶切位点,因
此采用SK克隆载体进行克隆。从琼脂糖凝胶中回收纯化PCR扩增产物用相应的内切
酶酶切,酶切产物回收纯化后与使用相同内切酶酶切并经回收纯化的sK质粒进行连
接反应。从琼脂糖凝胶中回收纯化DNA的方法见4.2①.各种内切酶由华美公司自产,
1"4DNA连接酶购自Promega公司。酶切反应在37。C酶切3hr’连接反应于4。C连
接过夜。
酶切体系
连接体系
10xBufrerlxBuffe‘
T4DNAligase(3
u/p1)0.6山
10×BSA
lxBSA10xBuffer1叫
Restriction
enzymes
0.2
U/¨.I
SKvectors
2u|
PCR
productsor
VectorsAbout0.5¨∥plPCR
products
5.4
pl
dd如OAppropriate
ddH20
1
ul
Totalvolume
20~60
Hl
Total
volume10uI
连接产物转化感受态大肠杆菌,根据蓝白斑初步筛选阳性克隆后。提取自斑,摇菌
47
中国农业大学博士学位论文
提质粒,进行PCR及酶切鉴定。鉴定为阳性的菌落送交公司测序。
4.5Northernblot分析
①材料处理材料培养见拟南芥幼苗的培养方法见4.3①。从平板上移取2周龄的拟
南芥幼苗进行如下处理:200
mmol/I的NaCI溶液处理3
hr:40C蒸馏水中处理3hr:
50gmol/I的ABA水溶液中处理3hr.滤纸上自然干燥3hr;室温下蒸馏水中作为对照。
②总RNA提取同4.3②。
③RNA的甲醛的变性凝胶电泳及转膜
(a)配制含有甲醛的变性凝胶:琼脂糖
1.2%,1xMOPS缓冲液,甲醛终浓度2.2
mol/L;(b)处理RNA样品(50ixl体系):
总RNA20—30gg(或poly(A)RNA2-5旧),10xMOPS5山,甲酰胺159l,甲
醛5
gl,DEPC水补足至45Ⅲ,混合均匀后,65。C加热5—10min,置冰上,加
入5Ⅲ10xRNA
Loading
Buffer即可上样:(c)1xMOPS电泳缓冲液,进行电泳
分离:先较高电压,待溴酚蓝出加样孔约1erfl后,降低电压至2—3
Vlem,继续
电泳3-4hr;(d)剪取与胶大小一致的尼龙膜,以10xSSC为转移液,毛细管转
移法转膜过夜;(e)转膜完毕后,用2xSSC漂洗尼龙膜,取出吹干或晾干:(f)
将尼龙膜800C烘30min—lhr。
④探针标记探针标记按TaKaRa公司的RandomPrimerDNALabelingKitVet.2.1设计
盒说明进行。
⑤预杂交与杂交5xSSC预湿的杂交膜放入杂交管中,带有DNA片段的~面向
里,加入15ml预热到6512的Church缓冲液(含I%BSA,lmMEDTA,0.25mmol/l
Na2HP04-NaH2P04(pH7.2),7%SDS)预杂交5小时以上,加入变性好的探针,
于65℃杂交16小时。杂交结束后,分别用2XSSC+0.5%SDS,l×SSC+0.5%SDS,
0.5×SSC+0.5%SDS和O.1XSSC+0.I%SDS在65℃下洗膜,每次15分钟,并不
断用monitor检测信号。洗完后,用滤纸吸掉膜表面的水分,保鲜膜包好,放入
暗盒,--70℃放射自显影。
4.6Southernblot分析
①材料处理材料培养见拟南芥幼苗的培养方法见4.3①
②总DNA提取同4.4②。
③总DNA酶切、琼脂糖凝胶电泳及转膜按4.4④建立60uI的基因组DNA的酶
切体系,分别用BaaklI、EcoRI和//indIII内切酶酶切。取少量酶切产物电泳检测
酶切效果。对拟南芥基因组Dbl/t的3种酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳,凝胶浓度
陈其军:材料与方法
为0.8。5。电泳结束后,切下分子量标准,EB染色,凝胶条的一侧放一把透明的塑
料尺照像。依次对凝胶进行如下处理:O.25mol/IHCI中浸泡胶20
min,凝胶中溴
酚蓝变为黄色;变性液中处理凝胶45
mira中和液中浸泡胶30
min。采用毛细管
转移方法将DNA转移至尼龙膜。2xSSC漂洗尼龙膜,吹干或晾干后于80。C烘
30min—lhr。预杂交及杂交同Northernblot。
4.7融合蛋白的表达、纯化
①原核表达载体的构建按4.4④建立pET-30a(+)质粒以及含AtlTLlacDNA的T
载体的双酶切体系(BamHI和SacI.使用通用buffer)。琼脂糖凝胶电泳后回收相
应的质粒及eDNA酶切片段,按4.4④建立连接体系。连接产物转化大肠杆菌感受
态细胞后,涂于Kan板上。随机挑取菌斑提质粒进行PCR鉴定及酶切鉴定。鉴定
为阳性的克隆送交公司测序。
②融合蛋白的诱导表达将阳性质粒转入大肠杆菌表达菌JMl09.DE3,挑单菌
落接种于含有50斗g/mL卡那霉素的LB液体培养基中,374C培养过夜。取
过夜培养物按1/50的比例扩大培养至OD600为O.5棚.6,吸取1
mL培养物,
收集菌体备用;加入IPTG至终浓度为O.25
mmol/L,37。C继续摇菌4hr,
收集菌体,进行SDS—PAGE凝胶电泳检测融合蛋白表达情况。
③融合蛋白的分离纯化分离纯化融合蛋白的试剂Ni-NTAAgarose购自QIAGEN
公司,操作按相关产品说明书进行。大量培养表达菌并诱导表达蛋白。离心集菌
后,用适量裂解缓冲液B(8mol/L脲、0.1mol/LNaI-12P04、0.01
mol/LTris-HCl,pH
8.0)重悬,轻轻搅拌30
min。尽量避免泡沫产生;12,000
g,4℃离心15min,
取上清;过Ni-NTA
Agarose亲和柱:再用适量洗脱液C(8moFL脲、O.1mol/L
Nail2P04、O.01
mol/L
Tris-HCI,pH
6.3)洗涤Ni柱两次;接着用洗脱液D(8mol/L
脲、0.1mol/L
NaH2P04、O.01
mol/L
Tris-HCl,pH
5.9)洗涤Ni柱两次;最后用适量
洗脱液E(8
mol/L脲、0.1mol/L
NaHzP04、O.01
mol/L
Tris-HCl,pH
4.5)洗涤
Ni柱。分别收集各洗脱液的洗脱组分。经SDS-PAGE电泳检测后,合并洗脱峰。
考马斯亮兰法测定分离纯化的蛋白浓度后,送交相关人员制备抗体。
4.8Westernblot分析
(1)装好电泳系统,加入电极buffer,上样。10和15齿的2mm样品孔最大上样
量分别为36和28山。(2)稳压200V,至溴酚兰刚刚跑出分离胶,约需1-1.5小
时。(3)卸下胶板,染色,室温染1—2小时,沸水脱色。(4)剪与胶等大的NC膜,
中国农业大学博士学位论文
四张滤纸,将NC膜,滤纸和海绵浸入转移buffer中,至少5分钟。(5)按负极一
黑板一海绵一滤纸一胶块--NC膜一滤纸一海绵一红板一正极的顺序安装好有关
装置,除尽气泡。(6)4"C,100
V转移1小时。(7)取出NC膜,浸入10ml封闭
液中,3TC
1-1.5小时。(8)倒出封闭液,4℃可保存2周。(9)按效价加入一抗于
10mlTBST中,3TC
1小时。倒出一抗,4"C可保存2周,20mlTBST清洗lO
分钟,重复3次。(10)加入二抗于10mlTBST中,37"(21小时,倒出二抗,4℃
刘’存2周,20mlTBST洗lO分钟,重复3次。(1I)】JR入10mlAPbuffer,66glNBT
母液,33
plBCIP母液,混匀显色2—5分钟至条带出现,取出NC膜,置于20ml
重蒸水中,终止反应并清洗2-3次。(12)晾干,保存于保鲜膜中。
4.9转基因烟草及转基因拟南芥的创建
①真核转基因载体的构建真核转基因载体使用pBll21,构建方法与原核表达载
体的构建方法类似。使用的pBll21载体采用大量碱裂解法提取。提取方法:(a)
将活化的菌体接种于50mlLB液体培养基(加相应的抗生索),37℃振荡培养过夜;
(b)9,000
rpm、2
min,离心收集菌体:(c)2
ml溶液I(含RNaseA100
lag/m1)
悬浮菌体;(d)加入2
ml新配制的溶液II,缓慢颠倒离心管混匀内容物,室温5min,
促进菌体裂解;(e)加入2
ml溶液III(预冷),颠倒离心管混匀,冰浴10min:(f)
12,000rpm、4"C离心15min,取上清,加入0.7体积的异丙醇,充分混匀,室温
放置10
min;(g)12,000rpm,离心20
min,弃上清,70*47,醇洗涤沉淀,真空抽
干,溶解于适量水或者"rE中,-20℃保存备用。
②农杆菌感受态细胞的制备(a)挑取根癌农杆菌单菌落于3ml的YEB液体培
养基(含相应抗生素:对LBA4404而言是终浓度为125or100laegml的sm;对
GV3101而言是终浓度为125or100I.Lg/ml的RiD中,280C振荡培养过夜;(b)
取过夜培养菌液500
lal接种于50mlYEB(含相应抗生素)液体培养基中,280C
振荡培养至OD600为O.5:(c)5,000rpm,离心5min;(d)加lOml
O.15mmol/lNaCI
悬浮农杆菌细胞,5,000
rpm,离心5rain;(e)1ml预冷的20mmol/lCaCl2悬浮细
胞,冰浴,24小时内使用,或分装成每管200
lal,液氮中速冻1分钟,暨.700C保
存备用。
③阳性农杆菌的制备及鉴定取200
lal感受态细胞,加入1
1ag构建好的质粒DNA,
液氮中速冻1分钟,370C水浴5分钟,然后加入1mlYEB培养基,280C慢速振
荡培养4小时:1,000rpm离心30
s,弃上清,加入O.1mlYEB培养基重新悬浮细
陈其军:材料与方法
胞,涂布于含有100
p,g/ml
Kan和125
p,g/mlSm的YEB平板上,280C培养约48
小时。挑取平板上长出的单菌落,接种于YEB液体培养液(含有100
p-g/ml
Kan
及相应与该农杆菌菌株的抗生素)中,28。C振荡培养过夜。小量提取质粒DNA,
以质粒DNA为模板进行PCR扩增鉴定。
④烟草的转化(a)将含有植物表达载体的LBA4404农杆菌接种于YEB液体培
养液(含有100
p.g/mlKan和125pg/mlSin)中,28。C振荡培养至oD600为o.6 ̄o.8;
4000rpm,室温离心10分钟,用MS盐溶液(PH7.O)重新悬浮菌体,使用时采用
MS盐溶液稀释至原体积的20~50倍;(b)烟草叶片的无菌处理取温室生长的烟
草叶片,流水下冲洗掉表面杂物,再用蒸馏水洗涤;70%的乙醇灭菌30秒后,无
菌水冲洗一次;2.5%次氯酸钠处理8—10分钟;无菌水冲洗三次,备用;(c)无菌
的烟草叶片切去边缘和主要叶脉,切成0.4xO.6cm2大小;(d)切好的外植体在农
杆菌菌液中浸泡lO分钟;(e)用无菌滤纸吸干植物材料表面的菌液,转入上铺~
层滤纸的MS基本培养基,28。C暗培养;(f)三天后,将材料转到含有抗生素的
分化培养基(MS+3mg/L6-BA+0.2mgA-.NAA+Kan
75—100pg/ml+Cb
500p.g/m1)
中进行培养;(g)待抗性芽生长至2-3em高时,切下小芽转入生根培养基中诱导
生根,生根培养基配方:MS基本培养基+Karl
1001.tg/ml+Cb
500pg/ml。
⑤拟南芥的转化将阳性GV3
101农杆菌接种于lOmlYEB液体培养基(含相应
抗生素:125
pg/ml的gif,25IIg/ml的Gen,100I.tg/ml的Kan)中28℃,200
rpm
振荡培养过夜,转化前一天接种于200ml含相同抗生素的YEB培养基中扩大培养
至OD㈣为1.2-1.6,50009,15
min离心集菌,重悬于渗入缓冲液,使OD㈣为0.8。
200ml重悬菌液可重复使用3次。农杆菌可采用真空渗入法或Foral
dip法侵染花
蕾期的拟南芥。具体方法见有关文献。收获种子后,在含100
pg/ml
Kan及50
pg/ml
cb的MS盐上筛选阳性种子。每15cm的平板上可以筛选100
pl的拟南芥种子。
在置于22℃光照培养箱培养前4"12处理3天。在光照培养箱中培养1周,将绿色
的幼苗转到土壤中繁种。收获的种子为转基因T2代种子。
4.10转基因烟草的功能分析
①烟草无菌幼苗的培养烟草的3个转基因品系和野生型品系种子的消毒方法同
拟南芥。将1/4MS平板划分为4个相等的区域,并做好标记。将经消毒处理的3
个转基因烟草品系和野生型品系的种子分别播到同一平板的4个区域中。
②转基因烟草幼苗的耐盐性研究抗盐性实验:将6日龄的烟草无菌苗转至q含300
中国农业大学博士学位论文
mmol/LNaCI的1/4
MS平板上胁迫处理3天。3天后,将胁迫处理的烟草无菌苗
转到正常的1/4MS平板上,生长11天后,拍照。抗冻性实验:将10日龄的烟草
无菌苗置于一lO℃处理3
hr,而后转到正常条件下培养。生长1l天后拍照。抗热
击性实验:10日龄烟草无菌苗于48"C处理45
min后,转到正常的生长条件下培养
18天左右,拍照。
③转基因拟南芥植株的耐盐性研究土壤中实验:种子经消毒后,将3个拟南芥
转基因品系的T2代种子播种在含100
p.mol/lKan的MS平板上,野生型种子播种
于没有Kan的MS平板上于光照培养箱中生长。l周后将Kan平板上的阳性转基
因苗及野生型幼苗移栽到土壤中生长。抗盐性实验:用300
mmol/I的NaCI溶液浇
灌3周龄的T2代转基因拟南芥植株及野生型植株,每3天浇1次,10天后拍照。
抗旱性实验:3周龄的拟南芥苗停止浇水,10天后拍照。MS平板中实验:将3个
拟南芥转基因品系的T2代种子及野生型种子播在同一块事先做好分区及标记的
含150mmol/LNaCI的MS平板上,待转基因幼苗和野生型幼苗表现出明显的差别
后照相。
陈其军:结果与分析(一)
第三章实验结果与分析(一)
编码1,3,4-三磷酸肌醇5,6墩酶类似物的3个
拟南芥基因的克隆及其在胁迫条件下的表达分析
1利用mRNA差异显示技术筛选受盐胁迫诱导的基因
为了发现与盐胁迫有关的新基因和功能未知的基因,我们以NaCI胁迫处理和对照
拟南芥幼苗为材料,利用银染mRNA差异显示技术试图筛选一些受盐胁迫诱导的基因。
对照和盐处理两个样品分别以三种不同的Oligo(dT)(T11A,T1lC和T11G)为引物反
转录生成6种cDNA样品。在进行PCR扩增时,6种cDNA样品与6个上游随机引物
可以有36个组合(每种cDNA样品相应的下游Oligo(dT)gI物与反转录时用到的相同)。
因此,6个随机引物需要进行36个PCR反应(表3-1)。
为避免加样误差及失误,采取以下措施改进加样操作:如表3-l所示,列A的cDNA
模板及Oligo(dT)gl物分别为:C.T11C+T11C;其它各列依此类推。行l的随机引物为:
APl,其它各行依此类推。分别在A、B、C、D、E、F各管将cDNA模板及Otigo(dT)
引物混合好,分别加入事先按表3-1作好标记的36个PCR管。然后,按上表加入随机
引物,最后加入PCR反应预混液(含Taq酶,Buffer,dNTPs,ddH20)。
表3.136个RT-PCR的反应体系
Table3-1Thereaction
systems
for36samples
ofRT-PCR
ABCDEF
(CTllA)(CTllC)(CTIIG)(STllA)(STllC)(STllG)
frllAlfT11C、fT,1G1rrllA)(T1,C1rrllGl
1A1B1C1D1E1F1
(APl、
2A2B2C2D2E2F2
fAP2、
、3A3B3C3D3E3F3
fAP3’
4A4
B4C4
I)4E4
F4
(AP舢
5A5B5C5D5E5F5
fAP51
6A6B6C5D6E6F6
fAP6)
跑测序胶时上样顺序分别为:A.D,B—E和C—F相应的管号两两组合,例如A1和
D1组合,其它依此类推。测序胶经银染后表现为差异的条带共有33条,其中,18条
差异带受盐胁迫升调节,15条受盐胁迫降调节(图3-1)。
中国农业大学博士学位论文
图3-1盐处理幼苗和对照幼苗银染差示部分结果
1、2泳道为两个重复的样品.代表对照样品;3、4泳道
为两个重复的样品,代表经NaCI处理的样品箭头示差异带。
Figure
3-1Aportion
of
amplification
patterns
obtained
by
differential
display
wilh
theoligonuoleotides
T11GandAP6
Lans1and2arereplicates
and
represent
thecontro
samples;Larle
3and4arealsoreplicatesandrepresentth
samolestreatedby200mmoULNaCI
圈3-2部分差异片段的反Northern分析
A和B为两张完全相同的尼龙膜,泳道1~7分别为7个不
同的差异显示片段.与尼龙膜A杂交的探针为对照组cDNA
探针,与尼龙膜B杂交的探针为处理组cDNA探针
Figure
3-2ReverseNorthemblot
analysis
ofthe
partial
di仃b他ntialbands
AandBarethetwo
equivalentnylonmembranes.
Lanes
from
lto7indicatethesevendifierentialbands
fromtheDDRT.The
probeshybridized
with
the
nylon
membraneAarcfromthecontrolcDNA
probesan
mat
hybridized
withthe
ny|on
membraneBfrow=th
treatmentcDNA
probesby
200mmol/LNaCI.
2差异片段的反向Northern分析
为了确证差异带的真实性,每个表现为升调节的差异条带经PCR再扩增后转移到
尼龙膜上。每个样在尼龙膜上有两个重复,尼龙膜分成两半,一半与来自NaCI胁迫处
理的拟南芥幼苗cDNA探针杂交,另一半与来自未经NaCI胁迫处理的拟南芥幼苗
cDNA探针杂交。18条差异带经反向Northern杂交后发现,只有3条差异带表现为阳
性(图3—2)。反向Northern的结果说明,DDRT有很高的假阳性率(在80%以上),
陈其军:结果与分析(一)
比起传统的Northern杂交的方法,利用反向Northern技术可以大大降低筛选阳性差异
片段的工作量。
3阳性差异片段的克隆、测序及Blast分析簖?1
..。一觑奠蟑.&趣尘j犍逊.蠢’&玉ij:¨。。
一!虹童■≮量止必丛:尘!。。廿k:。
趔些垫邀些;蜂逊!丛鼻丛。,.
L●___--。。-一
(A)
r11’’’’’。。。。1。。一5’刨ttgattcacacatttgcatagactatcacaacatstgKttagacaagact
gcgcagggtacgggaaaatgccagagtatgagcatgtattcactgatttcttactgagtgiggtacaaagccaatgta
agaaacgagctttggcagatcaatactaaactcaacggagagaccattgttcctccccaaagaaaaaaagaagattag
tagtctatgcaatttatttctgtacaggacaaagcaccgatttccctcgatgttgttctttagcttcattgtgctgta
caaaagaacaat职aagactgcatttaaaa聃aaatcccttggga唯aaaaaaaaaa璺卜3’
、
.(B)
图3-3相应于AtlTLl基因的DDRT差异片段的序列分析结果
圈A为序列分析图谱:图B为序列分析结果,其中,5’端框中的序列为随机引物序列.3。端框中的序
列为锚定引物TIIG的互补序列.
Figure
3-3Theresultofthe
sequencing
ofthedifferential
fragment
corresponding
totheAtlTLl
Figure
Ashowsthe
sequencing
color
picture.Figure
Bshowsthe
sequencing
result.the
framed
parts
indicatetherandomdecamerandthe
sequencereversecomplementedto
TtlG
primer,
respectively.
将经反向Notlhem证实为阳性的盐诱导片段克隆到pGEM.T载体上送交公司测
序。将序列分析结果提交到NCBI网站(http://www.ncbi.him.nih.gov/BLAST/)作Blast
55
一——一主垦查些盔堂堡主堂堡垒苎
序列同源性分析,同时检索相关文献。结果表明,在3条经反Northern证明为阳性的
片段中,2条阳性片段相应的基因在盐胁迫反应中的功能已有文献报告。一条阳性片段
相应的基因(命名为AtlTLl)编码1,3,4·三磷酸肌醇5/6.激酶类似物(以下简称5/6.激
酶),其功能尚未有文献报告。
ggagacgacagagcaagagacatcgtcgccCtgttcgttaKtaatcgaagcttttccggtgaagaaatccattattgt
aggttacgctcttacatcaaagaagattaagagctttttacaaccaaaactcgaaggtttagctaggaataaggggat
attatttgtggcaatagatcagaataagccactttcagagcaggs。cccgtttgatattgtgttgcataagcaaattgg
aaaagaatggcgtcgaattctcgaggaatttaggctagcacatccagatgtcacagttcttgatcctccagatgcaat
actacatctccgtaatcgtcagtcaatgcttcagtgtgttgcggacatgaatctgtctgatagtaatggacgcgttgg
tgtgcccaagcaattggtaattaaaaaggatgcatcttcaattccggaggctgtcaataatgctggtctgagactacc
tcttgttgcaaagccattggttgctgatggaagtgcaaagtcacatgagctttcgctggcttacgatcaacactccct
tctgaagctcgagcctcctcttgttcttcagga刮cttKttaaccatggaggtcttcttttcaaggtttacattgttgg
ggaggctattagagLtgtccggcgcttctccctacctgatKtctctagacgagaactccccaaatcagctggtgtatt
ccgcttcccacgggtctcttgtgctgcagcttcagctgatgatgcagatctggacccgagcattgccgagcttccacc
acgtcctctgttggagagactggcaaaggaactccgtcgtggattgggtctaaggctKttcaatttagacataattag
agagcacgggacaagagatcggttttatgtgatcgacatcaactatttcccaggcaagtttgatttccacacattttt
图3-4At/TLla的cDNA全序列
图中.5‘端加框的部分为5'-UTR序列:3’端加框的部分为3'-UTR序列;中间未加框的部分为CDS
序列。
Figure:3
4
The
complete
cDNA
sequence
oftheAtlTLla
The
framed
pads
indicatethe5'-UTRandthe
3'-UTR.respectively.
在进行Blast分析时发现,有5个登录号各不相同的序列与AtlTLl差异片段同源,
分别是:ALl61510,AL080252,AV050408,Ay05824l和NM
116886。其中登录号
为ALl61510和AL080252的序列是拟南芥基因组序列的两个BAC克隆,两个BAC
克隆的序列有一部分是重叠的。两个BAC克隆都含有同一个根据基因组序列推测的基
因,其CDS(编码区)序列编码l,3,4-三磷酸肌醇5/6.激酶类似物。另外3个登录号为
AY050408,AY05824l和NM116886的序列是同一种mRNA相应的cDNA序列,也
陈其军:结果与分析(一)
编码l,3,4-三磷酸肌醇5/6一激酶类似物。分析发现,这三个mRNA相应的基因组序列
来自上述登录号为ALl61510或AL080252的BAC克隆。根据基因组序列(ALl61510
和AL080252)推测的CDS序列与登录的mRNA序列(AY050408,AY058241和
NM一1
16886)两者在3’端有所不同。我们利用DDRT方法筛选得到的3’端片段与根据
基因组序列推测的3’端序列是完全吻合的,表明根据基因组序列推测的CDS序列是存
在的,在后面的实验中我们也的确用RT-PCR的方法克隆了该CDS序列。因此,AtlTLI
基因的前体mRNA有两种剪接方式,分别将两种mRNA或eDNA序列命名为AtlTLl口
和AtlTLIb。我们利用DDRT方法筛选得到的差异片段为AtlTLla的3’端部分序列。
AtlTLla和,6的CDS的5’端剪接方式是完全一样的,因此AtlTLla的5'-UTR也应该
与AtlTLIb的相同。由此,我们得出AtlTLla的序列全长为1491
bp,其中包括179bD
的5'-UTR,1017
bp的CDS和295bp的3'-UTR。爿f,7z』6的序列全长为1415
bp,其
中包括179
bp的5'-UTR,1062bp的CDS和174bp的3'-UTR(图3.4和3-5)。
4拟南芥基因组中编码l,3^三磷酸肌醇516.激酶类似物的所有3个基因的eDNA编码
区的克隆
以AtlTLa的eDNA序列在NCBI网站上作Blast分析,同时查找拟南芥编码5/6.
激酶的核酸或蛋白序列,发现在拟南芥中包括AtlTLI在内共有3个基因编码5/6.激酶
类似物。其中的一个基因已有文献报告其编码的蛋白具有5/6.激酶活性。该基因被命
名为AtlTK。AtlTK的全序列eDNA已在GenBank上登录。另一基因同4l,死J一样编
码5/6.激酶类似物,该基因被我们命名为AtITL2。AtlTL2的CDS是根据基因组序列推
测而来。AtITLla,AtlTLlb,AtlTL2,AtlTK四种eDNA的CDS长度分别为:1017,1062,
1095和960
bp。AtlTL2(At4933770)和AtlTLl(At4908170)位于4号染色体,AtlTK
位于5号染色体(At5916760)。AtlTLla和AtITLlb,AtlTL2,AtlTK的氨基酸同源性
分别为92%,51%,39%(图3—6)。
为了对编码1,3,4.三磷酸肌醇5,6.激酶类似物的所有3个基因在胁迫条件下的表达
进行分析,同时为了构建3个基因的原核融合蛋白表达载体和真核转基因表达载体,
我们利用RT-PCR的方法分别克隆了AtlTLla,AtlTK和AtlTL2基因的CDS序列。
首先我们利用RT-PCR的方法克隆了AtlTLla的CDS。从盐处理的拟南芥幼苗中
提取的RNA经反转录后,以反转录产物eDNA为模板进行PCR扩增(图3—7A)目的
条带经琼脂糖凝胶电泳回收后,构建到T载体上,转化大肠杆菌,提取质粒进行PCR
和双酶切(BamHl和Sael)鉴定(图3—7B)。经鉴定为阳性的质粒送交公司测序。
中国农业大学博士学位论文
』舰妇====二==兰===兰生=]
^tI’Llb
UAAUAA
(B)
图3-5AtlTLI基因(前体mRNA)的两种剪接方式
图A,两种剪接方式产生的两种cDNA同源性比较,complete-la指AtlTLla的全序列·
complete-lb指AtlTLlb的全序列:图B.两种剪接方式示意图t三角形代表被剪接掉的内含子。
UAA为终止密码子.
Figure
3-5Thealternative
splicingofpre-mRNA
OfAtlTLl
Figure
Ashows
homology
compadaon
beween
the
two
complete
cDNA
sequencesproduce
by
alternative
splicing
of
pre-mRNA:complete-la
indicatesthe
complete
A1ITLlaan
complete.1b
indicatescompleteAtiTLlb.Figure
Bshowstheschemesofaltemative
splicing:th
trianglerepresenttheintronto
be
spliced
out.thelocationsoftheUAAstopcodonsarepresented。
陈其军:结果与分析(一)
图3-6AIlTLla同AtITLlb,AtITL2,AtlTK氨基酸序列的同源性比较
图A,B.C分别表示AtlTLla同AtlTLlb,AtITL2.AtlTK氨基酸序列的同源性比较.氨基酸序
列在Genbank数据库的登录号分别为:AtITLla自CAB45787.1或CAB81153.1;AlITLlb自
AAK91424.1或AALl5415.1或NP_567334.1;Atlll.2自CAA20590.1或CAB80094.1或
NP195103.1;AtITK自MC2鹋的.1或CMD4978.1或CAC01840.1或AAL59978.1或
NP197178.1.阴影表示同源的部分.
Figure.3-6
Theaminoacid
alignments
ofAtiTLlawithAtITLIb.AtITL2,AtITK
Theaminoacid
alignments
ofAtITLlewithAtITLlb.AtITL2.AtITKareindicatedinFigureA.B
C.respectively.Theaccessionnumbersofthededuced
aminoacidobtainedfrom
public
databases
areasfoIlows:AtITLla(CAB45787.1orCAB81153.1).AtITLlb(AAK91424.1orAALl5415.1o
NP5673341).AIITL2(CAA205901
orCAB80094.1orNP195103.1).AIITK(AAC28859.1o
CAA049761OrCAC01840.1orAAL59978.1orNP-1971781).The
gaps
wereintroducedt
maximizethe
alignment
andidentitiesareshaded
中国农业大学博士学位论文
_I{j同样的方法克隆了AtlTK和AtITL2的CDS。AtlTKCDS的RT-PCR扩增产物(图
3-8)同样构建到T-载体上,阳性克隆经PCR鉴定后,以阳性质粒为模板,重新进行
PCR扩增,引入BamHI和SaeI酶切位点。PCR产物经酶切后,将酶切片段构建到原
核融合蛋白表达载体PET-30a(+)及真核转基因表达载体pBIl21(见结果与分析的第二
部分)上后送交公司测序。AtlTL2CDS的RT-PCR扩增产物(图3-9)不经克隆直接
送交公司测序。序列分析彩图见图3.10。
我们通过RT.PCR方法得到的AtlTLla的CDS序列与GenBmaK上预测的序列只有
两个碱基的不同,但氨基酸序列是一样的。通过RT-PCR的方法得到的AtlTK的CDS
序列与GenBank上登录的序列完全一致。通过RT-PCR方法得到的AtITL2序列与
GenBank上登录的序列有较大的差异(图3-11)。
图3.7At/TL伯CDS的克隆及鉴定
围A,RT-PCR的扩增产物电泳结果.泳道1为RT_PCR的扩增产物.泳道2为分子量标准.图B,
阳性克隆的酶切PCR及PCR鉴定.泳道1为阳性质粒的双酶切结果.泳道2为PCR扩增结果,泳道3
为RT-PCR扩增产物对照.
Figure
3-7IsolationoftheCDSofAHTL’a
Figure
A.the
resultsofRT-PCR.Lane1showstheproducts
of
RT-PCR;lane2
showsthe
molecularmarkersFigure
B.identification
ofposBvedone
throughenzymecuttingorPCR.Lane1
showstheresunsofposttvevectorscutby
BamHIandSaclrestriction
enzymes;Lane2showsthe
resultsofPCR
using
the
positive
vectomastemplate;Lane3showsthereau,sofRT-PCRascontrolof
molecularsize
陈其军:结果与分析(一)
圈3-8
At/TKCDS的克隆及鉴定
图A.RT-PCR的扩增产物电泳结果.泳道1为RT-PCR的扩增产物,泳道2为分子量标准。
图B,6个阳性克隆的质粒,泳道1—6分别为6个阳性质粒的电泳结果。图C,阳性质粒的PCR
鉴定结果。泳道1--6分别为6个阳性质粒的PCR扩增结果,泳道7为RT-PCR扩增产物对照。图
B的泳道7和图C的泳道8为分子量标准。
Figure
3-8IsolationoftheCDSofAt/TK
Figure
A.theresuItsofRT.PCRLane1showstheproducts
of
RT-PCR;lane2showsth
molecular
markers.Figure
B.theresultsof
electrophoresis
of
positive
vectors
Lanes
from1to
indicatethesix
positivevectors.respectively.Figure
C.identificationof6
positive
vectors
through
PCRLanesfrom1to6indicate仇eresults
ofPCRwRh
positve
vectorsastemplates.1ane
indicates
theresultsofPCRwithproductsofRT-PCRastemplates.
圈3-9RT.PCR扩增At/TL2基因的CDS
图中,泳道1为RT-PCR扩增产物的电泳结果;泳道2为分子
标准.
Figure
3-9AmplificationoftheCDS
ofAtlTL2throughRT-PCR
Lane
lindicatestheresult
ofeleetrophoresis
oftheRT-PC
toamplify
theCDSofAtlTL2
!旦垒些查堂堡主堂焦堡壅
翻3.10
At/TLl,At/TK和月Ⅳ7L2基因的CDS序列测序彩图
圈A和8为AtlTLl基因CDS(AtlTLla)的两个测序彩圈.圈C和D为AtlTK基因CDS的两个
测序彩图,图E和F为AtlTL2基因CDS的两个测序彩圈.
Figure3-10
The
sequendng
colorpicturesoftheCDSOfAtlTLl,AtlTKandAtlTL29enes
Figure
AandBshowthetwo
sequendrigcolor
pictures
of
the
CDS
ofAtlTLl
gene伪tlTLla).
FigureCandDshowthetwosequencingcolorpicturesoftheCDSofAtlTKgene.FigureEand
Fshow
the
two
sequencing
colorpictures
oftheCDSofAt/TL2.
陈其军:结果与分析(--)
图3.11
AtlTL2两种CDS的序列比较
图中,AtlTL2—1095指GenBank上登录的根据基因组序列预测的CDS(1095bp):AtlTL2.1029
指我们根据RT-PCR扩增到的实际序列(共1029
bp).
Figure
3-11The
alignment
oftwoCDSofAt/TL2
AtITL2-1095indicatesthe
predictedCDS(1095bp.ecc6s¥ion
numbet,ALl61584orAL031394).
AlITL2-1029indicatestheCDS
amplifiedthrough
FlT-PCR.
为了验证At/TL7基因的拷贝数并验证AtlTLla和At/TLlb两种cDNA的确来自同
一基因组序列,用三种不同的内切酶Hindlll,EcoRI和BamHl分别酶切拟南芥基因组
DNA,以AtlTLla编码区cDNA为探针,在高严紧杂交和洗脱条件下进行SouthemBlot
分析。根据AtPTLl基因所在的BAC克隆(T12G13),其基因组序列被Hindlll切成约
4149
bp和约2041bp两个片段,其中约4149bp的片段中包括约3072bp的AtlTLl
基因组序列,约2041bp的片段中包括约101bp的AUTLl基因组序列。AUTLl的基
因组序列被EcoRI切成约6851
bp和约3011bp两个片段。其中约6851bp的片段
中包括约2229
bp的AtlTLl基因组序列,约3011bp的片段中包括约944
bp的AtlTLl
基因组序列。Southernblot杂交结果基本上与根据基因组序列所作的的预测吻合(图
3—12),表明Af,丁L7基因是单拷贝的。尽管拟南芥基因组中存在其它两个编码5/6.激
酶的基因AtlTL2和AtlTK,但由于它们和AtlTLl的同源性不是很高,因此在高严紧条
件下,不能和AtlTLl的cDNA探针杂交。Southern杂交结果还证明AUTLla和76的
63
中国农业大学博士学位论文
确来自同一基因组序列。
圈3-12AtlILl基因的Southernb{ot分析
E,H和8分别表示EcoRI.Hindlll和BamHI.
Figure
3-12Southernblot
analysis
GenomicDNAwas
digested
with
restriction
enzymes
and
size辩par蛐-dontoa0.8%agarosegel
TheDNAwasthentransferred
ontoanylon
membraneandWBSfixed
bybaking.Hybridization
wascarriedout
withthe
At玎ZlacDNAat65。
overnight.E,H,and
BindicateEcoRI,HindIII,and
BarnHI,respectively.
5编码l'3,4-三磷酸肌醇5f确t酶类似物的所有3个拟南芥基因在胁迫条件下的表达
分析
5.1AtlTLl基因受NaCl和低温诱导,但不受干旱和ABA诱导
为了进一步证实差异显示条带的真实性,并了解相应的基因是否被其它胁迫条件
所诱导,我们以克隆的AtlTLIa的3’端cDNA部分片段为探针进行NorthernBlot分析。
结果表明,AtlTLl基因除受NaCI诱导外,还受低温诱导,但几乎不被干旱和ABA诱
导(图3—13)。
图3-13^fJltf基因的诱导表达
H20,未经胁迫处理;cold,4"C处理3小时;NaCI,200
mmol/tNaCI处理3小时:Dry,自然
十燥3小时:ABA.50Umo仉ABA处理3小时.
Figure
3-13llIductioaoftheAtffLl唧expression
Arabidopsisseedlingsgrown
in
GM(gca'mination
medium)agar
plate*WClt_c
treated
respectively
unde
cold(4℃),200
mmol/l
NaCI,drought
and50luaolaABAconditions
forthreehours.TotalRNA(30tag)
Wits
analyzed
by
northern-blot
analysisusing
the
AtlTLI-specific
probe.Ethidium
bromide-stained
rP.NA
bandswereusedascontrolsfor
equalloadingH20,no
treatment.
陈其军:结果与分析(~)
5,2干旱和ABA对AtlTK基因的诱导强于高盐和低温
既然编码1,3,4.三磷酸肌醇5/6-激酶类似物的AtITLl基因受胁迫诱导,我们推测
编码1,3,4一三磷酸肌醇5/6一激酶的AtlTK基因也可能受胁迫诱导。为了证实这一想法,
我们利用RT-PCR技术克隆了AtITK基因的eDNA,并以其为探针,分析AtlTK基因在
正常和胁迫条件下的表达情况。Northern
blot分析表明,高盐、低温、干旱及ABA处
理均诱导该基因的表达,干旱和ABA对该基因的诱导强于高盐和低温(图3.14)。
图3.14AtlTK基因的No,hemBIot分析
H20,未经胁迫处理;cold,412处理3小时;NaCI,200mmol/I
NaCI处理3小时:Dry,自然干燥
3小时:ABA,50
pmol,q
ABA处理3小时.图A,5.2中使用的杂交膜洗脱探针后以At/TKcDNA为
探针再次杂交。图B,为新的杂交膜杂交的结果.
Figure
3-]4Northernblot
analysis
oftheAtlTK
geneexpression
FigrueA,nylon
membraneisthesalne∞in
figure
13
FigureB,nylon
membraneisanew
one
5.3AtlTL2基因似乎不受高盐、干旱、低温及ABA处理的诱导
将5.2中对AtlTK进行Northernblot分析时使用的尼龙膜的探针洗脱掉,以AtlTL2
基因的CDS为探针再次进行Northernblot分析,结果没有杂交信号(图3.15)。目前,
这一结果有待进一步确证。
图3-15AtlTL2基因的Northern
Blot分析
H20,未经胁迫处理;cold,4℃处理3小时:NaCI,200mmoH
NaCI处理3小时:Dry.自然干燥
3小时:ABAt50pmolaABA处理3小时.
Figure3-15NorthernblotanalysisoftheAtlTL29eneexpression
The
nylon
membraneblottedwithRNAisthesame∞in
Figure
14
中国农业大学博士学位论文
6.编码1,3,4一三磷酸肌醇516-激酶类似物的所有3个拟南芥基因的启动子分析
6.1AtlTLI基因的5’区存在DRE/CRT顺式作用元件
许多被胁迫诱导但不被ABA诱导的基因在他们的5’区存在DRE/CRT顺式作川元
件。我们对AtITLI基因的5’区进行了分析,发现AtITLl基因的5,区同样存在DRE/CRT
顺式作用元件。有趣的是,3个DRE/CRT中的2个位于推测的TATAbox的下游,并
位于AtlTLI基因的5’非编码区内。此外,还发现一些其它的元件,例如MYB
(C/TAACNA/G)和MYC(CANNTG),但没有对ABA起反应的G.box和ABRE
(T/CACGTGG/TC)相关的元件(图3-16)。
6.2在AtlTK基因的5’区存在G-box和ABRE相关的元件
为了从基因结构上理解AtlTK基因的表达模式,我们分析了AtlTK基因的5’启动子区,
发现有两个离转录起始位点较近的G—box和ABRE相关的元件,有一个离转录起始位
点较远的DRE/CRT元件。此外,还存在~些MYB和MYC元件(图3-17)。
6.3AtlTL2基因5’区启动子的初步分析
AtlTL2基因的5’-UTR尚不清楚,我们对AtlTL2基因的5’启动子进行了初步分析,
发现有一个G-box和ABRE相关的元件。此外,还存在一些MYB和MYC元件(图
3.18)。
除兑车:结果‘J分析(‘)
819
atgagttgggaagatgagttctagttaagtcactaagaatgtgaggacgtattcggaggaccaaaaagct
749
caaagttaaagtgatgtagtaacttaEccgtttataaagggaaagacgtactattttaagaggaattttg
679
aagaaagttaccaattttaaaatttaaaagtatgtgagatctgcttttttgaaataaaataatttattaa
609
gtctttttatacatagaatatatattctttttaatgaaattcLacctaagttttattcacaaacattcac
MYB
539taatatcatttat出出tttggtcatataaatagttgttgagttttgataaattgataaaaaatta
MYB
469ttttacctaataaaattatacaaaaatattaatttgtttttttgc囡Lattatttgaaagaaaatt
399
agctacatgattttctcctaaaacattcattttgcgaattatatctaaaaaatttaatcgtatctcaaac
DRE/CRT&MYB
329ttgtcaatacattgatttcaaatcEcgac。aacaakaaactctccaaactcaaaccaga:cBatctatct
MYB&MYBMYB
259aacattttaaaaaattcoaacctagatcattcacgttcttaaa必tcabaactalgctatata
一189
tcggcttggctcagacaaaaataaaaaagtgcagttccaagaatatgttcaaattgcaa!atacatttct
MYB
MYCMYC
-11
9cataattaaaacatgtttctttaccaaaaaaaaaaaaaaaa函tagacacata匿≤五球a园
TATA+1
—49昧ccctcacgcc题五五丑ttcagaoctctccctactctctcataaoccacccmatatcⅢa
DRE/CRTDRE/CRT
+22g罐垂蚕蛩鳞黼黼鞲翁鬻链黧霪塑霆匿蠢萄黼g涵at如曲a眦tttactc。gttgtga
t92ai蘸舔蟊溺鞴露窿鬻鬻黧露罄蘑纛镶鞲鸶霸ii融ctc曲ctt6cataatccccaaaattg_ttt
+j62cgttg昔ttf螂酾a矗鞘g乱
图3—16AftTLl的5。区分析
序列摘自AL080252的第5031至6030.经反向互补而来。加阴影的部分为AtITL7基因5UTR
—AY050408)相应的基因组序列。加框的部分为TATAbox,DRE/CRT.MYBandMYC元件。
Figure
3-16
Analysis
ofthe
5’region
oftheAIfTL7
gene
The
sequence
isreversecomplemented
to
thatexcerptedfromAL080252fromthelocationof5031
Io6030TheshadedDansindicatethe
genomicsequencecorresponding
tothe5’UTR
ofAtlTLlb
mRNA(accessionnoAY050408)TATA
box.DRE/CRT.MYB
andMYCelementsareboxedThe
sharedDansoftwo
elementsareindicated
byshading
中国农业人学博士学位论文
~860
aacaataatcatatttagaaatcaaattttttaaaaaagagaaacctaattcaatatcagttaEtacaat
一790
atatatataccttccaagagcgaatgcatttcaaggtttccaaatcccaaactcggatttgtctactatg
DRE/CRT
一720tccagcagagaaaaggagcttatcatcaggactaagagctaaagcagtgagcgtatb!竖!!Rcgccttca
MYB
一650atcgtggatttcactgatgaatccgtagaat毡苎皇壁墨水gttaatgacgtcaccacaggcgcaggcgatga
MYC
MYC
一580aagaacoat区§!玉aacaatgaaaggaccaccgccgtagaactgctttagagatcEtga6:i讯a
MYB
_____r●●_____一
一510gttcttctt睦!皇璺g!Iatgaggagccatcacgacggcgaactctctttcccgtccgg‘gaagagaacgttg
一440
aaggactttgcgcgaagaaaaacggtagccggagaaagaattagggtttaagcagctcgcttttatacct
MYC
一
一330tgtcttttttttt幽taccaaattttaagaogtaccaaattaagcgtttgcgtttgcgtctgcgt
TATABox
MYB
一260ttgagatccaaatatttaagcccatgaackkggcccataataattatgaagcaatcgt!!!!gf
G—bo×/ABRE&¨YCMYC
一190tccatctaatgaaaaagacctagactcgtcctctttcgcacgcta也!!鲢出tcaacattcgcb型
G—Box/^BRE&MYC
一120catcttcacacgtaccaatattcgattcca睦!鲢出acaacattcccttctctctctgttatttcatct
+1
-50
ctagaaaagggcacaaaaaaccaaactttacgatttctcctctctggaatgtatgatctct+21溺黼斓戮鬻麟辫黼翁黻黼斓黼麟麟黼鍪黼戮黼黼gcttgaacct
+91§镶瓣霞漆黼黼纛黼滋谶黼燃鬻黼裁瀵粼罐瀚浚舔浚魄黼舔镦tgttacctt。g
+161daibg≮鞘潞《籀黼i
图3一17』f,7K的5’区分析
序列摘自AL391147的鹕42960至43959碱基。加阴影的部分为AtlTK基吲5’UTR(AJ001753)相
』、t的皋㈨组序列。加框的部分为G-box,DRE/CRT,MYBandMYC元件.
Figure
3-17
Analysis
ofthe
5’region
ofthe
AHTKgene
The
sequence
is
excerpted
fromAL391147frOmthelocationof42960to43959
TheshadedDans
indicatethe
genomicsequencecorrespondingtothe
5’UTRofAtlTKmRNAraccessioeNoAJ001753)
TATA
box.DRE,CRT.G-box
andABRE—related
elements。MYB
andMYCelementsareboxed
陈其军:结果与分析(一)
accactaaaaaagatttggtgacgtaattacstcaatcatcgaastttctaacttttacaaccccaaggc
MYC
tcaaacatgcttcaagcaaatcttstt矗五区玉tgtgatcgaagttggaaaatttgtcacacgacctt
atggctatttacasttttgatgstastcatgctacacaaatttacaagtactgctcstttactgtactgc
MYB
tcacttgctcasteacIj;j;ii碎caataagccaattcatcgttatctaacgaaattcattatagtaataa
tattaa柏tactcaaaatacgatttstcastctattgatstatttgatgtagaagtaastgtaattcact
G-Box
MYCaaaaagagggaaaaaaaaacgaggagaat5;;j;ii玉aactatagCCgctttttaststatttga因
taaaaaaaaaaaastatatatasttttaattttsttgtcgcttstacttttcaagttgcttgtaatatgg
tttcatcttgagaaaaaaaaaaacagaaagagaaaatacaataaatgtattcagaaaagaagaataacca
aaaaaagcagcaaatctttgggaacgaccatstcactstagcatctstttttctgcaaattattctc[]
TATA?
MYCiliii;;;面atttgatcatcagaccaatctctccctcaaIj;jlji蛩tcatctcatctctctgatttcttgc
ttcgaattttgatttatctctctctstctctctotcgstctcstgctctatctcstttstaggcagtgcc
TATA?aatttcaccacttststtstststcagcgga因gaatctgagaggaatatttaaagattctccctttg
TATA?cttcttcttttt因ccstttctatteatstttugactcttgcttCCggcgaaatcgaaactgccaga
ctgaaccstaatttggggattacstccaatttagggstttcctgcggtggatttgaagactttgctat98
gattcgaaggggaaaacatg
图3-18AtlTL2的5’区分析
序列摘自AL031394的第29664至30663碱基.经反向互补而来.加框的部分为G.box。MYBandMYC
元件.
Figure
3-18
Analysis
ofthe
5’region
oftheAtlTL2
gene
The
sequence
isexcerpted仃Dm
AL031394
fromthelocationof29664to30663.TATAbox.G·box
and
ABRE-related
elements,MYB
andMYCelementsereboxed.
陈其军:结果与分析(二)
第四章实验结果与分析(二)
7个拟南芥胁迫诱导基因片段的克隆
为了分析AtITLla和AUTK基因在胁迫反应中的功能,我们创建了超表达AtlTI伯
的转基因烟草和转基因拟南芥(见实验结果与分析的第四部分),正在创建超表达AtITK
的转基因烟草和拟南芥。为了深入研究上述基因的功能,除了以这些转基因植物为材
料研究相应的基因在胁迫反应中的生理功能外,还需要分析上述基因超表达后对其它
胁迫反应基因表达的影响。为此目的,我们克隆了7个胁迫诱导基因的片段。这7个
胁追诱导基因分别是:RD29A,RD29B,RDl7,ERDIO,CORl5,COR6.6,KINl。除
了RD29B外,其它基因的启动子区都含有DRE顺式作用元件。克隆的这些基因片段
可作为Northern
blot分析时的探针,用于研究转基因拟南芥中AUTLla或AUTK超表
达后对这些胁迫诱导基因表达的影响。
17个胁迫诱导基因片段的PCR扩增
KINl,RDl7。ERDIO,CORl5,COR6.6,RD29B六个基因片段以拟南芥基因组
DNA为模板进行扩增,RD29A基因片段以RD29A的基因组序列为模板进行扩增(含
有RD29A基因的质粒来自日本的Shinozaki实验室)。KJNl,RD29A,RDl7,ERDIO,
CORl5,COR6.6和RD29B等片段的预期大小分别为:228,1381,573,583,398,279,
853
bp。
图4.17个胁迫诱导基因片段的PCR扩增
泳道I为DNA分子量标准,泳道2~8分别为K/NI,RD29A.RDl7,ERDIO,CORl5,COR6.6
和RD29B等7个基因片段的扩增结果.
Figure
4-lPCR
products
of∞ven
frag//”ntsofstressinducible
genes
Lane1indicatestheDNA
markers;Lsncs
from2to8indicatethePCR
products
of
fragments
ot
Kml.RD29.4。RDl
7。ERDIO。CORl5.COR6.6andRD29B.respectively.
71
中国农业大学博士学位论文
从图4-l可以看出,图中电泳条带单一,亮度很好,说明扩增效果很理想。从PCR
产物大小来看,与预期片段大体上是吻合的,但与DNA分子量标准比较,扩增产物的
大小与预期大小相比有一定的出入,这可能与琼脂糖凝胶的分辨率不够有关,也可能
与电泳时的上样量等因素有关。
27个胁迫诱导基因片段的克隆及鉴定
圈4-27个胁迫诱导基因片段的克隆策略
Figure
4-2
Cloning
strategyof.∞vell自aI舯协ofstress-induciblegenes
为了将PCR扩增产物构建到SK载体上(图4-2),在设计PCR引物时,引入适当
的酶切位点。扩增K/N1,RD29A,RDl7,ERDIO,CORl5,COR6.6和RD29B基因片
段的引物引入的酶切位点分别为:脚抖棚,Hindlll,Xhol,EcoRl,HindllI,EcoRI和
西盯。将PCR产物回收、酶切、再回收,与酶切后的SK质粒连接,转入大肠杆菌进
行蓝白班筛选。挑取白色单菌落摇菌提质粒进行分子量大小及PCR鉴定。
从图4.3上可看出,与对照的SK质粒相比,2、3、4、5、6、7、8、9号质粒都
有不同程度的滞后。这说明它们可能含有外源插入片段。泳道7的情况比较特殊,比
陈其军:结果与分析(二)
预期的阳性质粒大很多。对其进行PCR鉴定发现,它含有目的序列。推测可能是两个
sK质粒相连后,再连接目的片段造成的。对7号阳性质粒进行酶切,发现酶切下来的
片段与目的片段的大小是吻合的。回收酶切的片段,重新连接转化,得到9号阳性克
隆,泳道9就是从该阳性克隆的质粒,它的大小与预期的相符。
分别以7种阳性质粒为模板,进行PCR扩增鉴定。PCR鉴定结果如图4—3所示。
比较图4-3与图4-1的结果,可以看出相应的PCR扩增片段的大小是一致的,PCR扩
增结果表明被鉴定的质粒是阳性的。
圈4-3阳性质粒分子量大小及PeR鉴定
图A.阳性质粒的分子量大小鉴定.泳道1为SK对照质粒。泳道2~8分别为含KINI.RD29A,
RDl7.ERDIO,CORl5。COR6.6和RD29B基因片断的SK质粒.泳道9为另一含COR6.6基因片
断的SK质粒.图B,阳性质粒的PCR鉴定.泳道I为DNA分子量标准,泳道2~8分别为7中阳
性SK质粒的PeR扩增结果.
Figure4-3Identificationofthe
positivevectorsaccordingtothemolecular
weight
and
by
PCR
Figure
A-identificationofthe
positivevectors
according
tothemolecular
weight.Lane
1
indicates
the
original
SKvectorsascontrol;Ls/les
from2to8indicatethe
positive
vectors
containing
the
fragments
oftheKINI,RD29A,RDILERDIO,CORl5,COR6,6and
RD29B,respectively;Lane
9is
another
positivevectorscontainingthe
fragments
ofCOR6.6
Figure
B,identificationof
the
positive
vectors
by
PCR.Lane1indicatestheDNA
markers;Lanes
from2to8indicatethePCR
products
of
thepositivevectors
containing
the
fragments
oftheKINI,RD29A,RDl■ERDIO,CORl5,COR6.6
an
RD29B,respectively.
3阳性质粒的序列分析
为了进~步确证克隆的PCR扩增片段是我们需要的目的片段,对上述阳性质粒的
插入片段进行了序列分析。序列分析送交公司完成。由于RD29A基因片段是从包含
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RD29A基因的质粒扩增而来,假阳性的可能性极小,因此没有克隆的RD29A基因片
段进行序列分析。以下是6种基因片段即KINI,RDl7,ERDIO,CORl5,CORd6和
RD29B的序列分析图谱。序列分析结果表明,我们克隆的基因片段是我们需要的目的
片段(图4-4)。
图4.4阳性质粒插入片段的序列分析图谱
圈A ̄F分别为KINI,RD29A.RDl7,ERDIO,CORl5.COR6.6和RD29B基因片断序列分析
图谱.
Figure
4-4Thecolor
mapsofsequencing¨a岍isofinsertion
fragmentsofpositive
v∞lor¥
FiguresfromAtoFindicatethe
colormaps
ofsequencinganalysisofinsertionfragments
ofpositive
vectorscontaining
thefh镕m∞协ofKINI,RD29A。RDtT,ERDIO,CORl5,COR6,6andRD29B
respectively.
——————————————————堕苎兰!笙墨量坌堑!三!
第五章实验结果与分析(三)
融合蛋白在大肠杆菌中的表达、分离纯化及抗体制备
1AtlTLla基因原核表达载体的构建
圈5-l
原核表达载体pET.30a(+)的质粒图谱及多克隆位点的序列
Figure
5‘1Vector
map
ofthe
protokmyotie
expressingvectorspET.30a(+)
IA),i璺毗毗瞰眦。嘟甜吨蛳啪蝴…娜姬
‘togaacgccagcacatggacagcccagatctgggtaccgacgacgacgacaaggccatggctgatat幽
gaagctaacggacaacgaagagatcaccatgaacggaactcgagaaatggagacgacagagcaagagacatcgtcgcc
gtgttcgttagtaatcgaagcttttccggtgaagaaatccattattgtaggttacgctcttacatcaaagaagattaa
gagctttttacaaccaaaactcgaaggtttagctagpataaggggatattatttgtggcaatagatcagaataagcc
actttcagagcagggtccgtttgatattgtgttgcataagcaaattggaaaagaatggcgtcgaattctcgaggaatt
taggctagcacatccagatgtcacagttcttgatcctccagatgcaatactacatctccgtaatcgtcagtcaatgct
tcagtgtgttgcggacatgaatctgtctgatagtaatggacgcgttggtgtgcccaagcaattggtaattaaaaagga
tgcatcttcaattccggaggctgl:caataatgctggtctgagactacctcttgttgcaaagccattggttgctgatgg
aagtgcaaagtcacatgagctttcgctggcttacgatcaacactcccttctgaagctcgagcctcctcttgttcttca
ggagtttgttaaccatggaggtgttcttttcaaggtttacattgttggggaggctattagagttgtccggcgcttctc
cctacctgatgtctctagacgagaactccccaaatcagctggtgtattccgcttcccacgggtctcttgtgctgcagc
ttcagctgatgatgcagatcCggacccgagcattgccgagcttccaccacgtcctctgttggagagactggcaaagga
actccgtcgtggattgggtctaaggctgttcaatttagacataattagagagcacgggacaagagatcggttttatgt
(B)
陈其军:结果与分析(三)
图5-2
AllTLla融合蛋白的氨基酸序列
髑A,AtlTLlacDNA在pET-30a(+)上的插入位点序列.图B。融合基因的开放阅读框序列.图C
融合蛋白的氨基酸序列.
Figure
5-2Theamino
acidsequence
ofthefusion
protein
FigureA.thepartialsequence
ofpET-30s(+)inwhichtheAtlTLlacDNAwas
inserted.Figur
B,the
openreading
frameofthefusion
gene.FigureC。theaminoacid
sequenc
eofthefusio
protein
匿5.3原核表达载体的构建
图A,pET-30a(+)的双酶切(BamHl和Sscl)。泳道l为未酶切的质粒对照。泳道2、3为酶切的
质粒.图B,携带有AtlTLlacDNA的pGEM-T载体的双酶切,泳道l为AtITLla的PCR扩增产物对
照.泳道2为T载体的酶切结果.圈C.酶切后的pET-30a(+)质粒及酶切后的AtlTLIacDNA的回收纯
化产物.泳道1为At盯Lla
eDNA。泳道2为pET-30a(+).图D,阳性质粒的大小鉴定.泳道I、2为
两个阳性质粒,泳遒3为原质粒.图E,阳性质粒的PCR鉴定.泳道l、2为两个阳性质粒的PCR扩
增结果,泳道3为AflTLIa的PCR扩增产物对照.
Figure
5-3
Constructingofpmtnkaryoficexpressing
vectorsforAtlTLIseDNA
Figure九pET-30a(+)vcctorscutby
BamHIandSscl.LaceIindicatestheintactvcctors∞control
Lancsfrom2
to3
indicatethevectorscut
by
the
enzymes.Figure
B,the
pGEM·Tvectors
with
AtITLIa
cDNAinsertionscutbytheenzymes.LanelindicatesthePeR
products
oftheAtlTLlaasconlrol;Lsne
indicatestheresultsofthe∞狮e
cutting
oftheT
vectors.FigureCthe
recovcD,products
ofth
pET-30“+)vectors
and
theAtlTLla
eDNAcutbythe
enzymes.LIlle
IindicatestheAtlTLIa
cDNA;Lane
2
indicatesthepET-30a(”vectorsFigureD'identification
ofpositivevectors
according
tothemolecular
weight
ofthevectOrsLanesfromlto2indicatethetwo
positivevectors;Lane
3indicatesthe
origina
pET-30a(+)vectorswithoutinsertionsFigureE,identification
of
positivevectorsthrotlghPCRLanes1
and
2indicatethePCR
products
oftwo
positivevec“)rs;Lane
3indicatesthePCR
products
ofAtlTLlacDNA
control
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为了阐明AtlTLla的生化功能,首先需要获得AUTLla基因的表达产物蛋白,然
后对其进行活性分析。另外,尽管Northern
blot分析的结果表明,AtlTLla受胁迫诱
导,但不能肯定其表达产物蛋白的水平与其转录水平是一致的。我们创建了超表达
AtlTLla的转基因烟草及转基因拟南芥,尽管可以用在转录水平上对转基因植物中
AtlTLla基因的表达情况进行Northern
blot分析,但不能肯定超表达的AtlTLla基因
后能否翻译成蛋白。为此,需要进行Western
blot分析。而要进行Western
blot分析,
首先需要获得AUTLla的表达产物蛋白,进而制备抗体。为此,我们构建了原核表达
载体,诱导表达和分离纯化了融合蛋白,并制备了相应的抗体。
图5—1显示我们使用的原核表达载体的图谱及多克隆位点序列。原核表达载体
pET·30a(+)(图5-2)及带有AUTLla
cDNA(5’和3’端分别引入了BamHI和Sacl酶
切位点)的pGEM-T载体分别用BamHI和Sacl双酶切,相应的酶切片段经琼脂糖电
泳回收纯化后进行连接反应(图5-3)。阳性克隆经PCR鉴定后送交公司测序。从图
5—2可知,融合蛋白中前50个氨基酸由pET-30a(+)编码,其中含有6个组氨酸标签,
剩下的338个氨基酸由AtlTLla
cDNA编码。融合蛋白的分子量约43KD(MW=
43351)。之所以没有在融合蛋白的C末端也挂上组氨酸标签(需要去掉Af『丁L伯cDNA
的终止密码子),是为了避免重新合成引物(原有的用于构建真核表达载体的引物带有
终止密码子)。
我们还构建了AtlTK的原核表达载体。AUTK的PCR扩增产物经BamHI和Sacl
双酶切后,构建到经BamHI和Sad双酶切的pET-30a(+)载体上。阳性载体经PCR
鉴定后送交公司测序。测序结果表明我们成功地构建了AtITK的原核表达载体。
2融合蛋白的诱导表达、分离纯化及抗体制备
将阳性质粒转化到大肠杆菌表达菌JMl09·DE3株系中,用ITPG进行诱导表达,
从图5-4中可以看出,在43与66KD之间有一条加粗的蛋白带,应该是融合蛋白。
融合蛋白比预期的43KD的分子量稍大。
融合蛋白的纯化按Qiagen公司的产品说明书进行。细菌沉淀用BufferB裂解后,
离心取上清,上清过Ni·NTA亲和柱.随后分别用BufferC和BufferD洗涤亲和柱。
最后用Buffer
E洗脱。从图5-5中可以看出,融合蛋白的洗脱峰在BufferE洗脱物的
第2和3管。合并洗脱峰,按考马斯亮兰染色法测量蛋白浓度为0.8
mg/ml。兔抗血清
由有关技术人员代为制备。抗体效价在103~10。.之间。
陈其军:结果与分析(三)
图5-4融合蛋白的诱导表达
泳道1和2为带有阳性pET-30a(+)质粒的表达菌的总
蛋白的SDS-PAGE电泳.其中,泳道l为IPTG诱导前
的蛋白PAGE电泳,泳道2为IPTG诱导后的蛋白
SDS-PAGE电泳.泳道3为蛋白分子量标准,6条带的分
子曩自上而下分别为:97、66、43、31、20、14。泳道
为带有pET-30a(+)空质柱的表达菌在IPTG诱导后的蛋白
PAGE电泳.箭头示融合蛋白所在的位置。
Figure
5-4
Thefusion
proteinexpressed
inEcoli
LaneIand2indicatetheSDS·PAGEoftotal
protein
expressed
inEcolicarriedwiththe
positivepET-30a(+、
v∽Iorswiththe
A“TLla
insertions.Lane1
indicatesth
PAGEofthe
proteinsnotinduced
byIPTG;Lane2
indicates
theSDS·PAGEofthe
proteins
induced
byIPTG;Lane
3
indicatestlle
proteinmarkers:97,66,43,31,20,14
from
up
todown。respectively;Lane
4indicatesthePAGE
oftota
proteinsexpressed
inEco/icarriedwiththe
negative
pET-30“+)vectorswithouttheAtlTLlacDNAinsertions
The8,rrowindicates
the
positions
ofthefusign
proteins
图5.5融合蛋白的分离纯化
泳道1为过Ni-NTA柱前的蛋白SDS-PAGE.泳道2为BufferB的洗脱物,泳道3为BufferC的洗
脱物,泳道4为BufferD的洗脱物,泳道5~10分荆为BufferE的洗脱物.箭头示融合蛋白所在的位置。
Figure5-5
Theisolationofthefusion
proteinsexpressedinE
coli
Llule1indicate
theSDS-PAGEofthe
proteins
dissolvedinthe
lysis
buffer
before
flowingthrough
th
Ni-NTA
columns;Lane
2indicatestheeluatesofthe
buffer
B:Lsne
3indicatestheeluatesofthebuffer
C;ta/le
4indicatestheeintionsofthebutierD:I..1Ulesfrom5to10indie.ustheeluatesofthebufier
E,respectively.
Theallowindicatesthe
positions
ofthefusion
proteins.
陈其军:结果与分析(四)
第六章实验结果与分析(四)
转基因烟草和拟南芥的获得及功能分析
135S-AtlTLla转基因表达载体的构建
图6-135S.AflTLIa转基因载体的构建流程示意图
Figure
6-1Schemes
ofconstructing
ofⅡansformvectorsfor35S·AdTLla
gcne
为了研究AtITLl,AtITK和AtITL2基因在胁迫反应中的功能并对这些基因的组织
器官定位进行研究,我们首先构建了AtTILla的两种转基因载体:AtlTLla单个基因的
转基因载体和AtlTLla·GFP融合基因的转基因载体。图6-1是35S-A“TLla转基因载
体的构建流程示意图,图6-2显示载体的构建及鉴定的有关结果:pBll21载体及包含
AtlTLla目的片段的pGEM—T载体的酶切、回收以及连接、转化后阳性质粒的PCR鉴
8l
中国农业大学博士学位论文
定及酶切鉴定。经PCR和酶切鉴定为阳性的质粒送交公司测序。序列分析表明,载体
构建正确。
图6-235S-AtlTLIa转基因载体的构建
图A,pBll21转基因载体的双群切(Baml-il和Sacl).泳道I为未酶切质粒对照l泳道2、3、
为酶切质粒的电泳结果.圈B。1"-戴体(带有AflTLIaeDNA)的双酶切(BamHI和Sacl).泳道1为
AtlTLla的PCR产物(对照)t泳道2为T.载体的酶切结果.图C,酶切的转基因载体及酶切后的AtlTLla
cDNA片段回收纯化产物的电泳.泳道1为peIl21筑体酶切大片段的回收产物,泳道2为AtITLIaeDNA
的酶切回收产物.圈D.阳性戴体的PeR鉴定.泳道1为AtlTLIa的PCR扩增产物对照;泳道2为阳
性质粒的PeR扩增结果.图E,阳性载体的酶切鉴定.泳道1为AtlTLla的PCR扩增产物对照;泳道
2为阳性载体的双酶切(BamHl和Sacl)结果;泳道3为未酶切载体对照.
Figure
6-2Schemesofc∞s咖cti鸭oftransformvectorsfor35S-AtITLIa
genes
FigureA,pBIl21
vectorscut
by
BamHlandSacI.LsfleIindicatesthe
original
vectors;Lanes
from2
to4indicatethevectorcutby
BamHIand
Sac.FigureB.thepGEM-T
vectomwithAtITLlainsertionseLI
by
BamHlandSad.Llum1indicatesthePCR
products
ofAtlTLlaascontrol;L8[1c
2indicatesthe
pGEM-T
vectorscutbyBamHl
and
Sacl.FigureC,electrophoresis
ofthe
recovery
products
of
pBll2
(Lane1)andAtlTLlacutbyBamHland
Sacl(Lane2).FigureD’identification
ofpositive
VcccOrs
throug
PCRLsneI
indicatesthePCR
productes
ofAtlTLlaascontrol;kc2indicatesthePCR
productso
positive
vectors.FigureE,identificationofpositive
vectorsthroughellzynk
cutting.Lsne
1indicatesPC
products
ofAtlTLla
control;Lane
2indicatestheposkivevectorscutbyBamHIand
Sacl;Lane3indicates
theintact
positive
Ve.A’tors.
陈其军:结果与分析(四)
235S-AtlTLla.GFP转基因表达载体的构建
Nm
K肌icsimallt
Nospromoter
8岬Ⅻ1磐’5e。l【..................................................一
l
AtITLIa
10I7
KmRsislant
图6-335s.AtrrLl}OFP转基因载体的构建流程示意图
Figure
6-3Schemesofconstructingoftransform
vectorsfor35S.AtITLla.GFPfusion
gcnc
图6-3是35S-AtITLla-GFP转基因载体的构建流程示意图。不同于35S-A',WL;a
转基因载体的构建之处是:AtlTLla的酶切片段来自于PCR产物(3’端引入新的酶
切位点Kpnl)的酶切。图6-4显示载体的构建及鉴定的有关结果:pBll21载体及
AtlTLla目的片段的酶切、回收以及连接、转化后阳性质粒的PCR鉴定及酶切鉴定。
经PCR和酶切鉴定为阳性的质粒送交公司测序。序列分析表明,载体构建正确。
中国农业大学博士学位论文
圈6-435S·AtlTLIa-GFP转基因载体的构建
图A,pBll21·GFP转基因载体的双酶切(BamHl和Kpnl).圈B,pBIl21-GFP载体酶切大片段的
回收产物.图C,AtlTLlacDNA的酶切回收产物.圈D。阳性载体的PCR鉴定.泳道1为阳性质粒的
PCR扩增结果.泳道2为AtITLIa的PCR扩增产物对照.图E-阳性载体的酶切鉴定.泳道1为AUTLIa
的PCR扩增产物对照;泳道2为阳性载体的双酶切(BamHl和Kpnl)结果.
Figure
6-4Schemes
ofconslructing
oflransfurmvectorsfur35S-AtITLIa-GFPfusion
genes
FigureA.pBIl21-GFPvectorscut
by
BamHIand
KpnlFigure
B,electrophoresis
ofthe
recovery
products
of
pBIl21-GFP
cutby
BamI-IIand
Kpnl.Figurec,electrophoresis
of
the
recoveryproducts
of
AflTLlaPCR
productscutby
BamHl
and
Kpnl.FigureD,identificationofpositivevcctorsthmughPCR
LaneIindicat∞thePCR
products
of
positive
vectors;Lane2indic,etes
thePCR
preductesofAtlTLlaa
control;.Figure
Eidentificationof
positivevectorsthrough
cnzymecutting.Lanc
1indicates
PC
products
ofAtlTLlaascontrol;lame
2indicates
thepositive
v∞torscutby
BamHland
Kpnl.
335S制TK转基因表达载体的构建
35S-AtlTK转基因表达载体的构建策略类似于35S-AtlTK转基因表达载体的构建,
两个表达载体所用的酶切pBll21质粒大片段是一样的。AtlTK的RT-PCR扩增产物用
BamHI和Sacl双酶切,构建到表达载体上。经PCR鉴定后送交公司测序。序列分析
表明,载体构建正确。
4超表达AtlTLla的转基因烟草的获得及其功能的初步分析
4.1叶盘法转化烟草
将上述构建好的阳性质粒pBITLla转化LB4404农杆菌株系,获得阳性农杆菌
陈其军:结果与分析(四)
阳性农杆菌经PCR鉴定后用于侵染烟草叶片。烟草转化采用叶盘法,烟草叶片取自无
菌苗。共培养三天后,转至分化培养基(MS培养基+3mg/L
6.BA+0
2mg/L
NAA+100mg/mlKan+500mg/ml
Cb)进行见光分化,约两周以后即可看到愈伤组织
产生,而大部分转化体则可以直接分化出抗性芽。抗性芽生长至2—3cm时,转到生根
培养基(MS培养基+Kan
100mg/ml+Cb500mg/m1)中诱导生根,约两周后即可生
出细嫩小根,逐渐成苗。由于幼苗生根时对卡那霉素非常敏感,此时适当提高Kan的
浓度至100—125mg/ml,可以降低转化体假阳性出现的频率,从而减少后续筛选的工
作量。诱导生根的小苗转移到土壤中繁种。单株收获转基因烟草的种子。
4.2转基因烟草的PCR鉴定
我们首先对转基因烟草进行了PCR鉴定。在30个品系中总共鉴定了8个品系,
其中有7个品系经PCR鉴定为阳性。另一个品系,用不同批次提取的基因组DNA进
行PCR扩增,均表现为阴性结果。图6-5显示其中的3个品系的PCR鉴定结果。
图6.5转基因烟草的PCR鉴定
图A,野生型烟草及3个转基因烟草品系的基因组总DNA.泳道I为野生型,2~4分别为1、
2、3号转基因品系.图B,转基因烟草的PCR鉴定结果.泳道I为野生型,2~4分别为1、2、
号转基因品系,泳道5为Aft'ILia的PCR扩增产物对照.
Figure6-5ldantification
oftransgenic
tobacco
through
PCR
Figure
A,the
gcnomic
DNAsofWTand3transganiclines.Lane1indicatesthe
WT;LsⅢleSfrom
2-4indicatethelines
1,2,3,respectively.FigureB,the
resultsofPCR
amplificationof
transgenic
tobaccoLo/l(:lindicates
theWT,踟∞from2-4intlicatethelineI,2,3,respectively;Lane
indicatestheresultsofPCR
products
ofAtITLlacDNA.
4.3转基因烟草的Westernblot分析
为了搞清楚转基因烟草是否表达AtlTLla蛋白以及表达量如何,我们对转基因烟
草进行了Westernblot分析。结果表明,3个转基因品系有免疫反应信号,而野生型
没有。说明At/TLla在转基因烟草中得到正常表达(图6-6)。
中国农业大学博士学位论文
图6-6转基因烟草的Westernblot分析
泳道l为野生型,2~4分别为Tl·l、T1.2、Tl-3号转基因品系.
Figure
6-6Westernblot
analysis
oftransgenictobaccos
Lane
I
indicates
theWT'Lanesfrom2-4indicatethethree
transgenie
lines
TI-1,TI-2,TI·3
respectively.
4.4转基因烟草T1代种子的Kan抗性分析
为了进一步鉴定转基因烟草。对3个不同的转基因烟草品系的T1代种子进行了
Kan抗性分析(图6-7)。
图6-7转基因烟草的Kan抗性分析
wT为野生型,T1.1、TI.2、T1.3分别为3个转基因品系.
Figure6-7Kan·resistantanalysis
oftransgeniclobacco
Ⅵ几wildtype;T1-1.T1-2andTl-3indicatethethreetransgeniclines.respectively
陈其军:结果与分析(四)
4.5转基因烟草的功能初步分析
我们对转基因烟草在胁迫条件下的表现进行了初步分析。1/4MS培养基上生长7
目的转基因或野生型烟草幼苗转移到含300mmol/LNaCI的1/4MS培养基胁迫处理3
天,之后转移到1/4
MS继续生长。11天后照相(图6—8)。从图6—8中可以看出,与
野生型相比,3个转基因烟草品系对NaCI胁迫处理表现得更为敏感。
图6-8转基因烟草的耐盐性分析
wT为野生型.T1·1、T1.2、”-3分别为3个转基因品系.
Figure
6-8Salt-tolerant
analysisoftransgenlctobacco
v、几wildtype;T1-1.T1·2and”.3indicatethethreetransgeniclines。respectively.
5超表达AtlTLla的转基因拟南芥的获得及其功能的初步分析
将上述构建好的阳性质粒pBITLla转化GV3101农杆菌株系,获得阳性农杆菌,
阳性农杆菌经PCR鉴定后用于侵染拟南芥。拟南芥转化采用真空渗入法。收获拟南芥
T1代种子,在Kan板上筛选抗Kan的阳性苗。图6-9显示阳性苗筛选的部分结果。
pBll
21转基因载体的T-DNA上带有抗Kan的基因,因此基因组中整合了T.DNA
的拟南芥转基因种子能在含有Ken的平板上正常生长,而野生型种子虽能萌发,但幼
苗不能正常生长,直至黄化枯死。将Kan板上正常生长的1周龄苗移栽到土中繁育T2
代种子。Kan板上筛选的每一株T1代阳性苗都作为一个转基因品系看待。单株收获
T2代种子,从中挑选一些品系经Kan板筛选剔除没有Kan抗性的T3代苗,继续进行
繁育。一部分T2代和T3代拟南芥种子用于进行生理功能的分析及其它方面的研究,
同时通过PCR等方法对有关转基因品系进行检测,此部分工作仍在进行中。
中国农业大学博士学位论文
图6-9转基因拟南芥阳性苣的筛选
大约3,000粒”代拟南芥种子铺于含50PgKan和50Ilgcb的MS琼脂板上.图A是7日龄
拟南芥苗;图B是圈A框中部分的放大圈.
Figure
6-9
Screening
for
positiveseedlingsoftransgcoic
Arabidopsis
About3,000
grainsofArabidopsis
were
spread
oRtheMS
agarplatecontaining
50
p.g
Kanand
5
pgCb.Figure
Aindicatesthe7
day
oldseedlings.FigureB
indicatesthema鲷ifiedfigure
ofthe
framed
part
in
Figure
A.
我们对Kan筛选表现为阳性的3个拟南芥转基因品系进行了初步的功能分析。拟
南芥野生型种子及3个拟南芥转基因品系的T2代种子播种于含150mmol/LNaCI的
MS平板上。在生长初期,野生型和转基因品系的表型之间没有可见的差异,4周后,
野生型开始表现变黄,直至枯死.图6—10是在生长43天的拟南芥幼苗。从图中可以
看出,尽管3转基因品系的幼苗在含150mmol/LNaCI的MS平板的生长大大受到抑
制,但比起野生型,3个转基因品系的幼苗仍然具有生活力。初步的实验表明,超表
达AUTLlaCDS的转基因拟南芥耐盐性增强。
陈其军:结果与分析(四)
图6-10转基因拟南芥的耐盐性分析
、^厂r为野生型。T2-1、12.2、T2-3分别为3个T2代的拟南芥转基因品系。
Figure
6-10Salt-tolerant
analysis
oftransgenicAtabidopsis
VVT
wild
type;T2-1.T2-2
andT2-3indicatethethree
transgeniclines.respectively.
陈其军:文献综述
第七章讨论
1编码1,3,4一三磷酸肌醇5/6-激酶类似物的AtlTLl基因具有可变剪接方式
植物的胁迫耐受性是一个涉及多基因的复杂性状,尽管拟南芥整个基冈组的序列
测定已经完成,但对胁迫耐受性状的诸多决定因子进行功能上的鉴定仍然是~个巨大
的挑战。要想阐明复杂的胁迫信号传递网络,需要发现更多的参与胁迫信号转导的新
基因和功能未知的基因,并对他们在胁迫信号传递途径中的功能进行研究。本研究首
次报告1,3,4.三磷酸肌醇5/6.激酶类似物参与植物对逆境胁迫的反应。我们首先利用
mRNA差异显示技术筛选得到一个受盐诱导表达的拟南芥基因,该基因编码1,3,4.三磷
酸肌醇5/6一激酶(以下简称5/6一激酶)类似物,命名为AtlTLI。根据Blast分析及我们
的实验结果,我们发现根据mRNA差异显示技术筛选得到的AtlTLl基因的前体mRNA
在靠近3’端有两种剪接方式。目前我们还不清楚AtlTLl基因前体mRNA的可变剪接
方式的生物学意义。在拟南芥中,79%的核基因(18%的质体和12%的线粒体基因)包括
内含子,预计其它植物的基因也存在类似的情况”3。因此,准确而高效的剪接是植物及其
它真核生物中基因表达调控的关键特性。可变剪接现象的存在是内含子一外显子在结构上
相互作用的结果,是基因表达调控和产生多样性异构体的一个普遍机制。可变剪接能够导
致蛋白活性的修饰或删除,产生完全不同的蛋白活性,改变蛋白在细胞内的定位,影响RNA
的稳定性和翻译效率。尽管在脊椎动物中,有一些著名的可变剪接的例子”4,但高等植物
中可变剪接的例子很少,已知能产生不同功能蛋白的可变剪接的例子更少。发表在今年
plant
cell第4期的一篇文献,报告了促进开花的基因FCA由于可变剪接方式而产生的4种
mRNA的不同功能”5。朱健康实验室通过分析¥os4突变体发现了在盐胁迫耐受性中起
重要作用的SOS4基因,该基因编码VB6激酶,参与VB6的合成。80S4基因也有两种
剪接方式,产生的两种成熟mRNA相差100个碱基。两种转录本的丰度受发育和环境
胁迫因素的不同调控”。我们在对AtlTLl基因的表达进行反向Northern及Northernblot
分析时,均没有发现存在明显的2条杂交带。可能的原因是:由于两种成熟mRNA相
差仅仅76个碱基,在我们的Northernblot分析没有将两者分开;也有可能是只有一种
转录本受诱导表达,至于是AtlTLIa和AtlTLIb两种转录本的哪一种,目前仍无法获知。
Blast分析表明,拟南芥基因组中存在3个编码5/6.激酶类似物的基因:AtlTL,AtlTK
和AtlTL2。我们用RT.PCR的方法克隆了3个基因的CDS并对3个基因的表达进行了
Northernblot分析。结果表明,AtlTLI和AtlTK基因在高盐、低温、干旱胁迫条件下及
91
中国农业大学博士学位论文
ABA处理条件下的表达模式呈现出互补的模式:一盯儿』受高盐和低温诱导,但不受十
早和ABA诱导,而AtlTK主要受干旱和ABA诱导。分析推测的AtlTLI基因的5,启动
了区发现存在ABA不依赖的DRE/CRT顺式作用元件,但不存在对ABA起反应的
G·box和ABRE相关的元件。分析AtlTK推测的基因5’启动子区发现存在对ABA反应
的G-box和ABRE相关的元件,5’启动子区结构特征与我们进行Northern
blot分析发
现的表达模式是一致的。这些结果表明,编码5/6.激酶类似物的拟南芥基因家族的不
同成员分别参与了ABA依赖的和ABA不依赖的的胁迫信号传递途径。AtlTL2基因似
乎不受环境胁迫诱导,提示AtlTL2基因可能参与了其它的信号传递途径。
2516.激酶在植物、哺乳动物甚至原生虫中普遍存在并参与逆境胁迫反应
从植物到哺乳动物,甚至在原生虫均已证实具有编码5,6.激酶的基因”6。人和小牛
脑的5/6一激酶产生的1,3,4,6·四磷酸肌醇(Ins(1,3,4,6)P4)和l,3,4,5.四磷酸肌醇
(1ns(1,3,4,5)^)的比例是3:l;而拟南芥则相反”7。原生虫的5,6.激酶作用于1,3.4.
三磷酸肌醇(Ins(1,3,4)P3)和l,4,5-三磷酸肌醇(Ins(1,4,5)P3)两种底物。当以Ins(1。3,4)P3
为底物时两种产物的比例为1:1,当以Ins(1,4,5)P3为底物时,Ins(1…345)P4是唯一的产
物。最近的研究表明,人的5,6一激酶还具有3,4,5,6.四磷酸肌醇(Ins(3,4,5,6)P4)1-激酶
的活性,即以Ins(3…456)1'4为底物产生lnsP51780而且,令人感兴趣的是小牛脑5,6一激
酶能磷酸化转录因子c-Jun和ATF-2,这是肌醇激酶具有蛋白激酶活性的第一例报告,
在此之前有研究表明以磷脂酰肌醇磷酸为底物的几个激酶具有蛋白激酶的活性”。同
一激酶具有两种活性,可以解释为同一激酶被不同刺激激活产生不同的活性,分解为
不同的信号传递途径1790转录因子c-Jun和ATF-2可被胁迫激活的蛋白激酶所磷酸化,
称为依赖于JNK/MAPK的磷酸化途径。该蛋白激酶属于三个MAPKs亚类中的一类,
在对渗透胁迫,UV射线和其它的胁迫条件反应中激活…o“。5/6.激酶磷酸化受胁迫激
酶激活的转录因子e-Jun和ATF-2,表明5/6.激酶参与了胁迫反应途径。
同样令人感兴趣的是,在纯化小牛脑5/6.激酶过程中,发现COP9信号体和5/6一
激酶共沉淀,可能表明细胞内的5/6一激酶和COP9信号体存在一种相互作用的关系179。
COP9信号体最初是美国耶鲁大学的邓兴旺实验室在研究光形态建成突变体过程中发
现的。当cq矽突变体幼苗生长在暗处时表现出光生长形态学特性即组成性光形态建成
(constitutivephotomorphogenesis)。后来研究发现,COP9蛋白是一个大的蛋白复合
物(COP9信号体)的组成部分“2。COP9信号体由8条亚基组成,在结构组成上与26S
蛋白酶体的盖亚基密切相关”3。COP9复合物在哺乳动物和高等植物中是高度保守的
陈其军:文献综述
184。COP9信号体在细胞信号转导和发育中的分子和生化特性已开始得到阐明。COP9
信弓体和26S蚩白酶体的调控亚基的相似性提示两者在进化起源上密切相关。最近的
研究表明,在植物,哺乳动物和裂殖酵母中COP9信号体在泛素/蛋白酶体途径中发挥
作用185,186,187,188i89,190。在哺乳动物中,组成COP9信号体的亚基GPSl…和JABll92参与
转录因子c.Jun的活性调节。总之,在哺乳动物中,5/6一激酶可能通过和COP9信号体
和JNKJMAPK途径相互作用参与胁迫信号转导。
原生虫的5/6一激酶基因受热击诱导,这再次表明5/6.激酶参与逆境胁迫反应途径
”“”9。我们的研究结果表明,拟南芥中5/6-激酶类似物也参与对逆境胁迫的反应,这
是植物5/6一激酶类似物参与对逆境胁迫反应的首例报告。此外,我们也克隆了编码5/6.
激酶类似物的水稻基因并对其进行了Northern
blot分析,结果同样表明,水稻5/6.激
酶基因受胁迫诱导(资料未显示)。在盐处理的冰革植物中也发现5/6.激酶类似物的存
在(在GenBank上的登录号为BE037040)。
3拟南芥1,3,4-三磷酸肌醇516-激酶类似物在胁迫反应中的可能的作用机制
图7-1Ins(J,3,4)PJ5/6-激酶在胁迫反应中的可能的作用模式
Figure
7-1The
possible
actionmodeoflns(1,3,4)P35/6一kinaseinstress
response
如同哺乳动物5/6.激酶在胁迫信号转导途径中的作用,植物可能通过两个途径参
与胁迫信号转导,即磷酸肌醇信号途径和(或)蛋白激酶级联途径(图7-1)。磷酸肌
醇信号转导途径涉及一系列的磷酸肌醇激酶和磷酸肌醇磷酸酶,磷酸化和去磷酸化各
种口r溶性的肌醇多磷酸盐。磷酸肌醇途径的一个分支点是产生Ins(1,3,4)P3,Ins(1,3,4)P3
93
中国农业火学博士学位论文
被5/6·激酶磷酸化形成Ins(1,3,4,6)P4和lns(1,3,4,5)P4。Ins(1,3,4,6)P4是形成更高级的肌
醇多磷酸(包括其它肌醇四磷酸盐的异构体,肌醇五磷酸,肌醇六磷酸及肌醇焦磷酸)
的第一个中间体”3’”4。InsP5和lnsP6是细胞中含量最丰富的肌醇多磷酸盐,它们在动
物或植物细胞中的功能最近开始得到阐明。例如,在马铃薯保卫细胞中ABA可以引发
]nsP6的快速变化,InsP。可以模拟ABA和细胞内的Ca2+对内向K+整合电流的抑制效
应,InsP6的作用强于IP3,并且这种抑制作用是ca2+依赖的。这些结果提示,lnsP6在
保卫细胞对ABA的生理反应中发挥着重要的作用195o在哺乳动物中,Ins(1,3,4)P3和Ins(1…345)P4可以作为信号物质194,196前者是5/6.
激酶的底物,后者和Ins(1,3,4,6)P4一样是5/6.激酶的产物。在动物中,Ins(1,3,4,5)P4及
其代谢产物ins(1,3,4)P3同IP3一样是较早被发现的肌醇多磷酸。Ins(1,3,4,5)1'4主要是由
IP33.激酶产生。后者是动物中最活跃的肌醇多磷酸激酶。在动物中至少存在3种IP33.
激酶异构体,3种异构体均受钙调素调控,其中的2种还受钙/钙调素.依赖的蛋白激酶
II(CaMKII,Ca2+/calmodulin.dependent
protein
kinaseII))调控。磷脂酶C耦合的受体
被激活后产生IP3,IP3
3.激酶在快速代谢IP3库方面发挥着重要的作用。在lP33.激酶
代谢J玛库过程产生的Ins(1,3,4,5)P4在进化中逐渐获得了功能。最近,lns(1,3,4,5)P4的
生理功能在动物中开始得到阐明1970Ins(1,3,4,5)P4能够被水解IP3的5.磷酸酯酶水解,
但5.磷酸酯酶对lns(1…345)n比对In的亲和性高10倍,最大反应速度Vica。x低100
倍。因此,Ins(1…345m能够保护IP3不被水解,提高IP3的有效性。如果用低剂量的、
促进I^产生的兴奋剂处理细胞,接着清除兴奋剂,短时间后再次用兴奋剂处理细胞,
那么细胞质膜钙内流对第二次处理更敏感。原因是第一次刺激产生的Ins(1,3,4,5)p4比
IP3存留时间更长(因为5.磷酸酯酶对前者作用的VuAx更低)。因此,Ins(1,3,4,5)P4
的水平作为某个早期刺激的一个“记忆体(memory)”而持续存在一段时间。
Ins(1,3,4,5)P4除了能够保护I玛不被水解外,还具有其它方面的功能,例如在内皮细胞
中有直接的证据”8,在神经细胞中有直接”和间接2”的证据,表明Ins(1,3,4,5)P4能够
激活质膜上的钙通道。
最近的研究表明,人的5,6.激酶还具有InsO,4,5,6)P4
1-激酶的活性”8,即以
Ins(3,4,5,6)P4为底物产生InsP5。lns(3,4,5,6)P4在动物表皮细胞中是钙调控c1.通道的抑
制剂。5,6.激酶可以通过将Ins(3,4,5,6)P4磷酸化为InsP5影响Ins(3,4,5,6)P4对钙调控cl_
通道的抑制作用。
综合动植物中肌醇信号传递途径的研究,我们提出516激酶在植物逆境胁迫信号转
陈其军:文献综述
导中的可能的作用机制包括:磷酸化Ins(1,3,4)P3产生的Ins(1,3,4,5)P。保护I^不被水解,
已知IP3参与胁迫信号的传递过程37,148磷酸化Ins(1,3,4)P3产生的Ins(1,3,4,5)P4和
Ins(1,3,4,6)P4,以及磷酸化Ins(3,4,5,6)P4产生的lnsP5,可以促进lnsP6的合成,产生的
InsP6参与保卫细胞对ABA或胁迫信号的反应”5;通过磷酸化Ins(3,4,5,6)P。调控
Ins(3,4,5,6)P一的生理功能(图7-1)。随着更多肌醇多磷酸盐在植物中的功能得到阐明,
编码5/6一激酶类似物的AtlTLl和AtlTK在胁追信号转导途径的作用也将得到阐明。我
们正在从细胞学水平上探讨转基因植物对气孔变化的影响。我们还打算在培养基中添
加能透过细胞膜的Ins(1,3,4)P3替代物伺喂转基因烟草或拟南芥幼苗,研究其在正常或
胁迫条件下细胞学及生理学方面发生的变化。
拟南芥5/6-kinase也可能象哺乳动物5/6一激酶那样通过蛋白激酶级联途径参与胁迫
信号传递途径(图7-1)。因此,有必要研究5/6.激酶是否有蛋白激酶的活性,是否和
COP9信号体或其它蛋白复合物共沉淀。
尽管推测AtlTLI编码的蛋白类似于516-激酶,但AtlTLl是否具有5/6.激酶活性以
及AtlTLl和AtlTK是否象哺乳动物中的5/6.激酶那样具有l一激酶的活性和蛋白激酶的
活性都是值得深入研究的问题。我们构建了AtlTLIa和AtlTK的原核重组表达载体,
得到了重组蛋白,有关工作正在进行中。
4AtlTLl在盐胁迫信号传递途径中的正调控或负调控作用
对转基因烟草进行的初步的功能分析表明,AtlTLla超表达的转基因烟草幼苗对
盐胁迫更敏感。这些研究表明,AtlTLI可能象HOS540那样在ABA不依赖的渗透胁迫
信号传递途径中充当负调控因子的作用。从现有的遗传学研究结果来看,在胁迫信号
传递途径中发现的负调控因子多于正调控因子,例如LOSl,LOS2,HOS5,FIERYl,
ERAI和ABll/2。
另外一种可能是,AtlTLl可能象转录因子ABF3和ABF4那样在ABA依赖的渗
透胁迫信号传递途径中充当正调控因子的作用。彳珊zJ在烟草中的超表达激活或强化
了ABA的信号转导途径。ABF3和ABF4能够与ABA反应元件ABRE特异结合并激
活含ABRE元件的基因表达。ABF3和ABF4超表达的转基因拟南芥除对ABA非常敏
感外,转基因植物也表现出其它方面与ABA信号转导有关的现象。例如,在含100
mmol/lNaCI的培养基中,转基因与野生型及ABA敏感性突变体相比,其种子萌发及
幼苗生长受抑制57
0为了验证第2种可能性,需要对转基因烟草种子进行萌发实验,
中国农业大学博士学位论文
例如比较转基因种子和野生型种子在含100mmol/lNaCI以及在含ABA的MS平板上
的萌发及生长情况。
与烟草对盐胁迫更敏感相反,对转基因拟南芥耐盐性进行的初步分析表明,转基
冈拟南芥对盐胁迫的耐受性大大增强。推测产生上述两种相反结果的可能的原因有:
基因沉默或共抑制;I如的水平和持续时间。可能l^或其它参与胁迫信号转导的肌醇
多磷酸在转基因烟草中过量产生,超出了正常反应许可的范围(包括肌醇信号物质的
水平及持续时间),表现出与加,),J突变体类似的表型。在肛,)'』突变体中,编码肌醇
多磷酸l一酯酶的基因发生突变,该基因在IP3的代谢中起作用。在胁迫处理条件下,
fireryl突变体积累过多的Ⅱ、,导致突变体对胁迫反应更敏感”。转基因拟南芥对盐胁
迫表现出耐性,可以解释为,尽管IP3或其它参与胁迫信号转导的肌醇多磷酸在转基因
拟南芥中的含量增加,但这些信号物质的含量仍在正常反应许可的范围内(或者,这
些信号物质含量的增加,启动了其它不同的代谢IP3的反应机制,导致这些肌醇信号物
质在正常反应许可的范围内),并最终增强植物对逆境胁迫的反应。另外一个可能的
原因是转基因烟草中AtlTLl基因的超表达激活了ABA信号转导途径,导致转基因烟
草幼苗表现出与ABF3和ABF4超表达的转基因拟南芥类似的表型”。而转基因拟南芥
中AtlTLl基因的超表达激活了ABA不依赖的胁迫信号转导途径,最终导致与DREBIA
超表达的转基因拟南芥类似的表型”.我们在下一步的实验中将对转基因烟草及拟南
芥进行详细的研究和分析,以期对AtlTLI基因的生化及生理功能得出更加合理的解释。
陈其军:结论
结论
1利用mRNA差异显示技术筛选到一个受盐诱导的功能未知的基因。该基因编码
l’3,4·三磷酸肌醇5/6-激酶类似物,命名为AtlTLl。AtlTLI基因的前体mRNA有
两种剪接方式,产生的两种mRNA或相应的cDNA被分别命名为AtlTLl口和
AtlTLIb。我们通过mRNA差异显示筛选到的cDNA序列为AtlTLla。拟南芥基因
组中包括AtlTLl在内共有3个基因编码5/6-激酶类似物。其中的一个基因已有文
献报告其编码的蛋白具有5/6-激酶活性,该基因被命名为AtlTK。另一基因同
AtlTLl一样编码5/6.激酶类似物,被命名为AtlTL2。
2扩增并克隆了拟南芥基因组中3个编码5/6-激酶类似物基因的CDS。其中,AtlTLI口
和AtlTK基因的CDS序列与GenBank上登录的序列一致,但AtlTL2的CDS序
列与GenBank上登录的CDS序列有较大的差异。
3对拟南芥基因组中所有3个编码5/6-铡t酶类似物的基因在胁迫条件下的表达进行了
Northernblot分析。结果表明,AtlTLl基因除受盐诱导外,还受低温诱导,但不
受干旱和ABA诱导;高盐、低温、干旱及ABA处理均诱导AtlTK基因的表达,
干旱和ABA对该基因的诱导强于高盐和低温;AtlTL2基因不受胁迫诱导。分析推
测的AtlTLI和AtlTK基因的5’启动子区发现两者均存在不依赖于ABA的
DRE/CRT顺式作用元件,在推测的AtlTK基因的5,启动子区还存在对ABA反应
的G-box和ABRE相关的元件.
4分别构建了AtlTLla和AtlTK的转基因表达载体,并获得了AtlTLla超表达的转
基因烟草和转基因拟南芥.对转基因烟草在胁迫条件下的表现型进行了初步的分
析。结果表明,转基因烟草幼苗对NaCI胁迫更加敏感。对转基因拟南芥在盐胁迫
条件下的表现型也进行了初步的功能分析,结果表明,转基因拟南芥幼苗对NaCI
胁迫的耐受性增强。
5构建了原核表达载体并在大肠杆菌中诱导表达了AtITLla的融合蛋白。利用分离
纯化的融合蛋白制备了抗体。利用制备的抗体对野生型和3个转基因烟草品系进
行了Western
blot分析,结果表明转基因烟草中AtlTLla蛋白得到正常表达。
6克隆了RD29A,RD29B,RDl7,ERDl0,CORl5,COR6.6和K1N1等7个胁迫
诱导基因片段。
97
陈其军:参考文献
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abscisic
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aldehyde
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cataiyzes
theflnat
slep
inabscisicacid
biosynthesis
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domain
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